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条斑紫菜PHB基因克隆及生物信息学分析

摘要第4-5页
Abstract第5页
1 前言第8-15页
    1.1 条斑紫菜概况第8-11页
        1.1.1 条斑紫菜第8-9页
        1.1.2 生活史第9-10页
        1.1.3 地理分布和自然生活环境第10页
        1.1.4 条斑紫菜的价值第10-11页
    1.2 PHB 蛋白研究进展第11-13页
    1.3 生物信息学研究进展第13-14页
        1.3.1 生物信息学的发展第13-14页
        1.3.2 生物信息学研究内容第14页
    1.4 本研究目的、内容和意义第14-15页
2 PHB 基因的克隆第15-30页
    2.1 实验材料第15-18页
        2.1.1 实验材料第15页
        2.1.2 试剂第15页
        2.1.3 实验仪器第15-16页
        2.1.4 实验溶液与培养基的配制第16-18页
    2.2 实验方法第18-23页
        2.2.1 条斑紫菜总 RNA 的提取第18-19页
        2.2.2. 条斑紫菜总 RNA 的纯化第19-20页
        2.2.3 PyPHB 基因的克隆第20-23页
    2.3 实验结果与分析第23-29页
        2.3.1 PyPHB 基因 EST 拼接结果第23-24页
        2.3.2 条斑紫菜总 RNA 电泳检测第24-25页
        2.3.3 克隆 EST 拼接片段电泳检测第25页
        2.3.4 菌液 PCR 阳性克隆检测第25-26页
        2.3.5 测序结果第26-27页
        2.3.6 开放阅读框 ORF 确认第27-29页
        2.3.7 PHB 基因 BLASTX 相似性搜索第29页
    2.4 本章小结第29-30页
3 PyPHB 基因生物信息学分析第30-46页
    3.1 实验方法第30页
    3.2 PyPHB 蛋白氨基酸序列分析第30-41页
        3.2.1 PyPHB 蛋白结构域确定与分析第30-33页
        3.2.2 PyPHB 蛋白的理化性质第33-34页
        3.2.3 PyPHB 蛋白亲水性、疏水性分析第34-35页
        3.2.4 PyPHB 蛋白二级结构预测分析第35-36页
        3.2.5 PyPHB 蛋白质的亚细胞定位第36-37页
        3.2.6 PyPHB 蛋白跨膜性预测分析第37-38页
        3.2.7 PyPHB 蛋白信号肽预测分析第38-39页
        3.2.8 PyPHB 蛋白功能位点预测分析第39-40页
        3.2.9 PyPHB 蛋白磷酸化修饰位点预测分析第40-41页
    3.3 基于 PyPHB 氨基酸序列的系统进化分析第41-45页
    3.4 本章小结第45-46页
结论第46-48页
参考文献第48-52页
攻读硕士学位期间发表学术论文情况第52-53页
致谢第53-54页

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