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肝癌长链非编码RNA差异表达谱构建及AFAP1-AS1功能初步验证

摘要第4-6页
Abstract第6-7页
目录第8-10页
符号说明第10-12页
1 前言第12-15页
2 材料与方法第15-28页
    2.1 材料第15-19页
        2.1.1 实验材料第15-16页
        2.1.2 主要试剂第16-17页
        2.1.3 主要仪器第17-18页
        2.1.4 主要试剂配制第18-19页
    2.2 方法第19-28页
        2.2.1 实验技术路线第19-20页
        2.2.2 运用SAM软件筛选肝癌差异表达基因第20页
        2.2.3 确定差异表达lncRNA第20页
        2.2.4 差异表达lncRNA聚类分析第20-21页
        2.2.5 运用DAVID在线软件,对表达差异lncRNA进行功能FunctionalAnnotation Clustering第21页
        2.2.6 肝癌组织标本收集及石蜡切片制备第21页
        2.2.7 组织总RNA的提取第21-22页
        2.2.8 RNA纯度鉴定及浓度检测第22页
        2.2.9 RNA完整性鉴定第22-23页
        2.2.10 总RNA逆转录反应第23页
        2.2.11 荧光定量PCR反应检测AFAP1-AS1的表达第23-25页
        2.2.12 原位杂交第25-27页
        2.2.13 AFAP1-AS1作为肿瘤淋巴结转移分子标志物的有效评估第27页
        2.2.14 统计学方法第27-28页
3 结果第28-40页
    3.1 肝癌lncRNA差异表达谱的构建第28-30页
    3.2 肝癌差异表达lncRNA聚类分析第30-31页
    3.3 DAVID在线软件Functional Annotation Clustering第31-32页
    3.4 Real-time PCR检测AFAP1-AS1的表达第32-35页
        3.4.1 RNA完整性鉴定第32-33页
        3.4.2 Real-time RCR检测AFAP1-ASl的表达第33-34页
        3.4.3 实时荧光定量PCR检测肝癌中AFAF1-AS1的表达第34-35页
    3.5 组织微阵列初步筛查AFAP1-AS1在消化系统肿瘤组织中的表达第35-37页
    3.6 原位杂交进一步检测AFAP1-AS1在肝癌中的表达第37-38页
    3.7 AFAP1-AS1与肝癌临床病理特征的关系第38页
    3.8 AFAP1-AS1作为肝癌转移分子标志物的有效性评估第38-40页
4 讨论第40-44页
    4.1 肝癌lncRNA差异表达谱构建的效果评价第40-41页
    4.2 差异表达lncRNA功能分析及应用价值第41页
    4.3 AFAP1-AS1功能初步验证第41-42页
    4.4 AFAP1-AS1作为肝癌转移诊断分子标志物的评价第42页
    4.5 AFAP1-AS1功能机制的探讨第42-43页
    总结第43-44页
5 结论第44-45页
参考文献第45-50页
综述第50-61页
    参考文献第56-61页
攻读学位期间主要的研究成果第61-62页
致谢第62页

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