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转录因子ABP9增强玉米非生物胁迫耐受性的相关研究

内容摘要第5-6页
Abstract第6页
英文缩略表第7-11页
1 前言综述第11-29页
    1.1 本文背景概述第11页
    1.2 玉米耐受干旱和盐碱胁迫的研究进展第11-22页
        1.2.1 干旱和盐碱对玉米的危害第11-12页
        1.2.2 ABA信号传导途径第12-16页
        1.2.3 直接参与逆境耐受的基因产物第16-20页
        1.2.4 耐旱和耐盐转基因玉米研究进展第20-22页
    1.3 bZIP转录因子家族和植物抗逆第22-23页
        1.3.1 bZIP基因结构第22页
        1.3.2 bZIP基因功能第22-23页
        1.3.3 玉米bZIP基因研究第23页
    1.4 转录后修饰第23-27页
        1.4.1 可变剪切第23-25页
        1.4.2 miRNA介导的基因沉默第25-27页
    1.5 本研究目的和意义第27-29页
2 ABP9特殊转录修饰的验证第29-46页
    2.1 材料和方法第29-34页
        2.1.1 植物材料第29页
        2.1.2 逆境处理第29页
        2.1.3 DNA提取第29-30页
        2.1.4 Southern blot第30-32页
        2.1.5 PCR检测ABP9转录本使用引物第32页
        2.1.6 基因组和转录组测序和分析第32-33页
        2.1.7 捕获测序第33页
        2.1.8 RNA提取第33页
        2.1.9 DNA的变性聚丙烯酰胺凝胶电泳(Urea PAGE)第33页
        2.1.10 转基因玉米的获得第33页
        2.1.11 克隆实验第33-34页
    2.2 实验结果第34-43页
        2.2.1 ABP9转录本插入修饰现象的发现和前期数据第34-36页
        2.2.2 PCR方法检测ABP9.1转录本第36-39页
        2.2.3 克隆验证ABP9.1转录本数量第39页
        2.2.4 Southern blot检测ABP9在玉米中的拷贝第39-40页
        2.2.5 Genome-Seq和RNA-Seq检测ABP9.1转录本序列第40-42页
        2.2.6 捕获测序检测ABP9.1转录本第42页
        2.2.7 利用GFP-ABP9 genomic转基因玉米检测ABP9.1转录本第42-43页
    2.3 结论第43-44页
    2.4 讨论第44-46页
        2.4.1 序列插入型的RNA编辑第44页
        2.4.2 Urea PAGE电泳更加适合分析微量差异的核酸小片段第44页
        2.4.3 高通量测序法在本研究中的利用第44-45页
        2.4.4 关于核酸污染第45页
        2.4.5 后续补充实验的建议第45-46页
3 ABP9转基因玉米的创建和耐旱性分析第46-66页
    3.1 材料和方法第46-52页
        3.1.1 植物材料第46-47页
        3.1.2 大田旱处理方法第47页
        3.1.3 旱胁迫后的表型评估第47页
        3.1.4 免疫印迹实验(Western Blot)第47-49页
        3.1.5 农杆菌注射幼穗玉米转化法第49-51页
        3.1.6 Southern blot第51页
        3.1.7 PCR检测引物第51-52页
    3.2 结果第52-63页
        3.2.1 转基因植株的创建和鉴定第52-56页
        3.2.2 ABP9过表达转基因玉米的大田抗旱表现第56-63页
    3.3 结论第63-64页
    3.4 讨论第64-66页
        3.4.1 玉米转基因方法的选择第64页
        3.4.2 耐旱指标的选择和下一步实验的改进第64-65页
        3.4.3 耐早转基因玉米研究第65页
        3.4.4 中等强度启动子驱动ABP9转基因玉米的构建第65-66页
4 ABP9增强玉米抗旱性机理的初步探索第66-105页
    4.1 材料和方法第66-72页
        4.1.1 实验材料第66-67页
        4.1.2 土壤水份检测方法第67页
        4.1.3 染色质免疫沉淀(chromatin immunoprecipitation assay,ChIP)第67-71页
        4.1.4 RNA提取第71页
        4.1.5 ChIP-Seq和RNA-Seq的测序和分析第71页
        4.1.6 ABP9发育表达谱第71-72页
        4.1.7 启动子Motif分析第72页
    4.2 实验结果第72-101页
        4.2.1 PEG处理后ABP9转基因株系的RNA-Seq结果第72-83页
        4.2.2 干旱处理后ABP9转基因株系V5期叶片RNA-Seq结果第83-88页
        4.2.3 正常条件下转基因样品的RNA-Seq分析结果第88-90页
        4.2.4 不同条件下RNA-Seq分析组ABP9候选靶基因的交叉结果第90-96页
        4.2.5 利用ChIP-Seq筛选ABP9靶基因第96-100页
        4.2.6 ABP9定位和表达研究第100-101页
    4.3 结论第101-103页
    4.4 讨论第103-105页
        4.4.1 RNA-Seq的结果讨论第103页
        4.4.2 ChIP-Seq的结果讨论第103-104页
        4.4.3 ABP9增强植物耐旱性的机理讨论第104-105页
5 课题总结第105-107页
参考文献第107-114页
致谢第114页
个人简历第114页

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