摘要 | 第6-7页 |
abstract | 第7-8页 |
第一章 引言 | 第15-25页 |
1.1 弓形虫及弓形虫病简介 | 第15-18页 |
1.2 弓形虫的生活史和形态 | 第18-19页 |
1.3 弓形虫的基因型和分布 | 第19-21页 |
1.4 弓形虫蛋白质组学研究进展 | 第21-23页 |
1.5 弓形虫修饰蛋白质组学研究进展 | 第23-24页 |
1.6 总结与展望 | 第24-25页 |
第二章 弓形虫PRU虫株不同发育期蛋白质组的比较研究 | 第25-53页 |
2.1 材料与方法 | 第25-28页 |
2.1.1 实验动物与虫株 | 第25页 |
2.1.2 仪器设备与试剂 | 第25页 |
2.1.3 样品收集及纯化 | 第25-26页 |
2.1.4 蛋白质提取和定量 | 第26-27页 |
2.1.5 酶解和iTRAQ标记 | 第27页 |
2.1.6 高pH-RP液相分离和反相液质联用RPLC-MS | 第27页 |
2.1.7 蛋白组数据分析 | 第27-28页 |
2.2 结果 | 第28-51页 |
2.2.1 基本鉴定信息 | 第28-29页 |
2.2.2 聚类分析 | 第29-31页 |
2.2.3 蛋白质定量 | 第31-32页 |
2.2.4 GO分析结果 | 第32-42页 |
2.2.5 KEGG分析结果 | 第42-44页 |
2.2.6 蛋白质相互作用STRING分析结果 | 第44-47页 |
2.2.7 毒力因子表达 | 第47-49页 |
2.2.8 核糖体蛋白表达 | 第49-51页 |
2.3 讨论 | 第51-53页 |
第三章 弓形虫PRU虫株和PYS虫株孢子化卵囊蛋白质组的比较研究 | 第53-66页 |
3.1 材料与方法 | 第53-55页 |
3.1.1 实验动物与虫株 | 第53页 |
3.1.2 仪器与设备 | 第53页 |
3.1.3 样品收集及纯化 | 第53页 |
3.1.4 蛋白质提取和定量 | 第53页 |
3.1.5 酶解和iTRAQ标记 | 第53页 |
3.1.6 高pH-RP液相分离和反相液质联用RPLC-MS | 第53-54页 |
3.1.7 蛋白组数据分析 | 第54页 |
3.1.8 荧光定量PCR验证 | 第54-55页 |
3.2 结果 | 第55-65页 |
3.2.1 基本鉴定信息 | 第55-56页 |
3.2.2 聚类分析 | 第56页 |
3.2.3 COG分析 | 第56-57页 |
3.2.4 蛋白质定量 | 第57页 |
3.2.5 GO分析结果 | 第57-61页 |
3.2.6 KEGG分析结果 | 第61页 |
3.2.7 蛋白质相互作用网络 | 第61-62页 |
3.2.8 毒力因子表达 | 第62-63页 |
3.2.9 卵囊壁蛋白表达 | 第63-64页 |
3.2.10 荧光定量PCR验证 | 第64-65页 |
3.3 讨论 | 第65-66页 |
第四章 弓形虫不同虫株速殖子磷酸化修饰蛋白质组的比较研究 | 第66-89页 |
4.1 材料与方法 | 第66-69页 |
4.1.1 实验动物与虫株 | 第66页 |
4.1.2 仪器设备与试剂 | 第66页 |
4.1.3 样品收集及纯化 | 第66-67页 |
4.1.4 蛋白质提取 | 第67页 |
4.1.5 蛋白消化和肽段标记 | 第67-68页 |
4.1.6 磷酸化肽段富集 | 第68页 |
4.1.7 高效液相色谱分离和质谱检测 | 第68页 |
4.1.8 磷酸化修饰蛋白质组数据处理 | 第68页 |
4.1.9 生物信息学分析 | 第68-69页 |
4.2 结果 | 第69-87页 |
4.2.1 基本鉴定信息 | 第69-71页 |
4.2.2 重复性分析 | 第71-73页 |
4.2.3 聚类分析 | 第73-74页 |
4.2.4 蛋白质定量 | 第74-76页 |
4.2.5 基序分析结果 | 第76-78页 |
4.2.6 GO分析结果 | 第78-83页 |
4.2.7 KEGG分析结果 | 第83-85页 |
4.2.8 蛋白质相互作用网络 | 第85-87页 |
4.3 讨论 | 第87-89页 |
第五章 弓形虫不同虫株速殖子乙酰化修饰蛋白质组的比较研究 | 第89-105页 |
5.1 材料与方法 | 第89-91页 |
5.1.1 实验动物与虫株 | 第89页 |
5.1.2 仪器设备与试剂 | 第89页 |
5.1.3 样品收集及纯化 | 第89页 |
5.1.4 蛋白质提取和质控 | 第89-90页 |
5.1.5 蛋白酶解 | 第90页 |
5.1.6 肽段富集 | 第90页 |
5.1.7 高效液相色谱分离和质谱检测 | 第90-91页 |
5.1.8 乙酰化修饰蛋白质组数据处理 | 第91页 |
5.1.9 生物信息学分析 | 第91页 |
5.2 结果 | 第91-104页 |
5.2.1 基本鉴定信息 | 第91-94页 |
5.2.2 重复性分析 | 第94-95页 |
5.2.3 定量分析 | 第95-96页 |
5.2.4 聚类分析 | 第96-97页 |
5.2.5 基序分析结果 | 第97-98页 |
5.2.6 GO分析结果 | 第98-102页 |
5.2.7 KEGG分析结果 | 第102-104页 |
5.3 讨论 | 第104-105页 |
第六章 全文结论 | 第105-106页 |
参考文献 | 第106-119页 |
致谢 | 第119-120页 |
作者简介 | 第120页 |