| 摘要 | 第5-7页 |
| ABSTRACT | 第7-8页 |
| 第1章 总论 | 第11-47页 |
| 1.1 引言 | 第11-13页 |
| 1.2 促进扩散模型理论 | 第13-23页 |
| 1.2.1 BWH模型 | 第13-16页 |
| 1.2.2 一维扩散与三维扩散具备相关性的理论模型 | 第16-23页 |
| 1.3 靶点搜寻相关的实验研究进展 | 第23-28页 |
| 1.3.1 系宗平均实验 | 第23-26页 |
| 1.3.2 单分子实验 | 第26-28页 |
| 1.4 DNA序列异质性和蛋白质构象在靶点搜寻中的作用 | 第28-34页 |
| 1.4.1 在有崎岖的结合能全景图DNA链上的一维扩散 | 第28-29页 |
| 1.4.2 速率-稳定性悖论 | 第29-30页 |
| 1.4.3 两态模型 | 第30-34页 |
| 1.5 空间效应以及DNA链构象在靶点搜寻中的作用 | 第34-38页 |
| 1.5.1 蛋白质初始位置在靶点搜寻中的作用 | 第34-35页 |
| 1.5.2 三维小跳在靶点搜寻中的作用 | 第35-37页 |
| 1.5.3 DNA链构象在靶点搜寻中的作用 | 第37-38页 |
| 1.6 分子拥挤效应在靶点搜寻中的作用 | 第38-40页 |
| 1.7 本章小结 | 第40-41页 |
| 参考文献 | 第41-47页 |
| 第2章 分子拥挤效应对促进扩散动力学的影响 | 第47-64页 |
| 2.1 引言 | 第47-48页 |
| 2.2 模型及模拟方法 | 第48-50页 |
| 2.3 结果及讨论 | 第50-58页 |
| 2.3.1 理论分析 | 第50-52页 |
| 2.3.2 数值模拟结果 | 第52-58页 |
| 2.4 本章小结 | 第58-60页 |
| 参考文献 | 第60-64页 |
| 第3章 路障粒子对促进扩散动力学的影响 | 第64-80页 |
| 3.1 引言 | 第64-65页 |
| 3.2 模型及模拟方法 | 第65-67页 |
| 3.3 结果及讨论 | 第67-75页 |
| 3.3.1 一对路障粒子的情况 | 第69-71页 |
| 3.3.2 不同密度下的多路障粒子随机摆放的情况 | 第71-75页 |
| 3.4 本章小结 | 第75-77页 |
| 参考文献 | 第77-80页 |
| 第4章 蛋白质的三维亚扩散对促进扩散动力学的影响 | 第80-96页 |
| 4.1 引言 | 第80-81页 |
| 4.2 模型及模拟方法 | 第81-85页 |
| 4.3 结果及讨论 | 第85-89页 |
| 4.4 本章小结 | 第89-90页 |
| 参考文献 | 第90-96页 |
| 第5章 全文总结 | 第96-98页 |
| 致谢 | 第98-99页 |
| 在读期间发表的学术论文与取得的其他研究成果 | 第99页 |
