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运用基因手段抑制斑马鱼铁调素基因研究铁蓄积在绝经后女性骨质疏松的作用和机制

中文摘要第4-8页
abstract第8-11页
引言第17-23页
    参考文献第21-23页
第一部分 运用寡义核苷酸玛琳环敲降斑马鱼中铁调素研究对骨代谢的影响第23-44页
    一、前言第23页
    二、材料与方法第23-35页
        2.1 实验材料第23-24页
        2.2 实验仪器第24页
        2.3 实验试剂第24-25页
        2.4 常用试剂配制第25-28页
            2.4.1 细菌LB培养基第25-26页
            2.4.2 抗生素第26页
            2.4.3 核酸电泳相关缓冲液第26页
            2.4.4 Inoue法制备超级感受态细胞相关溶液第26页
            2.4.5 原位杂交相关试剂第26-27页
            2.4.6 阿可辛蓝软骨染色及茜素红硬骨染色相关试剂第27-28页
        2.5 引物及注射用Oligo序列第28-29页
        2.6 实验方法及设计第29-35页
            2.6.1 斑马鱼交配产卵第29页
            2.6.2 胚胎总RNA的提取第29页
            2.6.3 mRNA反转成cDNA第29-30页
            2.6.5 显微注射第30-31页
            2.6.6 定量PCR以及制作标准曲线第31页
            2.6.7 原位杂交过程第31-33页
            2.6.8 斑马鱼基因组提取第33页
            2.6.9 斑马鱼硬骨及软骨染色第33-34页
            2.6.10 数据统计分析第34-35页
    三、结果第35-40页
        3.1 通过显微注射进行斑马鱼铁调素的敲降第35页
        3.2. 通过PCR进行进行鉴定效果第35-36页
        3.3. 通过铁色发现铁调素敲降至铁过载第36-37页
        3.4. 骨染色发现铁调素敲降使得骨矿化减少,而软骨变化不大第37-38页
        3.5. 定量QPCR验证铁过载致成骨相关的基因下调第38-39页
        3.6. 原位杂交在在体情况下进一步验证铁过载致成骨相关的基因下调第39-40页
    四、结论第40-41页
    五、讨论第41-42页
    参考文献第42-44页
第二部分 铁调素绿色荧光蛋白转基因斑马鱼在体研究对骨代谢的影响第44-63页
    一、前言第44页
    二、材料与方法第44-54页
        2.1 实验材料第44页
        2.2 实验仪器第44-45页
        2.3 实验试剂第45-46页
        2.4 常用试剂配制第46-49页
            2.4.1 细菌LB培养基第46页
            2.4.2 抗生素第46-47页
            2.4.3 核酸电泳相关缓冲液第47页
            2.4.4 Inoue法制备超级感受态细胞相关溶液第47页
            2.4.5 原位杂交相关试剂第47页
            2.4.6 阿可辛蓝软骨染色及茜素红硬骨染色相关试剂第47-49页
        2.5 引物及注射用Oligo序列第49页
        2.6 实验方法及设计第49-54页
            2.6.1 斑马鱼交配产卵第49-50页
            2.6.2 胚胎总RNA的提取第50页
            2.6.3 mRNA反转成cDNA第50-51页
            2.6.5 显微注射第51页
            2.6.6 定量PCR以及制作标准曲线第51-52页
            2.6.7 MO定制由美国Gene Tool公司设计并验证活性和效果,直接加染料(枫红)0.1ul和Tris盐酸 0.1ul后进行显微注射第52页
            2.6.8 斑马鱼基因组提取第52页
            2.6.9 斑马鱼硬骨及软骨染色第52-53页
            2.6.10 数据统计分析第53-54页
    三、结果第54-59页
        3.1. 成功构建铁调素绿色荧光蛋白质粒第54页
        3.2. 显微注射铁调素绿色荧光蛋白质粒观察96小时表达最明显第54-55页
        3.3. 通过荧光实验进行鉴定效果第55-56页
        3.4. 抑制铁调素表达致铁过载第56-57页
        3.5. 抑制铁调素表达致骨矿化减少第57-58页
        3.6. 通过定量实验发现其铁调素下降使得成骨基因下调第58-59页
    四、结论第59页
    五、讨论第59-60页
    参考文献第60-63页
第三部分 运用CRISPR/Cas9技术敲除斑马鱼铁调素基因研究铁蓄积对骨代谢的影响和机制第63-100页
    一、前言第63页
    二、材料与方法第63-82页
        2.1 实验材料第63页
        2.2 实验仪器第63-64页
        2.3 实验试剂第64-65页
        2.4 常用试剂配制第65-68页
            2.4.1 细菌LB培养基第65页
            2.4.2 抗生素第65-66页
            2.4.3 核酸电泳相关缓冲液第66页
            2.4.4 Inoue法制备超级感受态细胞相关溶液第66页
            2.4.5 原位杂交相关试剂第66页
            2.4.6 阿可辛蓝软骨染色及茜素红硬骨染色相关试剂第66-68页
        2.5 引物及注射用Oligo序列第68-69页
        2.6 实验方法及设计第69-82页
            2.6.1 斑马鱼交配产卵第69页
            2.6.2 胚胎总RNA的提取第69-70页
            2.6.3 mRNA反转成cDNA第70-71页
            2.6.5 胶回收(试剂盒)第71-72页
            2.6.6 目的片段链接载体及酶切鉴定第72页
            2.6.7 制备感受态细胞第72-73页
            2.6.8 转化第73页
            2.6.9 转化试验重组体的PCR鉴定第73页
            2.6.10 质粒的提取(试剂盒)第73-74页
            2.6.11 原位杂交探针合成第74-75页
            2.6.12 显微注射第75页
            2.6.13 定量PCR以及制作标准曲线第75页
            2.6.14 原位杂交过程第75-77页
            2.6.15 斑马鱼基因组提取第77-78页
            2.6.16 斑马鱼硬骨及软骨染色第78-79页
            2.6.17 蛋白免疫共沉淀(CoIP Assay)第79页
            2.6.18 DNA定点突变第79页
            2.6.19 细胞实验第79-80页
            2.6.20 拯救实验第80页
            2.6.21 微型计算机断层成像(micro-CT)分析第80页
            2.6.22 运用CAS9的方法获得hepcidin突变体第80-81页
            2.6.23 高通量测序第81页
            2.6.24 染色质免疫沉淀(Ch IP Assay)Ch IP第81页
            2.6.25 MO定制由美国Gene Tool公司设计并验证活性和效果,直接加染料(枫红)0.1ul和Tris盐酸 0.1ul后进行显微注射第81页
            2.6.26 进化树构建和分析第81-82页
            2.6.27 数据统计分析第82页
    三、实验结果与分析第82-94页
        3.1 在斑马鱼中,Hepcidin蛋白功能域具有很强的保守性第82-83页
        3.2 在斑马鱼中,通过CRISPR/CAS9手段敲除hepcidin基因第83-85页
        3.3 在幼鱼时期铁染色发现铁蓄积,注射hepcidin的mRNA可以部分拯救第85-86页
        3.4 在幼鱼发现其骨代谢发育有明显缺陷,注射hepcidin的mRNA可以部分拯救第86-87页
        3.5 成年斑马鱼表现为同样的表型第87-88页
        3.6 高通量测序和q-RT-PCR显示成骨下游基因有着明显的下调第88-90页
        3.7 原位杂交和在体敲降铁调素证明其对和基因下调第90-92页
        3.8 细胞实验证明铁蓄积通过bmp2a通道下调成骨runx2a基因第92-94页
    四、结论第94-95页
    五、讨论第95-97页
        5.1 运用斑马鱼来研究hepcidin的功能第95-96页
        5.2 运用该斑马鱼中的hepcidin突变体来研究人类骨骼疾病第96页
        5.3 运用该模型来筛药第96页
        5.4 在体研究铁蓄积对成骨基因的抑制第96-97页
    参考文献第97-100页
综述一 以斑马鱼为模式动物研究铁调素在骨质疏松中的作用第100-110页
    参考文献第105-110页
综述二 锌指结构Sp7对骨骼发育及成骨细胞影响 的研究进展第110-120页
    参考文献第116-120页
附录第120-121页
攻读学位期间本人出版或公开发表论著、论文第121-122页
攻读学位期间获得的奖励和项目第122-123页
致谢第123-124页

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