摘要 | 第4-6页 |
Abstract | 第6-7页 |
目录 | 第8-10页 |
符号说明 | 第10-12页 |
1 前言 | 第12-15页 |
2 材料与方法 | 第15-28页 |
2.1 材料 | 第15-19页 |
2.1.1 实验材料 | 第15-16页 |
2.1.2 主要试剂 | 第16-17页 |
2.1.3 主要仪器 | 第17-18页 |
2.1.4 主要试剂配制 | 第18-19页 |
2.2 方法 | 第19-28页 |
2.2.1 实验技术路线 | 第19-20页 |
2.2.2 运用SAM软件筛选肝癌差异表达基因 | 第20页 |
2.2.3 确定差异表达lncRNA | 第20页 |
2.2.4 差异表达lncRNA聚类分析 | 第20-21页 |
2.2.5 运用DAVID在线软件,对表达差异lncRNA进行功能FunctionalAnnotation Clustering | 第21页 |
2.2.6 肝癌组织标本收集及石蜡切片制备 | 第21页 |
2.2.7 组织总RNA的提取 | 第21-22页 |
2.2.8 RNA纯度鉴定及浓度检测 | 第22页 |
2.2.9 RNA完整性鉴定 | 第22-23页 |
2.2.10 总RNA逆转录反应 | 第23页 |
2.2.11 荧光定量PCR反应检测AFAP1-AS1的表达 | 第23-25页 |
2.2.12 原位杂交 | 第25-27页 |
2.2.13 AFAP1-AS1作为肿瘤淋巴结转移分子标志物的有效评估 | 第27页 |
2.2.14 统计学方法 | 第27-28页 |
3 结果 | 第28-40页 |
3.1 肝癌lncRNA差异表达谱的构建 | 第28-30页 |
3.2 肝癌差异表达lncRNA聚类分析 | 第30-31页 |
3.3 DAVID在线软件Functional Annotation Clustering | 第31-32页 |
3.4 Real-time PCR检测AFAP1-AS1的表达 | 第32-35页 |
3.4.1 RNA完整性鉴定 | 第32-33页 |
3.4.2 Real-time RCR检测AFAP1-ASl的表达 | 第33-34页 |
3.4.3 实时荧光定量PCR检测肝癌中AFAF1-AS1的表达 | 第34-35页 |
3.5 组织微阵列初步筛查AFAP1-AS1在消化系统肿瘤组织中的表达 | 第35-37页 |
3.6 原位杂交进一步检测AFAP1-AS1在肝癌中的表达 | 第37-38页 |
3.7 AFAP1-AS1与肝癌临床病理特征的关系 | 第38页 |
3.8 AFAP1-AS1作为肝癌转移分子标志物的有效性评估 | 第38-40页 |
4 讨论 | 第40-44页 |
4.1 肝癌lncRNA差异表达谱构建的效果评价 | 第40-41页 |
4.2 差异表达lncRNA功能分析及应用价值 | 第41页 |
4.3 AFAP1-AS1功能初步验证 | 第41-42页 |
4.4 AFAP1-AS1作为肝癌转移诊断分子标志物的评价 | 第42页 |
4.5 AFAP1-AS1功能机制的探讨 | 第42-43页 |
总结 | 第43-44页 |
5 结论 | 第44-45页 |
参考文献 | 第45-50页 |
综述 | 第50-61页 |
参考文献 | 第56-61页 |
攻读学位期间主要的研究成果 | 第61-62页 |
致谢 | 第62页 |