| 摘要 | 第11-14页 |
| ABSTRACT | 第14-16页 |
| 第1章 绪论 | 第17-30页 |
| 1.1 研究背景及意义 | 第17-20页 |
| 1.1.1 研究背景 | 第18-19页 |
| 1.1.2 研究意义 | 第19-20页 |
| 1.2 研究现状 | 第20-24页 |
| 1.2.1 样本断点距离问题 | 第20-22页 |
| 1.2.2 肽从头测序问题 | 第22-24页 |
| 1.3 算法基本知识 | 第24-27页 |
| 1.3.1 算法与计算复杂性 | 第24-26页 |
| 1.3.2 动态规划算法 | 第26-27页 |
| 1.3.3 参数化算法 | 第27页 |
| 1.4 本文主要工作和创新点 | 第27-28页 |
| 1.5 各章节安排 | 第28-30页 |
| 第2章 样本断点距离的复杂性 | 第30-43页 |
| 2.1 引言 | 第30页 |
| 2.2 (1,2)-样本断点距离是NP-Hard的 | 第30-34页 |
| 2.2.1 预备知识 | 第31-32页 |
| 2.2.2 样本断点距离是NP-Hard的 | 第32-34页 |
| 2.3 (1,2)-样本断点距离是APX-Hard的 | 第34-40页 |
| 2.3.1 预备知识 | 第34-36页 |
| 2.3.2 样本断点距离是APX-Hard的 | 第36-40页 |
| 2.4 样本断点距离不存在近似算法和参数算法 | 第40-42页 |
| 2.4.1 样本断点距离不存在近似算法 | 第40-41页 |
| 2.4.2 样本断点距离不存在参数算法 | 第41-42页 |
| 2.5 本章小结 | 第42-43页 |
| 第3章 (1,2)-样本断点距离的动态规划算法 | 第43-59页 |
| 3.1 引言 | 第43-45页 |
| 3.2 预备知识 | 第45-47页 |
| 3.3 动态规划算法 | 第47-54页 |
| 3.3.1 寻找最小样本的动态规划算法 | 第47-51页 |
| 3.3.2 算法的复杂性 | 第51-54页 |
| 3.4 仿真实验 | 第54-58页 |
| 3.4.1 产生随机数据 | 第54-55页 |
| 3.4.2 仿真 | 第55-58页 |
| 3.5 本章小结 | 第58-59页 |
| 第4章 基于串联质谱的肽从头测序 | 第59-68页 |
| 4.1 引言 | 第59-63页 |
| 4.2 质谱图的构造 | 第63-65页 |
| 4.2.1 顶点的构造 | 第63-64页 |
| 4.2.2 边的构造 | 第64-65页 |
| 4.2.3 加权函数的构造 | 第65页 |
| 4.3 禁止顶点对的结构 | 第65-67页 |
| 4.3.1 分半结构 | 第66页 |
| 4.3.2 层次结构 | 第66-67页 |
| 4.3.3 嵌套结构 | 第67页 |
| 4.4 本章小结 | 第67-68页 |
| 第5章 肽从头测序的顶点收缩算法 | 第68-81页 |
| 5.1 引言 | 第68-71页 |
| 5.2 层次结构的顶点收缩算法 | 第71-75页 |
| 5.2.1 层次结构的收缩算法 | 第71-72页 |
| 5.2.2 层次结构的算法示例 | 第72-75页 |
| 5.3 嵌套结构的顶点收缩算法 | 第75-79页 |
| 5.3.1 嵌套结构的收缩算法 | 第75-77页 |
| 5.3.2 嵌套结构的算法示例 | 第77-79页 |
| 5.4 本章小结 | 第79-81页 |
| 第6章 总结与展望 | 第81-83页 |
| 6.1 本文总结 | 第81页 |
| 6.2 研究展望 | 第81-83页 |
| 参考文献 | 第83-88页 |
| 致谢 | 第88-89页 |
| 攻读学位期间发表的学术论文 | 第89-90页 |
| 在读期间参与科研项目情况 | 第90-91页 |
| 外文论文 | 第91-117页 |
| 学位论文评阅及答辨情况表 | 第117页 |