摘要 | 第4-5页 |
Abstract | 第5页 |
1 前言 | 第8-15页 |
1.1 条斑紫菜概况 | 第8-11页 |
1.1.1 条斑紫菜 | 第8-9页 |
1.1.2 生活史 | 第9-10页 |
1.1.3 地理分布和自然生活环境 | 第10页 |
1.1.4 条斑紫菜的价值 | 第10-11页 |
1.2 PHB 蛋白研究进展 | 第11-13页 |
1.3 生物信息学研究进展 | 第13-14页 |
1.3.1 生物信息学的发展 | 第13-14页 |
1.3.2 生物信息学研究内容 | 第14页 |
1.4 本研究目的、内容和意义 | 第14-15页 |
2 PHB 基因的克隆 | 第15-30页 |
2.1 实验材料 | 第15-18页 |
2.1.1 实验材料 | 第15页 |
2.1.2 试剂 | 第15页 |
2.1.3 实验仪器 | 第15-16页 |
2.1.4 实验溶液与培养基的配制 | 第16-18页 |
2.2 实验方法 | 第18-23页 |
2.2.1 条斑紫菜总 RNA 的提取 | 第18-19页 |
2.2.2. 条斑紫菜总 RNA 的纯化 | 第19-20页 |
2.2.3 PyPHB 基因的克隆 | 第20-23页 |
2.3 实验结果与分析 | 第23-29页 |
2.3.1 PyPHB 基因 EST 拼接结果 | 第23-24页 |
2.3.2 条斑紫菜总 RNA 电泳检测 | 第24-25页 |
2.3.3 克隆 EST 拼接片段电泳检测 | 第25页 |
2.3.4 菌液 PCR 阳性克隆检测 | 第25-26页 |
2.3.5 测序结果 | 第26-27页 |
2.3.6 开放阅读框 ORF 确认 | 第27-29页 |
2.3.7 PHB 基因 BLASTX 相似性搜索 | 第29页 |
2.4 本章小结 | 第29-30页 |
3 PyPHB 基因生物信息学分析 | 第30-46页 |
3.1 实验方法 | 第30页 |
3.2 PyPHB 蛋白氨基酸序列分析 | 第30-41页 |
3.2.1 PyPHB 蛋白结构域确定与分析 | 第30-33页 |
3.2.2 PyPHB 蛋白的理化性质 | 第33-34页 |
3.2.3 PyPHB 蛋白亲水性、疏水性分析 | 第34-35页 |
3.2.4 PyPHB 蛋白二级结构预测分析 | 第35-36页 |
3.2.5 PyPHB 蛋白质的亚细胞定位 | 第36-37页 |
3.2.6 PyPHB 蛋白跨膜性预测分析 | 第37-38页 |
3.2.7 PyPHB 蛋白信号肽预测分析 | 第38-39页 |
3.2.8 PyPHB 蛋白功能位点预测分析 | 第39-40页 |
3.2.9 PyPHB 蛋白磷酸化修饰位点预测分析 | 第40-41页 |
3.3 基于 PyPHB 氨基酸序列的系统进化分析 | 第41-45页 |
3.4 本章小结 | 第45-46页 |
结论 | 第46-48页 |
参考文献 | 第48-52页 |
攻读硕士学位期间发表学术论文情况 | 第52-53页 |
致谢 | 第53-54页 |