| 摘要 | 第3-5页 |
| ABSTRACT | 第5-7页 |
| 1 绪论 | 第11-19页 |
| 1.1 引言 | 第11页 |
| 1.2 黄龙病 | 第11-13页 |
| 1.2.1 柑橘黄龙病病原菌 | 第11-12页 |
| 1.2.2 黄龙病发生危害及治虫防病 | 第12-13页 |
| 1.3 内生细菌 | 第13-15页 |
| 1.3.1 植物内生细菌 | 第13-14页 |
| 1.3.2 柑橘内生细菌 | 第14页 |
| 1.3.3 黄皮内生细菌 | 第14-15页 |
| 1.4 研究方法 | 第15-16页 |
| 1.4.1 变性梯度凝胶电泳(DGGE) | 第15页 |
| 1.4.2 扩增核糖体 rDNA 限制性分析(ARDRA) | 第15-16页 |
| 1.5 研究目的、内容及技术路线 | 第16-17页 |
| 1.5.1 研究目的 | 第16页 |
| 1.5.2 研究内容 | 第16-17页 |
| 1.5.3 技术路线 | 第17页 |
| 1.6 本研究的创新点 | 第17-19页 |
| 2 柑橘黄龙病罹病植株显症差异组织内生细菌群落结构分析 | 第19-36页 |
| 2.1 材料与仪器 | 第19-20页 |
| 2.1.1 实验材料 | 第19页 |
| 2.1.2 主要仪器设备 | 第19-20页 |
| 2.1.3 主要试剂及耗材 | 第20页 |
| 2.2 实验方法 | 第20-29页 |
| 2.2.1 样品表面消毒 | 第20-21页 |
| 2.2.2 样品内生细菌总 DNA 的提取 | 第21页 |
| 2.2.3 扩增并回收目的片段 | 第21-22页 |
| 2.2.4 连接与转化 | 第22-23页 |
| 2.2.5 筛选阳性克隆 | 第23页 |
| 2.2.6 制备标准品 | 第23-24页 |
| 2.2.7 建立标准曲线 | 第24页 |
| 2.2.8 qPCR 检测黄龙病菌的量 | 第24页 |
| 2.2.9 DGGE 样品制备 | 第24-26页 |
| 2.2.10 DGGE 电泳分析 | 第26-27页 |
| 2.2.11 染色 | 第27-28页 |
| 2.2.12 回收 DGGE 分离条带 | 第28页 |
| 2.2.13 16S rDNA 片段的 PCR 再扩增 | 第28页 |
| 2.2.14 qPCR 检测 DGGE 优势菌及总细菌 | 第28-29页 |
| 2.3 结果和分析 | 第29-34页 |
| 2.3.1 不同显症状况及组织中黄龙病菌定量检测 | 第29-30页 |
| 2.3.2 内生细菌 16S rDNA V5-V9 扩增片段 | 第30页 |
| 2.3.3 内生细菌 16S rDNA V6-V8 扩增片段 | 第30-31页 |
| 2.3.4 DGGE 图谱及条带序列分析 | 第31-33页 |
| 2.3.5 不同组织中优势菌及总细菌的定量 | 第33-34页 |
| 2.3.6 黄龙病菌、粘质沙雷氏菌和总细菌间的相关性 | 第34页 |
| 2.4 小结 | 第34-36页 |
| 3 黄皮内生细菌的分离及功能鉴定 | 第36-54页 |
| 3.1 材料与仪器 | 第36-38页 |
| 3.1.2 主要实验设备 | 第36页 |
| 3.1.3 主要试剂及耗材 | 第36页 |
| 3.1.4 培养基 | 第36-38页 |
| 3.2 研究方法 | 第38-43页 |
| 3.2.1 样品表面消毒处理 | 第38页 |
| 3.2.2 内生细菌分离纯化 | 第38页 |
| 3.2.3 黄皮内生菌生理生化鉴定 | 第38-39页 |
| 3.2.4 黄皮可培养内生细菌分子种属鉴定 | 第39-40页 |
| 3.2.5 ARDRA 分析黄皮内生细菌 | 第40-41页 |
| 3.2.6 评价 16S rDNA 克隆文库 | 第41-42页 |
| 3.2.7 测定菌株产生 IAA（吲哚-3-乙酸）的能力 | 第42页 |
| 3.2.8 测定菌株抗生素合成能力 | 第42页 |
| 3.2.9 测定菌株自生固氮的能力 | 第42页 |
| 3.2.10 测定菌株 1-氨基环丙烷-1-羧酸脱氨酶的合成能力 | 第42页 |
| 3.2.11 测定合成含铁载体的能力 | 第42-43页 |
| 3.2.12 测定淀粉水解能力 | 第43页 |
| 3.2.13 测定蛋白酶活力 | 第43页 |
| 3.3 结果与分析 | 第43-53页 |
| 3.3.1 黄皮可培养内生细菌分离培养 | 第43页 |
| 3.3.2 黄皮可培养内生细菌的 16S rDNA 高变区扩增 | 第43-44页 |
| 3.3.3 阳性克隆的筛选 | 第44页 |
| 3.3.4 黄皮可培养内生细菌 16S rDNA 序列比对结果 | 第44-47页 |
| 3.3.5 黄皮内生细菌 16S rDNA V5-V9 高变区 | 第47页 |
| 3.3.6 阳性克隆的筛选 | 第47-48页 |
| 3.3.7 内生细菌的酶切分析 | 第48页 |
| 3.3.8 操作分类单元测序情况 | 第48-51页 |
| 3.3.9 16S rDNA 克隆文库的充分性分析 | 第51页 |
| 3.3.10 黄皮内生细菌功能鉴定 | 第51-53页 |
| 3.4 小结 | 第53-54页 |
| 4 讨论 | 第54-57页 |
| 5 后续工作与展望 | 第57-58页 |
| 5.1 主要研究结论 | 第57页 |
| 5.2 后续工作思路 | 第57-58页 |
| 致谢 | 第58-59页 |
| 参考文献 | 第59-65页 |
| 附录 | 第65页 |
| A. 作者在攻读学位期间发表的论文 | 第65页 |
| B. 作者在攻读硕士学位期间参加的科研项目 | 第65页 |
