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基于中外猪种全基因组重测序数据搜寻PRRSV为主的猪病相关候选基因

摘要第3-5页
Abstract第5-6页
1 前言第10-19页
    1.1 猪抗病育种内涵第10-11页
    1.2 猪蓝耳病第11-14页
        1.2.1 PRRSV生物学特征第11-12页
        1.2.2 PRRSV免疫基因第12-13页
        1.2.3 PRRSV受体蛋白基因第13-14页
    1.3 PRRSV信号通路第14-17页
        1.3.1 胞外信号调控激酶信号通路第14-15页
        1.3.2 视黄酸诱导基因蛋白I信号通路第15页
        1.3.3 Toll样受体信号通路第15-16页
        1.3.4 髓样细胞触发受体1信号通路第16页
        1.3.5 细胞凋亡信号通路第16页
        1.3.6 其他重要信号通路第16-17页
    1.4 猪病品种差异性第17-18页
    1.5 全基因组重测序第18-19页
    1.6 本研究的目的及意义第19页
2 材料与方法第19-24页
    2.1 试验材料第19-21页
    2.2 试验方法第21-24页
        2.2.1 分群第21-22页
        2.2.2 中外猪种等位基因频率极端差异性分析第22页
        2.2.3 数据库第22-24页
3 结果与分析第24-42页
    3.1 中外猪种差异基因及位点筛选结果第24页
    3.2 中外猪种差异基因与各疾病基因数据库比对结果第24-29页
        3.2.1 Chi_40基因比对第25页
        3.2.2 Chi_30基因比对第25-26页
        3.2.3 Chi_20基因比对第26-29页
    3.3 中外猪种差异基因与各数据库比对的疾病候选基因第29-31页
        3.3.1 PigQTLdb数据库第29-30页
        3.3.2 OMIA数据库第30页
        3.3.3 OMIM数据库第30-31页
    3.4 PRRSV相关中外猪种差异免疫基因及位点第31-37页
        3.4.1 PRRSV特定的免疫基因第31-36页
        3.4.2 PRRSV的普通免疫基因第36-37页
    3.5 PRRSV的中外猪种差异显著其它基因及位点第37-42页
        3.5.1 PRRSV受体蛋白基因第37-39页
        3.5.2 PRRSV相关信号通路上的基因第39-41页
        3.5.3 PRRSV相关的其他重要基因第41-42页
4 讨论与结论第42-50页
    4.1 讨论第42-48页
        4.1.1 卡方检验与PigQTLdb、OMIM以及OMIA数据库比对的共有基因第42-44页
        4.1.2 PRRSV相关中外猪种差异的特定免疫基因第44-46页
        4.1.3 PRRSV受体蛋白基因第46页
        4.1.4 PRRSV相关重要基因的多态性第46-47页
        4.1.5 PRRSV重要信号通路上差异基因及位点第47-48页
    4.2 结论第48-50页
致谢第50-51页
参考文献第51-57页
附录第57-142页

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