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蔷薇科物种VQ基因家族的全基因组鉴定及森林草莓中WRKY-VQ互作蛋白的预测

摘要第6-8页
ABSTRACT第8-9页
第一章 文献综述第10-30页
    1 植物转录因子的研究现状第10-15页
        1.1 转录因子的功能结构域第10-11页
        1.2 转录因子的调控机理第11-12页
        1.3 转录因子的功能研究第12-15页
    2 VQ基因家族的研究进展第15-20页
        2.1 植物中VQ基因家族的鉴定和表达分析第15-19页
        2.2 VQ蛋白与WRKY蛋白的互作第19-20页
    3 本研究的目的和意义第20-22页
    参考文献第22-30页
第二章 蔷薇科六个物种VQ基因的鉴定与进化分析第30-40页
    1 材料与方法第31-32页
        1.1 VQ基因的鉴定第31页
        1.2 蔷薇科六个物种VQ基因的序列比对和系统进化树构建第31页
        1.3 非同义替换与同义替换的比率的计算第31-32页
    2 结果与分析第32-36页
        2.1 VQ基因在不同物种中的分布第32页
        2.2 蔷薇科六个物种中VQ基因的鉴定第32-33页
        2.3 蔷薇科六个物种VQ基因家族的系统进化树、分类以及复制事件第33-35页
        2.4 蔷薇科六种物种的VQ基因的选择压第35-36页
    3 讨论第36-38页
    参考文献第38-40页
第三章 VQ基因家族在草莓属六个物种中的微进化第40-56页
    1 材料与方法第41-42页
        1.1 草莓属六个物种的VQ基因的验证第41页
        1.2 序列比对和进化树分析第41页
        1.3 保守基序的分布、motif分析和外显子-内含子结构分析第41-42页
        1.4 非同义替换与同义替换的比率的计算第42页
        1.5 启动子分析第42页
        1.6 森林草莓中VQ基因转录模式的分析第42页
    2 结果与分析第42-48页
        2.1 草莓属六个物种中VQ蛋白的鉴定第42-43页
        2.2 草莓属六个物种的VQ基因家族的系统进化树、分类以及复制事件第43-45页
        2.3 蛋白质序列聚类和结构分析第45-46页
        2.4 草莓属六个物种的VQ基因的选择压第46-47页
        2.5 草莓属六个物种的VQ基因的启动子顺式作用元件的识别第47-48页
        2.6 不同器官和组织中森林草莓VQ基因的表达分析第48页
    3 讨论第48-51页
    参考文献第51-56页
第四章 森林草莓WRKY蛋白和VQ蛋白互作预测第56-70页
    1 材料与方法第57-58页
        1.1 森林草莓WRKY基因的鉴定以及其和VQ基因的识别第57-58页
        1.2 序列比对和系统进化树构建第58页
        1.3 森林草莓中WRKY-VQ互作蛋白的预测第58页
        1.4 相关性分析第58页
    2 结果与分析第58-63页
        2.1 森林草莓中WRKY基因家族的鉴定、进化树的构建以及互作蛋白的预测第59-62页
        2.2 森林草莓中假定WRKY-VQ互作蛋白在不同器官、组织和发育阶段的表达趋势第62-63页
        2.3 相关性分析第63页
    3 讨论第63-65页
    参考文献第65-70页
全文结论第70-72页
主要创新点第72-74页
附录第74-124页
攻读硕士期间发表论文情况第124-126页
致谢第126页

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