| 摘要 | 第4-5页 |
| Abstract | 第5-6页 |
| 1 绪论 | 第9-13页 |
| 1.1 研究背景及意义 | 第9-10页 |
| 1.2 研究现状 | 第10-12页 |
| 1.3 本文内容组织结构 | 第12-13页 |
| 2 复杂网络关键节点搜索概述 | 第13-23页 |
| 2.1 复杂网络中心性指标简介 | 第13-14页 |
| 2.1.1 介数中心性 | 第13页 |
| 2.1.2 接近中心性 | 第13-14页 |
| 2.1.3 度中心性 | 第14页 |
| 2.1.4 k-核分解 | 第14页 |
| 2.2 直径与网络连通性 | 第14-15页 |
| 2.3 PPI网络中的关键节点搜索 | 第15-22页 |
| 2.3.1 “中心性—致命性”法则 | 第15-17页 |
| 2.3.2 PPI相关数据库 | 第17-18页 |
| 2.3.3 重要蛋白质搜索算法 | 第18-22页 |
| 2.4 小结 | 第22-23页 |
| 3 基于直径的重要节点搜索方法 | 第23-39页 |
| 3.1 基于直径的重要节点搜索方法 | 第23-25页 |
| 3.2 数据集 | 第25-27页 |
| 3.2.1 确定性网络 | 第25-26页 |
| 3.2.2 由Pajek生成的小世界网络模型和无标度网络模型 | 第26-27页 |
| 3.2.3 实际网络 | 第27页 |
| 3.3 实验结果 | 第27-37页 |
| 3.3.1 确定性网络 | 第27-28页 |
| 3.3.2 星形长尾网络 | 第28-29页 |
| 3.3.3 小世界网络和无标度网络 | 第29-32页 |
| 3.3.4 实际网络 | 第32-35页 |
| 3.3.5 基于DCD算法的删边策略 | 第35-37页 |
| 3.4 DCD算法时间复杂度 | 第37页 |
| 3.5 结论 | 第37-39页 |
| 4 基于先验知识的重要蛋白质搜索方法 | 第39-50页 |
| 4.1 基于先验知识的重要蛋白质搜索方法 | 第39-42页 |
| 4.1.1 STRING中的组合分数 | 第39-40页 |
| 4.1.2 IDSSP中的蛋白质评分 | 第40-41页 |
| 4.1.3 候选重要蛋白质 | 第41-42页 |
| 4.2 数据集 | 第42页 |
| 4.3 实验结果 | 第42-48页 |
| 4.3.1 综合比较 | 第42-43页 |
| 4.3.2 先验蛋白质个数 | 第43-44页 |
| 4.3.3 重要与非重要先验蛋白质 | 第44-45页 |
| 4.3.4 IDSSP方法的随机性 | 第45-47页 |
| 4.3.5 F_1 Score | 第47-48页 |
| 4.3.6 高分先验蛋白质的普适性 | 第48页 |
| 4.4 结论 | 第48-50页 |
| 结论 | 第50-52页 |
| 参考文献 | 第52-58页 |
| 附录A DCD算法伪代码 | 第58-61页 |
| 附录B S.cere中评分前40名的蛋白质 | 第61-62页 |
| 攻读硕士学位期间发表学术论文情况 | 第62-63页 |
| 致谢 | 第63-64页 |