| 摘要 | 第3-4页 |
| ABSTRACT | 第4-5页 |
| 1 绪论 | 第8-16页 |
| 1.1 引言 | 第8页 |
| 1.2 后基因组时代的生物信息分析 | 第8-11页 |
| 1.2.1 生物信息学的产生与发展 | 第8-9页 |
| 1.2.2 生物信息学在基因组研究中的应用 | 第9-11页 |
| 1.3 课题的研究背景 | 第11-14页 |
| 1.3.1 合成生物学 | 第11-12页 |
| 1.3.2 必需基因与非必需基因简介 | 第12页 |
| 1.3.3 必需基因的实验鉴定技术现状 | 第12-13页 |
| 1.3.4 必需基因的理论预测研究现状 | 第13-14页 |
| 1.4 课题的研究意义 | 第14页 |
| 1.5 本课题主要思路及研究目的与内容 | 第14-15页 |
| 1.6 本章小结 | 第15-16页 |
| 2 蛋白质亚细胞定位特性分析 | 第16-26页 |
| 2.1 蛋白质亚细胞定位特性 | 第16-18页 |
| 2.1.1 亚细胞定位数据库的介绍 | 第16-17页 |
| 2.1.2 亚细胞在线预测服务器的介绍 | 第17-18页 |
| 2.2 材料和方法 | 第18-21页 |
| 2.2.1 数据获取 | 第18-20页 |
| 2.2.2 选择预测蛋白质定位的工具 | 第20-21页 |
| 2.3 结果与分析 | 第21-24页 |
| 2.4 结论与讨论 | 第24-25页 |
| 2.5 本章小结 | 第25-26页 |
| 3 密码子适应指数(CAI)特性分析 | 第26-40页 |
| 3.1 密码子适应指数 | 第26-29页 |
| 3.1.1 密码子使用偏性 | 第26-28页 |
| 3.1.2 密码子适应指数(CAI)的相关应用 | 第28页 |
| 3.1.3 必需基因与基因表达水平的关系 | 第28-29页 |
| 3.2 材料与方法 | 第29-34页 |
| 3.2.1 数据获取 | 第29页 |
| 3.2.2 密码子适应指数(CAI)的计算步骤 | 第29-32页 |
| 3.2.3 差异显著性检验 | 第32-33页 |
| 3.2.4 密码子适应指数(CAI)分布拟合 | 第33-34页 |
| 3.3 结果与分析 | 第34-37页 |
| 3.3.1 密码子适应指数的均值 | 第34页 |
| 3.3.2 密码子适应指数的分布 | 第34-35页 |
| 3.3.3 不同表达水平的比较 | 第35-37页 |
| 3.4 结论与讨论 | 第37-38页 |
| 3.5 本章小结 | 第38-40页 |
| 4 在分组码模型下的序列分析 | 第40-54页 |
| 4.1 基于纠错编码理论的序列分析 | 第40-43页 |
| 4.1.1 编码通信系统与生物信息系统的共通性及模型 | 第40-42页 |
| 4.1.2 线性分组码的编码 | 第42-43页 |
| 4.2 材料和方法 | 第43-45页 |
| 4.2.1 数据获取 | 第43页 |
| 4.2.2 DNA 序列的数值映射 | 第43页 |
| 4.2.3 信息单元 | 第43页 |
| 4.2.4 平均码距的计算步骤 | 第43-45页 |
| 4.3 结果与分析 | 第45-52页 |
| 4.4 结论与讨论 | 第52-53页 |
| 4.5 本章小结 | 第53-54页 |
| 5 总结与展望 | 第54-56页 |
| 5.1 工作总结 | 第54-55页 |
| 5.2 工作展望 | 第55-56页 |
| 致谢 | 第56-57页 |
| 参考文献 | 第57-62页 |
| 附录 | 第62页 |
| A. 作者在攻读硕士学位期间发表的论文目录 | 第62页 |
| B. 作者在攻读硕士学位期间参加的科研项目 | 第62页 |