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霍乱弧菌MARTX毒素RID效应蛋白催化Rho家族小G蛋白长链脂肪酰基化修饰的分子机制

致谢第5-6页
摘要第6-8页
Abstract第8-9页
常用缩写汇总第18-19页
1 引言第19-46页
    1.1 霍乱弧菌的研究现状第19-24页
        1.1.1 霍乱弧菌的发现与分类第19页
        1.1.2 霍乱弧菌的生活史第19-20页
        1.1.3 霍乱弧菌的基因组第20-21页
        1.1.4 霍乱弧菌的致病性第21-24页
    1.2 创伤弧菌研究现状第24页
    1.3 MARTX毒素第24-31页
        1.3.1 MARTX毒素的产生与分泌第25-27页
        1.3.2 MARTX毒素的生物学功能第27页
        1.3.3 MARTX毒素的结构和组成第27-31页
    1.4 MART毒素RID效应蛋白第31-35页
        1.4.1 RID的发现第31-33页
        1.4.2 RID的组成第33-35页
    1.5 Rho家族小G蛋白研究现状第35-45页
        1.5.1 RAS家族小G蛋白分类第35-36页
        1.5.2 Rho家族小G蛋白的分类与特征第36-41页
        1.5.3 Rho家族小G蛋白C末端多碱性区域的功能第41-42页
        1.5.4 Rho家族小G蛋白在细菌感染中是很多毒素与效应因子的靶点第42-45页
    1.6 本研究的研究意义第45-46页
2 材料与方法第46-65页
    2.1 实验材料与试剂第46-47页
    2.2 实验方法第47-65页
        2.2.1 载体构建第47-52页
        2.2.2 蛋白表达与纯化第52页
        2.2.3 免疫印迹第52-53页
        2.2.4 细胞转染第53-54页
        2.2.5 免疫共沉淀第54页
        2.2.6 酵母双杂交实验第54页
        2.2.7 等温滴定量热实验第54-55页
        2.2.8 RID体外修饰细胞裂解液中的Rac1实验第55页
        2.2.9 GDI/PBD Pull-down实验第55-56页
        2.2.10 膜定位实验第56页
        2.2.11 蛋白结晶和结构分析第56-57页
        2.2.12 体外重组蛋白的脂肪酰基化实验第57-58页
        2.2.13 带炔烃基团的脂肪酸(alk-16)代谢标记HEK 293T细胞第58-59页
        2.2.14 LFN-RID蛋白导入细胞后对Rac1修饰实验第59页
        2.2.15 YopT切割Rac1 C末端实验第59页
        2.2.16 质谱分析第59-60页
        2.2.17 异戊烯化Rac1 LS蛋白的制备第60页
        2.2.18 酶动力学参数测定第60-61页
        2.2.19 PAK1激活实验第61页
        2.2.20 GEF实验第61-62页
        2.2.21 构建霍乱弧菌和创伤弧菌的突变型菌株第62页
        2.2.22 细胞ROS水平测定第62-63页
        2.2.23 细胞吞噬实验第63页
        2.2.24 细胞迁移能力检测实验第63-64页
        2.2.25 动物实验第64-65页
3 结果与分析第65-106页
    3.1 RID破坏宿主细胞肌动蛋白骨架第65页
    3.2 RID直接作用于Rac1第65-69页
    3.3 RID修饰并失活Rac1第69-73页
        3.3.1 RID在体内和体外均修饰Rac1第69-70页
        3.3.2 RID修饰Rac1破坏了Rac1在细胞内的循环第70-73页
    3.4 RID结构与酰基转移酶相似第73-80页
        3.4.1 RID的三维结构第73-78页
        3.4.2 RID催化域同源结构比较第78-80页
    3.5 RID是一个作用于Rac1的长链脂肪酰基转移酶第80-85页
        3.5.1 RID和棕榈酰辅酶A有相互作用第80-81页
        3.5.2 RID在细胞内脂肪酰基化Rac1第81-82页
        3.5.3 RID体外脂肪酰基化Rac1第82-85页
        3.5.4 RID在感染过程中脂肪酰基化Rac1第85页
    3.6 RID修饰Rac1 C端多碱性区域的赖氨酸残基第85-90页
    3.7 RID脂肪酰基化Rho家族小G蛋白的其他成员第90-95页
        3.7.1 RID脂肪酰基化Rac家族小G蛋白第90-91页
        3.7.2 RID对Rho家族小G蛋白其他成员RhoA、Cdc42的脂肪酰基化第91-93页
        3.7.3 RID对其它也具有C末端多碱性区域的小G蛋白的修饰情况第93-95页
    3.8 创伤弧菌RID也具有脂肪酰基转移酶活性第95-98页
    3.9 RID对Rac1的脂肪酰基化抑制鸟嘌呤核苷酸交换因子活化Rac1第98-99页
    3.10 经RID脂肪酰基化修饰的Rac1无法激活下游PAK1激酶第99-101页
    3.11 RID抑制了由Rac1介导的宿主免疫吞噬作用、细胞迁移和抗菌氧自由基的产生第101-104页
        3.11.1 RID在霍乱弧菌感染中抑制细胞吞噬作用第101-103页
        3.11.2 RID在霍乱弧菌感染中抑制细胞迁移第103页
        3.11.3 RID在霍乱弧菌感染中抑制抗菌氧自由基的产生第103-104页
    3.12 RID在创伤弧菌感染老鼠过程中是主要的毒力因子第104-106页
4 讨论第106-109页
    4.1 结论第106页
    4.2 讨论与展望第106-109页
参考文献第109-122页
作者简历第122页

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