| 摘要 | 第6-8页 |
| ABSTRACT | 第8-9页 |
| 符号及缩略词对照表 | 第10-11页 |
| 第一章 文献综述 | 第11-21页 |
| 1. 昆虫病原线虫与共生细菌的共生关系 | 第12-14页 |
| 1.1 携菌作用 | 第12-13页 |
| 1.2 营养作用 | 第13-14页 |
| 1.3 信息作用 | 第14页 |
| 2. microRNA研究概述 | 第14-20页 |
| 2.1 miRNA的生物合成过程 | 第15-17页 |
| 2.1.1 miRNA基因及其转录 | 第15-16页 |
| 2.1.2 pri-miRNA加工 | 第16页 |
| 2.1.3 miRNA转运 | 第16页 |
| 2.1.4 miRNA的成熟 | 第16-17页 |
| 2.1.5 miRNA的作用机制 | 第17页 |
| 2.2 miRNA检测方法 | 第17-19页 |
| 2.2.1 Northern blot | 第18页 |
| 2.2.2 基因芯片 | 第18页 |
| 2.2.3 新一代测序技术检测 | 第18-19页 |
| 2.2.4 实时荧光定量PCR | 第19页 |
| 2.3 miRNA靶基因预测 | 第19-20页 |
| 3. 研究目的和意义 | 第20-21页 |
| 第二章 研究内容 | 第21-49页 |
| 1. 材料与方法 | 第21-30页 |
| 1.1 实验材料 | 第21-22页 |
| 1.1.1 实验样品及培养基 | 第21页 |
| 1.1.2 主要试剂 | 第21-22页 |
| 1.1.3 主要仪器 | 第22页 |
| 1.1.4 数据库及分析软件 | 第22页 |
| 1.2 实验方法 | 第22-30页 |
| 1.2.1 单菌线虫组合DZ-S1和DZ-186的获得及培养 | 第22-23页 |
| 1.2.2 单菌线虫DZ-S1和DZ-186总RNA的提取 | 第23页 |
| 1.2.3 小分子RNA cDNA文库构建 | 第23-26页 |
| 1.2.4 测序数据分析流程 | 第26-27页 |
| 1.2.5 DZ-S1和DZ-186 miRNA差异分析 | 第27-28页 |
| 1.2.7 QRT-PCR分析验证 | 第28-29页 |
| 1.2.8 靶基因预测和功能分析 | 第29-30页 |
| 2. 结果与分析 | 第30-47页 |
| 2.1 总RNA提取与质量检测 | 第30页 |
| 2.2 Solexa文库测序结果生物信息学分析 | 第30-40页 |
| 2.2.1 Solexa文库概述 | 第30-32页 |
| 2.2.2 小RNA分类注释 | 第32-33页 |
| 2.2.3 已知与保守miRNA分析 | 第33-37页 |
| 2.2.4 新候选miRNA分析 | 第37-40页 |
| 2.3 荧光定量PCR | 第40-43页 |
| 2.3.1 miRNA高通量测序结果验证 | 第40-41页 |
| 2.3.2 miRNA在线虫体内表达模式 | 第41-43页 |
| 2.4 靶基因的功能注释 | 第43-46页 |
| 2.4.1 miRNA靶基因的预测 | 第43页 |
| 2.4.2 靶基因功能注释 | 第43-46页 |
| 2.5 miRNA调控的共生机制 | 第46-47页 |
| 3. 讨论 | 第47-49页 |
| 全文总结 | 第49-51页 |
| 参考文献 | 第51-61页 |
| 本文创新之处 | 第61-63页 |
| 攻读学位期间发表的学术论文目录 | 第63-65页 |
| 附录 | 第65-79页 |
| 致谢 | 第79页 |
