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桑螟孵化酶基因特性分析与基于昆虫HE结构的进化研究

摘要第5-6页
ABSTRACT第6-7页
第1章 绪论第12-18页
    1.1 本课题的研究目的与意义第12页
    1.2 桑螟生物防治的研究进展第12-13页
    1.3 动物孵化酶研究进展第13-15页
    1.4 基于真核生物基因内含子缺失进化分析的研究进展第15-16页
    1.5 基于动物孵化酶基因内含子缺失进化分析的研究进展第16-17页
    1.6 本文主要研究内容第17-18页
第2章 桑螟孵化酶基因(Dpy HE)的克隆与生物信息学分析第18-44页
    2.1 实验材料与方法第18-32页
        2.1.1 实验材料与试剂第18页
        2.1.2 常用试剂盒缓冲液的配制第18-20页
        2.1.3 实验仪器和设备第20页
        2.1.4 生物信息学软件第20-21页
        2.1.5 获取各物种孵化酶样蛋白序列第21-23页
        2.1.6 引物设计第23页
        2.1.7 桑螟总RNA的提取第23-24页
        2.1.8 Dpy HE第一链c DNA的合成第24页
        2.1.9 PCR克隆Dpy HE部分片段第24-25页
        2.1.10 Dpy HE基因 3’端序列扩增第25-28页
        2.1.11 Dpy HE基因 5’端序列扩增第28-29页
        2.1.12 琼脂糖凝胶电泳第29-30页
        2.1.13 回收DNA目的片段第30页
        2.1.14 目的片段与p MD18-T载体连接第30页
        2.1.15 感受态细胞的制备第30-31页
        2.1.16 转化第31页
        2.1.17 挑取单克隆第31页
        2.1.18 碱裂解法小量抽取质粒DNA第31-32页
        2.1.19 重组质粒的酶切鉴定第32页
        2.1.20 甘油菌的制备与测序第32页
    2.2 结果与分析第32-42页
        2.2.1 Dpy HE部分c DNA序列的克隆第32-33页
        2.2.2 Dpy HEc DNA的克隆与序列分析第33-34页
        2.2.3 Dpy HE的系统进化分析第34-39页
        2.2.4 Dpy HE的密码子偏好性分析第39-40页
        2.2.5 Dpy HE蛋白的三维结构分析第40-42页
    2.3 讨论第42-43页
    2.4 本章小结第43-44页
第3章 桑螟孵化酶基因(Dpy HE)的原核表达第44-55页
    3.1 材料与方法第44-49页
        3.1.1 材料与试剂第44页
        3.1.2 常用试剂和缓冲液的配制第44-45页
        3.1.3 成熟酶对应核苷酸序列、去信号肽对应核苷酸序列与ORF对应核苷酸序列的克隆第45-46页
        3.1.4 原核表达重组载体的构建第46-47页
        3.1.5 Dpy HE蛋白的原核表达第47页
        3.1.6 Bradford法测定蛋白浓度第47页
        3.1.7 SDS-PAGE电泳第47-48页
        3.1.8 Western Blot第48-49页
    3.2 实验结果与分析第49-53页
        3.2.1 成熟酶对应核苷酸序列、去信号肽对应核苷酸序列与ORF对应核苷酸序列的克隆第49-50页
        3.2.2 重组表达载体的构建第50页
        3.2.3 重组蛋白的原核表达与Western Blot第50-53页
    3.3 讨论第53-54页
    3.4 本章小结第54-55页
第4章 基于昆虫孵化酶基因及其内含子缺失的进化初步分析第55-62页
    4.1 方法第55-56页
        4.1.1 各物种孵化酶之间同源序列比对及构建系统进化树第55页
        4.1.2 获取孵化酶基因结构及其内含子信息第55页
        4.1.3 Notung软件的使用第55-56页
    4.2 实验结果与分析第56-59页
        4.2.1 可获得基因结构的昆虫孵化酶功能区序列比对及其内含子缺失分析第56-57页
        4.2.2 昆虫孵化酶同源序列保守区对应的内含子信息及其进化分析第57-59页
    4.3 讨论第59-61页
        4.3.1 昆虫孵化酶基因同源序列比对及其基因结构分析第59页
        4.3.2 昆虫孵化酶同源序列保守区对应基因组上内含子信息分析第59-60页
        4.3.3 昆虫孵化酶基因内含子丢失的原因及其可能的途径第60-61页
    4.4 本章小结第61-62页
结论第62-64页
参考文献第64-68页
攻读硕士学位期间发表的学术论文第68-70页
致谢第70-71页
详细摘要第71-75页

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