| 摘要 | 第3-5页 |
| Abstract | 第5-6页 |
| 第一章 绪论 | 第9-19页 |
| 1.1 芽孢杆菌生产嘌呤核苷研究进展 | 第9-13页 |
| 1.1.1 嘌呤核苷简介 | 第9-10页 |
| 1.1.2 嘌呤合成与调控 | 第10-12页 |
| 1.1.3 嘌呤核苷的发酵生产 | 第12页 |
| 1.1.4 嘌呤核苷生产菌基因工程育种 | 第12-13页 |
| 1.2 基因组测序技术的发展 | 第13-16页 |
| 1.2.1 第一代测序技术 | 第13-14页 |
| 1.2.2 第二代测序技术 | 第14-16页 |
| 1.2.3 第三代测序技术 | 第16页 |
| 1.3 芽孢杆菌基因组测序研究进展 | 第16-17页 |
| 1.4 本课题的研究意义及主要内容 | 第17-19页 |
| 1.4.1 本课题的研究意义 | 第17-18页 |
| 1.4.2 本课题的主要内容 | 第18-19页 |
| 第二章 B. subtilis ATCC 13952和ATCC 19217全基因组序列测定 | 第19-29页 |
| 2.1 材料 | 第19-20页 |
| 2.1.1 菌株 | 第19页 |
| 2.1.2 主要试剂 | 第19-20页 |
| 2.1.3 主要仪器及设备 | 第20页 |
| 2.2 方法 | 第20-22页 |
| 2.2.1 基因组DNA的提取 | 第20-21页 |
| 2.2.2 基因组文库构建及测序 | 第21页 |
| 2.2.3 基因组组装 | 第21-22页 |
| 2.2.4 基因组Finishing | 第22页 |
| 2.3 结果与分析 | 第22-27页 |
| 2.3.1 基因组DNA的提取 | 第22-23页 |
| 2.3.2 基因组文库构建及测序 | 第23-24页 |
| 2.3.3 基因组组装结果 | 第24-26页 |
| 2.3.4 基因组Finishing | 第26-27页 |
| 2.4 讨论 | 第27-29页 |
| 第三章 B. subtilis ATCC 13952和ATCC 19217基因组序列的初步分析 | 第29-45页 |
| 3.1 材料 | 第29页 |
| 3.1.1 主要分析软件及数据库 | 第29页 |
| 3.2 方法 | 第29-31页 |
| 3.2.1 基因组注释 | 第29-30页 |
| 3.2.2 基因组特征分析 | 第30页 |
| 3.2.3 COG和GO功能聚类分析 | 第30-31页 |
| 3.2.4 基本代谢分析 | 第31页 |
| 3.2.5 比较基因组分析 | 第31页 |
| 3.2.6 嘌呤代谢相关基因分析 | 第31页 |
| 3.3 结果与分析 | 第31-43页 |
| 3.3.1 基因组的基本特征 | 第31-33页 |
| 3.3.2 基因组特征分析 | 第33-35页 |
| 3.3.3 COG功能分类 | 第35-37页 |
| 3.3.4 GO功能分类 | 第37-38页 |
| 3.3.5 基本代谢分析 | 第38页 |
| 3.3.6 比较基因组分析 | 第38-41页 |
| 3.3.7 嘌呤代谢相关基因分析 | 第41-43页 |
| 3.4 讨论 | 第43-45页 |
| 第四章 总结与展望 | 第45-47页 |
| 4.1 总结 | 第45-46页 |
| 4.2 展望 | 第46-47页 |
| 参考文献 | 第47-53页 |
| 附录 | 第53-59页 |
| 致谢 | 第59-61页 |
| 在读期间公开发表论文（著）及科研情况 | 第61页 |