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Xcc 8004中两个编码假定蛋白的基因功能的鉴定

摘要第4-6页
ABSTRACT第6-8页
第一章 前言第12-21页
    1.1 甘蓝黑腐病菌的概述第12页
    1.2 甘蓝黑腐病菌的研究现状第12-13页
    1.3 甘蓝黑腐病菌的主要生化致病因子第13-16页
        1.3.1 胞外多糖(exopolysaccharide,EPS)第13-14页
        1.3.2 胞外酶(extracellularenzyme)第14页
        1.3.3 脂多糖(lipopolysaccharide,LPS)第14-15页
        1.3.4 依赖于hrp基因的效应蛋白分子第15-16页
    1.4 转录因子的概述第16-19页
        1.4.1 转录因子的结构特征第16-17页
        1.4.2 不同家族转录因子的概况第17-19页
    1.5 假定蛋白的概述第19-20页
    1.6 本研究的目的、内容和意义第20-21页
        1.6.1 本研究的目的第20页
        1.6.2 本研究的内容第20页
        1.6.3 本研究的意义第20-21页
第二章 材料与方法第21-47页
    2.1 菌株和质粒第21-22页
    2.2 植物材料第22-23页
    2.3 本研究所用引物第23-24页
    2.4 常用抗生素和其它药剂第24-25页
    2.5 本研究所用培养基第25页
    2.6 常用溶液和缓冲液第25-27页
    2.7 菌株的培养和菌种的保藏第27页
        2.7.1 菌株培养第27页
        2.7.2 菌种保存第27页
    2.8 细菌质粒的提取第27-29页
        2.8.1 碱裂解法快速提取少量质粒DNA第27-28页
        2.8.2 质粒DNA的大量提取第28-29页
    2.9 Xcc总DNA的提取第29页
    2.10 限制性内切酶酶切第29页
    2.11 DNA连接第29-30页
    2.12 琼脂糖凝胶电泳第30-31页
    2.13 Xcc总RNA的提取第31页
    2.14 去除总RNA中的DNA第31-32页
    2.15 反转录PCR第32-33页
    2.16 常规聚合酶链式反应(常规PCR)第33-34页
    2.17 感受态细胞的制备第34页
    2.18 转化第34-35页
    2.19 5'RACE第35-37页
    2.20 6×His 1348蛋白的表达和纯化第37-38页
    2.21 蛋白质的变性聚丙烯酰胺凝胶电泳第38-39页
    2.22 电泳迁移率变动实验(EMSA)第39-40页
        2.22.1 探针DNA的生物素标记第39页
        2.22.2 非变性聚丙烯酰胺凝胶的配制第39-40页
        2.22.3 非变性凝胶电泳第40页
        2.22.4 转膜和显影第40页
    2.23 Xcc的三亲本接合第40-41页
    2.24 整合突变体的构建方法第41-42页
    2.25 缺失突变体的构建方法第42-43页
    2.26 表型检测方法第43-44页
        2.26.1 胞外多糖检测第43页
        2.26.2 胞外蛋白酶检测第43-44页
        2.26.3 胞外淀粉酶检测第44页
        2.26.4 胞外纤维素酶检测第44页
        2.26.5 营养缺陷性检测第44页
        2.26.6 运动性检测第44页
    2.27 生长曲线的测定第44-45页
        2.27.1 在丰富培养基上生长曲线的测定第44-45页
        2.27.2 在基本培养基MMX中生长曲线的测定第45页
    2.28 致病性检测第45页
    2.29 过敏反应第45-46页
    2.30 生物信息学分析方法第46-47页
第三章 结果与分析第47-73页
    3.1 XC_1348基因的研究第47-63页
        3.1.1 XC_1348的生物信息学分析第47-48页
        3.1.2 XC_1348整合突变体的构建及验证第48-50页
        3.1.3 缺失突变体DM1348Gm的构建及验证第50-52页
        3.1.4 整合突变体的功能互补第52-54页
        3.1.5 XC_1348突变体的胞外多糖检测第54页
        3.1.6 XC_1348突变体的胞外蛋白酶检测第54-55页
        3.1.7 XC_1348突变体的胞外淀粉酶检测第55页
        3.1.8 XC_1348突变体的胞外纤维素酶检测第55页
        3.1.9 XC_1348突变体在MMX培养基上的生长情况第55页
        3.1.10 XC_13438突变体的运动性检测第55-56页
        3.1.11 XC_1348突变体的抗逆性检测第56-57页
        3.1.12 XC_1348突变体的HR反应检测第57-58页
        3.1.13 XC_1348突变体的致病性检测第58页
        3.1.14 XC_1348与邻近下游基因的关系分析第58-60页
        3.1.15 XC_1348编码产物功能的分析第60-63页
    3.2 XC_3744基因的研究第63-73页
        3.2.1 XC_3744的生物信息学分析第63-64页
        3.2.2 XC_3744缺失突变体的构建和验证第64-65页
        3.2.3 XC_3744缺失突变体的功能互补第65-66页
        3.2.4 XC_3744致病生化因子分析第66-67页
        3.2.5 XC_3744的生长情况分析第67-68页
        3.2.6 XC_3744的运动性检测第68页
        3.2.7 XC_3744的抗逆性检测第68-70页
        3.2.8 XC_344突变体的HR反应检测第70页
        3.2.9 XC_3744突变体的致病性检测第70-71页
        3.2.10 XC_3744转录起始位点的分析第71-73页
第四章 结论与讨论第73-77页
    4.1 关于XC_1348的研究第73-75页
    4.2 关于XC_3744的研究第75-77页
参考文献第77-85页
致谢第85-86页
攻读学位期间发表论文情况第86页

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