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应用微生物分子生态学方法研究对虾肠道细菌组成及其变化规律

摘要第1-7页
Abstract第7-9页
目录第9-12页
1 绪论第12-39页
   ·微生态制剂在水产养殖中的应用第12-17页
     ·微生态制剂的定义和类型第12-14页
     ·微生态制剂的作用机理第14-16页
     ·微生态制剂在水产养殖中的应用第16-17页
   ·微生态分子生态学和微生物多样性的研究方法第17-33页
     ·微生物分子生态学第17-22页
     ·微生物多样性的研究方法第22-32页
     ·分子生物学技术的优缺点第32-33页
   ·水产动物肠道微生物的研究进展第33-37页
     ·水产动物肠道微生物的作用第33-34页
     ·水产动物肠道微生物的研究进展第34-37页
   ·本研究的内容、意义和创新点第37-39页
     ·研究内容和意义第37页
     ·创新点第37-38页
     ·技术路线第38-39页
2 肠道微生物DNA的提取方法第39-49页
   ·材料与方法第40-42页
     ·样品的采集第40页
     ·DNA提取方法第40-42页
     ·DNA浓度测定和电泳检测第42页
     ·肠道微生物DNA的PCR检测第42页
   ·结果与分析第42-44页
     ·DNA纯度及浓度检测第42-43页
     ·PCR产物电泳第43-44页
   ·讨论第44-49页
3 南美白对虾肠道微生物多样性研究的PCR-DGGE方法的建立第49-55页
   ·材料与方法第49-50页
     ·材料第49页
     ·DNA的提取第49-50页
     ·PCR扩增第50页
     ·变性梯度凝胶电泳(DGGE)第50页
     ·DGGE图谱分析第50页
   ·结果和分析第50-52页
     ·总DNA的抽提第50-51页
     ·16S rDNA片段的扩增第51页
     ·DGGE分离PCR产物第51-52页
     ·DGGE图谱分析第52页
   ·讨论第52-54页
     ·DNA的提取第52-53页
     ·16S rDNA片段的扩增第53页
     ·DGGE分离PCR产物第53页
     ·DGGE图谱分析第53-54页
   ·结论第54-55页
4 中国明对虾肠道微生物组成第55-65页
   ·材料与方法第55-58页
     ·实验材料第55-56页
     ·实验方法第56-58页
   ·结果与分析第58-62页
     ·16S rDNA V3区DGGE分析第58页
     ·DGGE图谱中主要条带的分子鉴定第58-59页
     ·16S rDNA克隆文库测序和分析第59-61页
     ·系统发育进化树第61-62页
   ·讨论第62-64页
   ·结论第64-65页
5 日本囊对虾肠道微生物组成第65-76页
   ·材料与方法第65-73页
     ·实验材料第65-73页
   ·结果与分析第73-74页
     ·16S rDNA克隆文库分析第73页
     ·16S rRNA基因序列系统进化分析第73-74页
   ·讨论第74-75页
   ·结论第75-76页
6 芽孢杆菌和氟苯尼考对日本囊对虾肠道微生物的影响第76-89页
   ·材料和方法第77-79页
     ·实验材料第77-78页
     ·实验方法第78-79页
   ·结果与分析第79-87页
     ·应用PCR-DGGE法研究芽孢杆菌和氟苯尼考对日本囊对虾肠道微生物区系的影响(实验一)第79-81页
     ·芽孢杆菌对日本囊对虾肠道微生物区系组成的影响(实验二)第81-87页
   ·讨论第87-89页
7 柠檬酸对日本囊对虾肠道微生物的影响第89-94页
   ·材料与方法第89-91页
     ·实验材料第89-90页
     ·实验方法第90-91页
   ·结果与分析第91-92页
   ·讨论第92-94页
8 复合微生态制剂产品中优势菌的鉴定第94-98页
   ·材料与方法第94-95页
     ·实验材料第94页
     ·实验方法第94-95页
   ·结果与分析第95-97页
     ·总DNA的抽提第95页
     ·16S rDNA片段的扩增第95-96页
     ·DGGE分离PCR产物第96页
     ·序列的BLAST分析第96-97页
   ·讨论第97-98页
结论与展望第98-100页
参考文献第100-111页
博士在读期间文章撰写、发表情况第111-112页
致谢第112页

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