| 致谢 | 第4-5页 |
| 摘要 | 第5-7页 |
| Abstract | 第7-8页 |
| 第1章 绪论 | 第11-19页 |
| 1.1 课题背景 | 第11-19页 |
| 1.1.1 生物信息数据库现状 | 第11-13页 |
| 1.1.2 生物信息数据库的问题及整合 | 第13-15页 |
| 1.1.3 BioPubInfo的研究和结果 | 第15-19页 |
| 第2章 BiopubInfo文献搜索引擎 | 第19-29页 |
| 2.1 文献搜索引擎背景 | 第19-21页 |
| 2.2 数据与构建 | 第21-28页 |
| 2.2.1 BiopubInfo数据来源 | 第21-22页 |
| 2.2.2 BiopubInfo文献解析 | 第22-23页 |
| 2.2.3 BiopubInfo搜索引擎构建 | 第23-28页 |
| 2.3 结果和讨论 | 第28-29页 |
| 第3章 BiopubInfo知识网络平台 | 第29-44页 |
| 3.1 概念网络平台背景 | 第29页 |
| 3.2 数据与构建方法 | 第29-34页 |
| 3.2.1 BiopubInfo概念本体数据库构建 | 第29-30页 |
| 3.2.2 BiopubInfo概念匹配及信息获取 | 第30-31页 |
| 3.2.3 BiopubInfo概念文献挖掘网络构建 | 第31-34页 |
| 3.2.4 BiopubInfo网络服务器架构 | 第34页 |
| 3.3 网络分析算法 | 第34-35页 |
| 3.4 界面与功能 | 第35-42页 |
| 3.4.1 BiopubInfo用户交互界面设计 | 第35页 |
| 3.4.2 BiopubInfo概念网络特点及优势 | 第35-37页 |
| 3.4.3 BiopubInfo界面及使用 | 第37-42页 |
| 3.5 测试 | 第42-44页 |
| 3.5.1 OMIM疾病候选基因预测 | 第42-44页 |
| 第4章 平台扩展QTXtoGene | 第44-55页 |
| 4.1 背景介绍 | 第44-46页 |
| 4.1.1 QTXtoGene | 第44-46页 |
| 4.2 使用方法 | 第46-51页 |
| 4.3 结果应用 | 第51-54页 |
| 4.4 后续发展 | 第54-55页 |
| 第5章 拟南芥表达调控网络构建 | 第55-63页 |
| 5.1 拟南芥盐胁迫表达调控网络的构建 | 第55-63页 |
| 5.1.1 前言 | 第55-56页 |
| 5.1.2 材料方法 | 第56-57页 |
| 5.1.3 结果 | 第57-63页 |
| 第6章 进化网络分析 | 第63-79页 |
| 6.1 家蚕水平转移基因的分析 | 第63-73页 |
| 6.1.1 材料与方法 | 第63-65页 |
| 6.1.2 结果与讨论 | 第65-71页 |
| 6.1.3 小结 | 第71-73页 |
| 6.2 H2N3流感病毒H1蛋白位点互作网络构建方法及应用 | 第73-79页 |
| 6.2.1 前言 | 第73-74页 |
| 6.2.2 材料与方法 | 第74-76页 |
| 6.2.3 结果与讨论 | 第76-79页 |
| 参考文献 | 第79-87页 |
| 攻读博士学位期间获得的成果 | 第87-88页 |
