| ACKNOWLEDGMENTS | 第6-8页 |
| ABSTRACT | 第8-12页 |
| TABLE OF CONTENTS | 第13-16页 |
| CHAPTER ONEIntroduction | 第16-41页 |
| 1.0 Introduction to the molecular phylogeography | 第16-17页 |
| 1.1 Tendency in molecular phylogeography | 第17-26页 |
| 1.1.1 The development of molecular phylogeography in marine species | 第17-24页 |
| 1.1.2 Three development patterns of molecular phylogeography | 第24-26页 |
| 1.2 Applications of mitochondrial DNA in population genetic studies | 第26-33页 |
| 1.2.1 Population genetic structure | 第29-30页 |
| 1.2.2 Application of the DNA barcoding | 第30-33页 |
| 1.3 Taxonomy of the genus Pampus | 第33-34页 |
| 1.4. Morphometric growth indices | 第34-36页 |
| 1.5 Stock assessment and management | 第36-39页 |
| 1.6 Aims and scope of the study | 第39-41页 |
| CHAPTER TWOLength-weight relationship and relative condition factor(Kn)of silver pomfret,Pampusargenteus in Pakistani waters | 第41-54页 |
| 2.1 Introduction | 第41-45页 |
| 2.2 Materials and Methods | 第45-47页 |
| 2.2.1 Sample collection | 第45页 |
| 2.2.2 Measurements | 第45页 |
| 2.2.3 Length weight data analysis | 第45-46页 |
| 2.2.4 Student's t-test was computed | 第46页 |
| 2.2.5 Relative condition factor(Kn) | 第46-47页 |
| 2.3 Results | 第47-52页 |
| 2.3.1 Size frequencies | 第47页 |
| 2.3.2 Length weight relationship | 第47-50页 |
| 2.3.3 Student's t-test | 第50页 |
| 2.3.4 Relative condition factor Kn | 第50-52页 |
| 2.4 Discussion | 第52-54页 |
| CHAPTER THREEGenetic identification of two species of genus Pampus in Pakistan using DNA barcodingtechnique | 第54-70页 |
| 3.1 Introduction | 第54-57页 |
| 3.2. Materials and Methods | 第57-61页 |
| 3.2.1 Sample collection | 第57页 |
| 3.2.2 DNA isolation | 第57页 |
| 3.2.3 Primers,PCR conditions and sequencing | 第57-58页 |
| 3.2.4 Sequence alignment and data analysis | 第58-60页 |
| 3.2.5 Phylogenetic analysis | 第60-61页 |
| 3.3. Results | 第61-66页 |
| 3.3.1 Nucleotide composition and genetic diversity | 第61-64页 |
| 3.3.2 Phylogenetic relationship | 第64-66页 |
| 3.4 Discussion | 第66-70页 |
| CHAPTER FOURGenetic diversity and population structure of Pampus echinogaster populations based on mtDNAcontrol region sequence analysis | 第70-90页 |
| 4.1 Introduction | 第70-72页 |
| 4.2 Materials and Methods | 第72-77页 |
| 4.2.1 Sample collection | 第72-73页 |
| 4.2.2 DNA extraction, amplification, and sequencing | 第73-74页 |
| 4.2.3 Sequence alignment and data analysis | 第74-77页 |
| 4.3 Results | 第77-86页 |
| 4.3.1 Molecular diversity and intraspecific variation | 第77-78页 |
| 4.3.2 Genetic structure observed in P. echinogaster | 第78-83页 |
| 4.3.3 Demographic history observed in P. echinogaster | 第83-86页 |
| 4.4 Discussion | 第86-90页 |
| CHAPTER FIVEPopulation genetic structure and demographic history of Pampus argenteus based on mtDNAcontrol region sequences analysis from East China Sea and Arabian Sea | 第90-107页 |
| 5.1 Introduction | 第90-91页 |
| 5.2 Materials and Methods | 第91-96页 |
| 5.2.1 Sample collection | 第91-92页 |
| 5.2.2 DNA extraction, amplification, and sequencing | 第92-93页 |
| 5.2.3 Sequence alignment and data analysis | 第93-96页 |
| 5.3 Results | 第96-102页 |
| 5.3.1 Intraspecific sequence variation | 第96-97页 |
| 5.3.2 Demographic history | 第97-102页 |
| 5.4 Discussion | 第102-107页 |
| CHAPTER SIXStructure analysis of mitochondrial DNA control region and phylogenetic relationship amongPampus species | 第107-129页 |
| 6.1 Introduction | 第107-111页 |
| 6.2 Materials and Methods | 第111-116页 |
| 6.2.1 Sample collection | 第111页 |
| 6.2.2 DNA extraction, amplification and sequencing | 第111-113页 |
| 6.2.3 Sequence alignment and analysis | 第113页 |
| 6.2.4 Phylogenetic analysis | 第113-115页 |
| 6.2.5 Structure analysis | 第115-116页 |
| 6.3 Results | 第116-125页 |
| 6.3.1 Structure of the control region | 第116-122页 |
| 6.3.2 Phylogenetic relationship | 第122-125页 |
| 6.3.2.1 Genetic difference | 第122-124页 |
| 6.3.2.2 Phylogenetic trees | 第124-125页 |
| 6.4 Discussion | 第125-129页 |
| CHAPTER SEVENMaximum sustainable yield estimates of silver pomfret, Pampus argenteus (Family:Stromateidae) dishery in Pakistan | 第129-140页 |
| 7.1 Introduction | 第129-132页 |
| 7.2 Materials and Methods | 第132-135页 |
| 7.2.1 Data source | 第132页 |
| 7.2.2 Biomass dynamie models | 第132-133页 |
| 7.2.3 ASPIC computer package(Prager,1994) | 第133页 |
| 7.2.4 CEDA computer package(FAO,2006) | 第133-134页 |
| 7.2.5 CEDA package requires an initial proportion(IP) | 第134-135页 |
| 7.3 Results | 第135-140页 |
| 7.3.1 Data source and analysis | 第135-136页 |
| 7.3.2 Estimated key parameters with ASPIC software | 第136-137页 |
| 7.3.3 Estimated key management parameters with CEDA software | 第137-140页 |
| 7.4 Discussion | 第140页 |
| CHAPTER EIGHT DISCUSSION AND CONCLUSIONS | 第140-146页 |
| References | 第146-166页 |
| Resume | 第166-167页 |
| List of publications | 第167页 |
