| 摘要 | 第3-5页 |
| Abstract | 第5-6页 |
| 第一章 绪论 | 第9-20页 |
| 1.1 计算机辅助靶向抑制剂分子设计 | 第9-10页 |
| 1.2 酪氨酸激酶及其抑制剂 | 第10-17页 |
| 1.2.1 酪氨酸激酶 | 第11-13页 |
| 1.2.2 酪氨酸激酶抑制剂 | 第13-17页 |
| 1.3 环氧合酶及其抑制剂 | 第17-18页 |
| 1.3.1 环氧合酶 | 第17-18页 |
| 1.3.2 环氧合酶抑制剂 | 第18页 |
| 1.4 本论文的研究工作 | 第18-20页 |
| 第二章 FAK抑制剂的机理研究和分子设计 | 第20-47页 |
| 2.1 引言 | 第20-21页 |
| 2.2 材料与方法 | 第21-27页 |
| 2.2.1 数据集 | 第21-24页 |
| 2.2.2 建立 3D-QSAR模型 | 第24-25页 |
| 2.2.3 分子对接 | 第25页 |
| 2.2.4 分子动力学模拟 | 第25-26页 |
| 2.2.5 结合自由能计算 | 第26页 |
| 2.2.6 自由能分解 | 第26页 |
| 2.2.7 药代动力学和毒性预测 | 第26-27页 |
| 2.3 结果与讨论 | 第27-45页 |
| 2.3.1 3D-QSAR模型分析 | 第27-33页 |
| 2.3.2 对接结果的讨论 | 第33-35页 |
| 2.3.3 分子动力学模拟 | 第35-40页 |
| 2.3.4 结合模式的对比分析 | 第40-41页 |
| 2.3.5 设计出更高活性FAK抑制剂的思路 | 第41-45页 |
| 2.4 结论 | 第45-47页 |
| 第三章 双靶向吡咯并[3,-d]吡啶抑制剂与EGFR/HER2结合机理研究 | 第47-69页 |
| 3.1 引言 | 第47-48页 |
| 3.2 材料与方法 | 第48-50页 |
| 3.2.1 初始结构的选择 | 第48页 |
| 3.2.2 分子对接 | 第48-49页 |
| 3.2.3 分子动力学模拟 | 第49页 |
| 3.2.4 能量计算 | 第49-50页 |
| 3.2.5 药代动力学和毒性预测 | 第50页 |
| 3.3 结果和讨论 | 第50-67页 |
| 3.3.1 分子对接 | 第50-53页 |
| 3.3.2 分子动力学模拟 | 第53-63页 |
| 3.3.3 双靶向EGFR/HER2抑制剂分子设计策略 | 第63-66页 |
| 3.3.4 药代动力学和毒性预测 | 第66-67页 |
| 3.4 结论 | 第67-69页 |
| 第四章 高选择性的COX-2抑制剂机理研究 | 第69-78页 |
| 4.1 引言 | 第69页 |
| 4.2 材料与方法 | 第69-71页 |
| 4.2.1 初始结构的选择 | 第69-70页 |
| 4.2.2 模拟体系的构建 | 第70页 |
| 4.2.3 分子动力学模拟 | 第70-71页 |
| 4.2.4 能量计算和自由能分解 | 第71页 |
| 4.3 结果与讨论 | 第71-77页 |
| 4.3.1 分子动力学模拟 | 第71-72页 |
| 4.3.2 能量分析 | 第72-73页 |
| 4.3.3 残基能量贡献分析 | 第73-75页 |
| 4.3.4 选择性机理的研究 | 第75-77页 |
| 4.4 结论 | 第77-78页 |
| 参考文献 | 第78-86页 |
| 在学期间的研究成果 | 第86-87页 |
| 致谢 | 第87页 |