| 摘要 | 第7-9页 |
| ABSTRACT | 第9-10页 |
| 符号说明(英文缩略词) | 第11-12页 |
| 第一部分 文献综述 | 第12-27页 |
| 第一章 文献综述 | 第13-27页 |
| 1、基因、基因家族与基因组 | 第13-14页 |
| 2、基因的分子进化和系统发育 | 第14-16页 |
| 2.1、同源序列搜索 | 第14页 |
| 2.2、多序列比对 | 第14页 |
| 2.3、系统发育树 | 第14-15页 |
| 2.4、同义置换率和非同义置换率 | 第15-16页 |
| 2.5、重复事件发生时间的估计 | 第16页 |
| 3、比较基因组学和基因家族的进化 | 第16-20页 |
| 3.1、比较基因组学概述 | 第16-17页 |
| 3.2、比较基因组学研究的主要内容 | 第17页 |
| 3.3、比较基因组学在植物上的应用 | 第17-18页 |
| 3.4、基因组的倍增 | 第18页 |
| 3.5、基因家族的扩张 | 第18-19页 |
| 3.6、基因家族复制后功能分化 | 第19-20页 |
| 4、豆科植物根瘤固氮机制 | 第20-25页 |
| 4.1、共生固氮的意义 | 第20页 |
| 4.2、根瘤固氮的分子机制 | 第20-21页 |
| 4.3、早期结瘤信号转导 | 第21-22页 |
| 4.4、结瘤起始基因NIN | 第22-23页 |
| 4.5、结瘤起始基因NIN研究进展 | 第23-25页 |
| 5、本研究的目的和内容 | 第25-27页 |
| 第二部分 研究报告 | 第27-55页 |
| 第二章 材料与方法 | 第29-33页 |
| 1、NIN家族成员的鉴定 | 第29页 |
| 2、系统发育分析 | 第29页 |
| 3、染色体定位和基因复制分析 | 第29-30页 |
| 4、基因结构分析 | 第30页 |
| 5、保守结构域分析 | 第30页 |
| 6、基因表达谱分析 | 第30页 |
| 7、进化速率分析 | 第30页 |
| 8、基因注释和互作网络分析 | 第30-33页 |
| 第三章 结果与分析 | 第33-49页 |
| 1、NIN家族成员的鉴定结果 | 第33页 |
| 2、染色体定位和基因复制分析结果 | 第33-36页 |
| 3、系统发育分析结果 | 第36-38页 |
| 4、基因结构分析结果 | 第38-39页 |
| 5、保守结构域分析结果 | 第39-41页 |
| 6、基因表达谱分析结果 | 第41-42页 |
| 7、进化速率分析结果 | 第42-43页 |
| 8、基因注释和互作网络分析结果 | 第43-49页 |
| 第四章 讨论 | 第49-53页 |
| 1、NIN转录因子在早期结瘤信号的转导中发挥关键作用 | 第49页 |
| 2、基因复制是大豆NIN家族扩张的主要方式 | 第49-50页 |
| 3、大豆NIN家族的进化保守及分化 | 第50-53页 |
| 第五章 全文结论及创新点 | 第53-55页 |
| 1、全文结论 | 第53-54页 |
| 2、创新点 | 第54-55页 |
| 附录 | 第55-57页 |
| 参考文献 | 第57-68页 |
| 致谢 | 第68-69页 |
| 攻读硕士学位期间发表及待发表的论文 | 第69页 |