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Cas9介导的线粒体tRNA核修饰基因gtpbp3,mto1和trmu的斑马鱼突变体构建

摘要第5-7页
Abstract第7-8页
第1章 文献综述第13-36页
    1.1 线粒体基因组及线粒体核修饰基因第13-30页
        1.1.1 线粒体基因组及其突变导致的疾病第13-16页
        1.1.2 线粒体疾病的致病机理第16-19页
        1.1.3 线粒体tRNAs(mt-tRNAs)及其修饰第19-21页
        1.1.4 mt-tRNAs U34位的修饰途径及相应的修饰酶第21-23页
        1.1.5 线粒体tRNAs修饰酶TRMU,GTPBP3和MTO1的结构分析及其互作第23-26页
        1.1.6 GTPBP3,MTO1和TRMU三基因突变导致的人类疾病第26-29页
        1.1.7 线粒体逆行信号通路(Retrograde Pathway)在线粒体相关疾病中的作用第29-30页
    1.2 斑马鱼在研究线粒体疾病中的应用第30-32页
    1.3 Cas9基因修饰技术简介第32-34页
    1.4 课题意义与展望第34-36页
第2章 实验材料第36-42页
    2.1 实验质粒第36-37页
    2.2 实验菌株和斑马鱼第37页
        2.2.1 克隆菌株第37页
        2.2.2 斑马鱼品系第37页
    2.3 实验试剂和仪器第37-42页
        2.3.1 实验试剂第37-38页
        2.3.2 实验试剂的配制第38-40页
        2.3.3 试剂盒第40页
        2.3.4 实验仪器第40-42页
第3章 实验方法第42-62页
    3.1 斑马鱼gtpbp3,mto1和trmu基因的生物信息学预测和克隆第42-47页
        3.1.1 3基因生物信息学分析及同源比对第42页
        3.1.2 斑马鱼中3基因的cDNA克隆第42-44页
        3.1.3 质粒的构建与提取第44-47页
    3.2 gtpbp3,mto1和trmu在斑马鱼中的时空表达分析第47-54页
        3.2.1 时间表达Northern分析第47-49页
        3.2.2 时间表达Western分析第49-51页
        3.2.3 组织特异性表达整体原位杂交(WISH)分析第51-53页
        3.2.4 成鱼器官特异性表达qRT-PCR分析第53-54页
    3.3 gtpbp3,mto1和trmu基因敲除斑马鱼的构建及其鉴定第54-58页
        3.3.1 Cas9-mRNA合成第54-55页
        3.3.2 Guide RNA合成第55-56页
        3.3.3 斑马鱼鱼卵显微注射第56-58页
    3.4 gtpbp3,mto1和trmu基因敲除斑马鱼表型分析及分子生化分析第58-62页
        3.4.1 3基因敲除斑马鱼胚胎、器官发育分析第58-59页
        3.4.2 线粒体tRNA稳态分析第59-61页
        3.4.3 斑马鱼胚胎ATP生成分析第61-62页
第4章 实验结果及讨论第62-77页
    4.1 gtpbp3,mto1和trmu基因生物信息学分析及同源比对第62-66页
    4.2 gtpbp3,mto1和trmu在斑马鱼中的时空表达分析第66-69页
        4.2.1 时间表达Northern分析第66页
        4.2.2 时间表达Western分析第66页
        4.2.3 时空表达整体原位杂交(WISH)分析第66-67页
        4.2.4 成鱼器官特异性表达qRT-PCR分析第67-69页
    4.3 gtpbp3,mto1和trmu基因敲除斑马鱼的筛选和鉴定第69-72页
    4.4 gtpbp3,mto1和trmu基因敲除斑马鱼表型分析及分子生化分析第72-75页
        4.4.1 基因敲除斑马鱼胚胎、器官发育分析第72-73页
        4.4.2 线粒体tRNA-Northern稳态分析第73-74页
        4.4.3 斑马鱼胚胎ATP生成分析第74-75页
    4.5 讨论第75-77页
参考文献第77-80页
致谢第80-81页

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