摘要 | 第3-5页 |
Abstract | 第5-6页 |
1 前言 | 第10-19页 |
1.1 猪抗病育种内涵 | 第10-11页 |
1.2 猪蓝耳病 | 第11-14页 |
1.2.1 PRRSV生物学特征 | 第11-12页 |
1.2.2 PRRSV免疫基因 | 第12-13页 |
1.2.3 PRRSV受体蛋白基因 | 第13-14页 |
1.3 PRRSV信号通路 | 第14-17页 |
1.3.1 胞外信号调控激酶信号通路 | 第14-15页 |
1.3.2 视黄酸诱导基因蛋白I信号通路 | 第15页 |
1.3.3 Toll样受体信号通路 | 第15-16页 |
1.3.4 髓样细胞触发受体1信号通路 | 第16页 |
1.3.5 细胞凋亡信号通路 | 第16页 |
1.3.6 其他重要信号通路 | 第16-17页 |
1.4 猪病品种差异性 | 第17-18页 |
1.5 全基因组重测序 | 第18-19页 |
1.6 本研究的目的及意义 | 第19页 |
2 材料与方法 | 第19-24页 |
2.1 试验材料 | 第19-21页 |
2.2 试验方法 | 第21-24页 |
2.2.1 分群 | 第21-22页 |
2.2.2 中外猪种等位基因频率极端差异性分析 | 第22页 |
2.2.3 数据库 | 第22-24页 |
3 结果与分析 | 第24-42页 |
3.1 中外猪种差异基因及位点筛选结果 | 第24页 |
3.2 中外猪种差异基因与各疾病基因数据库比对结果 | 第24-29页 |
3.2.1 Chi_40基因比对 | 第25页 |
3.2.2 Chi_30基因比对 | 第25-26页 |
3.2.3 Chi_20基因比对 | 第26-29页 |
3.3 中外猪种差异基因与各数据库比对的疾病候选基因 | 第29-31页 |
3.3.1 PigQTLdb数据库 | 第29-30页 |
3.3.2 OMIA数据库 | 第30页 |
3.3.3 OMIM数据库 | 第30-31页 |
3.4 PRRSV相关中外猪种差异免疫基因及位点 | 第31-37页 |
3.4.1 PRRSV特定的免疫基因 | 第31-36页 |
3.4.2 PRRSV的普通免疫基因 | 第36-37页 |
3.5 PRRSV的中外猪种差异显著其它基因及位点 | 第37-42页 |
3.5.1 PRRSV受体蛋白基因 | 第37-39页 |
3.5.2 PRRSV相关信号通路上的基因 | 第39-41页 |
3.5.3 PRRSV相关的其他重要基因 | 第41-42页 |
4 讨论与结论 | 第42-50页 |
4.1 讨论 | 第42-48页 |
4.1.1 卡方检验与PigQTLdb、OMIM以及OMIA数据库比对的共有基因 | 第42-44页 |
4.1.2 PRRSV相关中外猪种差异的特定免疫基因 | 第44-46页 |
4.1.3 PRRSV受体蛋白基因 | 第46页 |
4.1.4 PRRSV相关重要基因的多态性 | 第46-47页 |
4.1.5 PRRSV重要信号通路上差异基因及位点 | 第47-48页 |
4.2 结论 | 第48-50页 |
致谢 | 第50-51页 |
参考文献 | 第51-57页 |
附录 | 第57-142页 |