| 摘要 | 第11-13页 |
| ABSTRACT | 第13-15页 |
| 第一章 文献综述 | 第16-34页 |
| 1 水产养殖中水质恶化 | 第16页 |
| 2 主要水质因子对水产动物的危害 | 第16-18页 |
| 2.1 氨氮对水产动物的影响 | 第16-17页 |
| 2.2 亚硝酸盐氮对水产动物的影响 | 第17-18页 |
| 2.3 其他水质因子对水产动物的影响 | 第18页 |
| 3 水产养殖水质处理方法 | 第18-20页 |
| 3.1 物理方法 | 第18-19页 |
| 3.2 化学方法 | 第19-20页 |
| 3.3 生物修复 | 第20页 |
| 4. 益生菌在水产养殖水质控制上的应用研究进展 | 第20-28页 |
| 4.1 益生菌的定义 | 第20-21页 |
| 4.2 益生菌与养殖水质调控 | 第21-26页 |
| 4.3 益生菌调控养殖水体的作用机理 | 第26-27页 |
| 4.4 调节水质用益生菌使用注意事项 | 第27-28页 |
| 5. 454测序法在环境微生物生态研究中的应用 | 第28-32页 |
| 5.1 454测序技术在海洋微生物研究中的应用 | 第29页 |
| 5.2 454测序技术在活性污泥微生物研究中的应用 | 第29-30页 |
| 5.3 454测序技术在土壤微生物研究中的应用 | 第30-31页 |
| 5.4 454测序技术在肠道微生物研究中的应用 | 第31页 |
| 5.5 454测序技术在其他微生物研究中的应用 | 第31-32页 |
| 6 研究的目的与意义 | 第32-34页 |
| 第二章 枯草芽孢杆菌SC02筛选、鉴定及其脱氮特性 | 第34-52页 |
| 1. 材料与方法 | 第34-44页 |
| 1.1 试剂和培养基 | 第34-35页 |
| 1.2 仪器 | 第35-36页 |
| 1.3 菌株分离与纯化 | 第36-37页 |
| 1.4 菌株鉴定 | 第37-41页 |
| 1.5 脱氮特性研究 | 第41-44页 |
| 1.6 数据的统计与分析 | 第44页 |
| 2 结果与分析 | 第44-49页 |
| 2.1 菌株分离与鉴定 | 第44页 |
| 2.2 SC02的脱氮特性 | 第44-49页 |
| 2.2.1 氮源对SC02脱氮的影响 | 第45-46页 |
| 2.2.2 初始氨氮浓度对SC02脱氮的影响 | 第46页 |
| 2.2.3 初始亚硝酸氮浓度对SC02脱氮的影响 | 第46-47页 |
| 2.2.4 溶解氧对SC02脱氮的影响 | 第47页 |
| 2.2.5 温度对SC02脱氮的影响 | 第47-48页 |
| 2.2.6 pH对SC02脱氮的影响 | 第48-49页 |
| 3 讨论 | 第49-50页 |
| 4 小结 | 第50-52页 |
| 第三章 益生菌对草鱼养殖水体水质的影响 | 第52-60页 |
| 1 材料与方法 | 第52-55页 |
| 1.1 实验材料 | 第52-53页 |
| 1.2 实验设计 | 第53-54页 |
| 1.3 水质测定 | 第54-55页 |
| 1.4 数据的统计与分析 | 第55页 |
| 2 结果与分析 | 第55-57页 |
| 2.1 枯草芽孢杆菌SC02对草鱼养殖水质的影响 | 第55-56页 |
| 2.2 复合益生菌对草鱼养殖水质的影响 | 第56-57页 |
| 3 讨论 | 第57-59页 |
| 4 小结 | 第59-60页 |
| 第四章 益生菌对草鱼养殖环境菌群多样性的影响 | 第60-100页 |
| 第1节 益生菌对草鱼养殖水体菌群多样性的影响 | 第60-89页 |
| 1. 材料与方法 | 第60-62页 |
| 1.1 实验设计 | 第60页 |
| 1.2 样品采集 | 第60页 |
| 1.3 DNA提取 | 第60-61页 |
| 1.4 PCR | 第61页 |
| 1.5 DNA电泳 | 第61页 |
| 1.6 目的片段的割胶回收 | 第61页 |
| 1.7 测序 | 第61-62页 |
| 1.8 测序数据分析 | 第62页 |
| 2. 结果与分析 | 第62-86页 |
| 2.1 枯草芽孢杆菌SC02对草鱼养殖水体菌群结构的影响 | 第62-68页 |
| 2.1.1 稀疏曲线 | 第62-63页 |
| 2.1.2 菌群组成 | 第63-65页 |
| 2.1.3 共享菌 | 第65-68页 |
| 2.2 施氏假单胞菌F1M对草鱼养殖水体菌群结构的影响 | 第68-77页 |
| 2.2.1 稀疏曲线 | 第68页 |
| 2.2.2 菌群组成 | 第68-71页 |
| 2.2.3 共享菌 | 第71-76页 |
| 2.2.4 功能菌群 | 第76-77页 |
| 2.3 复合菌对草鱼养殖水体菌群多样性的影响 | 第77-86页 |
| 2.3.1 稀疏曲线 | 第77页 |
| 2.3.2 菌群组成 | 第77-80页 |
| 2.3.3 共享菌 | 第80-85页 |
| 2.3.4 功能菌群 | 第85-86页 |
| 3. 讨论 | 第86-89页 |
| 4 小结 | 第89页 |
| 第2节 益生菌对草鱼养殖沉积物菌群多样性的影响 | 第89-100页 |
| 1. 材料与方法 | 第91页 |
| 1.1 实验设计 | 第91页 |
| 1.2 DNA提取 | 第91页 |
| 1.3 PCR | 第91页 |
| 1.4 DNA电泳 | 第91页 |
| 1.5 目的片段的割胶回收 | 第91页 |
| 1.6 454测序 | 第91页 |
| 1.7 454数据分析 | 第91页 |
| 2. 结果与分析 | 第91-98页 |
| 2.1 稀疏曲线 | 第91-92页 |
| 2.2 菌群组成 | 第92-94页 |
| 2.3 共享菌群 | 第94-97页 |
| 2.4 功能菌群 | 第97-98页 |
| 3 讨论 | 第98-99页 |
| 4 小结 | 第99-100页 |
| 第五章 益生菌对草鱼免疫和肠道菌群的影响 | 第100-118页 |
| 1 材料与方法 | 第100-106页 |
| 1.1 样品采集 | 第100-101页 |
| 1.2 荧光定量PCR | 第101-104页 |
| 1.2.1 RNA提取 | 第101页 |
| 1.2.2 反转录 | 第101-102页 |
| 1.2.3 荧光定量PCR | 第102-104页 |
| 1.2.4 基因表达率的分析处理 | 第104页 |
| 1.3 肝脏和肠粘膜抗氧化指标的测定 | 第104-105页 |
| 1.3.1 组织和肠粘膜匀浆的制备 | 第104-105页 |
| 1.3.2 测定指标 | 第105页 |
| 1.3.3 测定方法及酶活力定义 | 第105页 |
| 1.4 454测序 | 第105-106页 |
| 1.5 结果处理与分析 | 第106页 |
| 2 结果与分析 | 第106-114页 |
| 2.1 免疫相关基因表达 | 第106-107页 |
| 2.2 复合菌对草鱼抗氧化功能的影响 | 第107-109页 |
| 2.2.1 复合菌对草鱼肝脏抗氧化功能的影响 | 第107-108页 |
| 2.2.2 复合菌对草鱼肠粘膜抗氧化功能的影响 | 第108-109页 |
| 2.3 肠道菌群结构分析 | 第109-114页 |
| 2.3.1 菌群组成 | 第109-111页 |
| 2.3.2 共享菌分析 | 第111-113页 |
| 2.3.3 功能菌分析 | 第113-114页 |
| 3 讨论 | 第114-117页 |
| 4 小结 | 第117-118页 |
| 第六章 主要结论与创新点 | 第118-120页 |
| 1 主要结论 | 第118页 |
| 2 创新点 | 第118页 |
| 3 研究展望 | 第118-120页 |
| 参考文献 | 第120-142页 |
| 附录 | 第142-144页 |
| 致谢 | 第144-146页 |
| 作者简历及取得的科研成果 | 第146页 |
