| 摘要 | 第7-11页 |
| Abstract | 第11-14页 |
| 第一章 前言 | 第18-44页 |
| 1.1 玄参属植物研究背景 | 第18-27页 |
| 1.1.1 玄参属植物概况 | 第18页 |
| 1.1.2 玄参属植物研究历史及现状 | 第18-27页 |
| 1.2 分子系统学、生物地理学、亲缘地理学研究进展 | 第27-42页 |
| 1.2.1 分子系统学概述 | 第27-32页 |
| 1.2.2 生物地理学概述 | 第32-34页 |
| 1.2.3 亲缘地理学概述 | 第34-40页 |
| 1.2.4 东亚及青藏高原种子植物亲缘地理研究现状 | 第40-42页 |
| 1.3 玄参属研究存在的问题 | 第42-43页 |
| 1.4 本文研究内容及目的 | 第43-44页 |
| 第二章 玄参属的系统发育重建和生物地理研究 | 第44-82页 |
| 2.1 材料和方法 | 第45-61页 |
| 2.1.1 分类单元材料来源 | 第45-54页 |
| 2.1.1.1 采集与取样 | 第45-49页 |
| 2.1.1.2 各主要物种的地理及生境信息 | 第49-54页 |
| 2.1.2 分子系统学方法 | 第54-57页 |
| 2.1.3 分化时间分析方法 | 第57-58页 |
| 2.1.4 祖先分布区重建方法 | 第58-61页 |
| 2.2 结果分析 | 第61-72页 |
| 2.2.1 序列信息 | 第61-62页 |
| 2.2.2 系统发育分析 | 第62-69页 |
| 2.2.3 分歧时间估计 | 第69-72页 |
| 2.2.4 祖先分布区重建 | 第72页 |
| 2.3 讨论 | 第72-81页 |
| 2.3.1 玄参属内形态学分组的系统学意义 | 第72-73页 |
| 2.3.2 玄参属的起源、迁移和物种分化历史 | 第73-78页 |
| 2.3.3 玄参属的生物地理分布格局 | 第78-79页 |
| 2.3.4 核ITS与cpDNA序列拓扑结构的不一致性 | 第79-80页 |
| 2.3.5 玄参属分类处理建议 | 第80-81页 |
| 2.4 小结 | 第81-82页 |
| 第三章 砾玄参微卫星引物开发 | 第82-94页 |
| 3.1 材料和方法 | 第83-90页 |
| 3.1.1 材料 | 第83页 |
| 3.1.2 仪器、试剂及来源 | 第83页 |
| 3.1.3 DNA提取 | 第83页 |
| 3.1.4 微卫星富集文库构建、测序及引物设计 | 第83-88页 |
| 3.1.4.1 基因组DNA酶切 | 第83-84页 |
| 3.1.4.2 接头的制备及酶切产物的连接 | 第84页 |
| 3.1.4.3 连接产物抑制PCR扩增及产物切胶纯化 | 第84-86页 |
| 3.1.4.4 连接T载体、转化及测序 | 第86-88页 |
| 3.1.5 微卫星引物设计 | 第88页 |
| 3.1.6 PCR引物效率检测 | 第88-89页 |
| 3.1.7 微卫星位点的多态性检测 | 第89-90页 |
| 3.2 结果 | 第90页 |
| 3.3 数据分析及讨论 | 第90-94页 |
| 第四章 环青藏高原地区砾玄参复合种的亲缘地理学研究 | 第94-122页 |
| 4.1 材料 | 第95-96页 |
| 4.2 方法 | 第96-103页 |
| 4.2.1 基因组总DNA的提取 | 第96-97页 |
| 4.2.2 引物筛选,PCR扩增及序列测定 | 第97-98页 |
| 4.2.3 群体遗传多样性及序列分析 | 第98-99页 |
| 4.2.4 cpDNA和ITS单倍型谱系关系分析 | 第99-100页 |
| 4.2.5 SSR群体遗传结构分析 | 第100-101页 |
| 4.2.6 基于cpDNA的历史生物地理学分析 | 第101-103页 |
| 4.3 结果分析 | 第103-116页 |
| 4.3.1 cpDNA序列的测序结果 | 第103页 |
| 4.3.2 基于cpDNA的单倍型谱系关系分析 | 第103-108页 |
| 4.3.3 基于cpDNA和SSR的群体遗传多样性 | 第108-111页 |
| 4.3.4 基于nrSSR标记的群体遗传结构分析 | 第111-113页 |
| 4.3.5 nrITS单倍型谱系关系 | 第113页 |
| 4.3.6 分子钟估算和祖先分布区重建 | 第113-116页 |
| 4.4 讨论 | 第116-121页 |
| 4.4.1 砾玄参复合种群体遗传结构与物种分化 | 第117-118页 |
| 4.4.2 砾玄参复合种由中亚传入青藏高原 | 第118-119页 |
| 4.4.3 地理隔离、冰期避难所和冰后期局部扩张 | 第119-120页 |
| 4.4.4 谱系分选不完全和杂交 | 第120-121页 |
| 4.5 总结 | 第121-122页 |
| 第五章 总结与展望 | 第122-125页 |
| 5.1 总结 | 第122-123页 |
| 5.2 不足与展望 | 第123-125页 |
| 参考文献 | 第125-138页 |
| 附录 | 第138-146页 |
| 在读期间的主要成果 | 第146-148页 |
| 致谢 | 第148-149页 |
