| 摘要 | 第7-9页 |
| ABSTRACT | 第9-10页 |
| 缩略语表 | 第11-12页 |
| 1 前言 | 第12-22页 |
| 1.1 MHC研究进展 | 第12-14页 |
| 1.1.1 BoLA-I研究进展 | 第12-13页 |
| 1.1.2 BoLA-I重链分子的结构和功能 | 第13-14页 |
| 1.1.3 BoLA-I与奶牛妊娠免疫 | 第14页 |
| 1.2 IFN-τ 与奶牛妊娠免疫 | 第14-15页 |
| 1.3 MicroRNA研究进展 | 第15-20页 |
| 1.3.1 MicroRNA研究进展及其生物学作用 | 第15-16页 |
| 1.3.2 MicroRNA的生物合成 | 第16-17页 |
| 1.3.3 miRNA在免疫中的作用 | 第17-18页 |
| 1.3.4 牛基因组中的microRNA | 第18-19页 |
| 1.3.5 miRNA与妊娠免疫 | 第19-20页 |
| 1.4 高通量测序技术 | 第20-21页 |
| 1.5 研究目的和意义 | 第21-22页 |
| 2 材料与方法 | 第22-31页 |
| 2.1 试验材料 | 第22-24页 |
| 2.1.1 试验动物 | 第22页 |
| 2.1.2 试验主要仪器设备 | 第22页 |
| 2.1.3 试验主要试剂 | 第22-23页 |
| 2.1.4 主要试剂配制 | 第23-24页 |
| 2.2 试验方法 | 第24-31页 |
| 2.2.1 奶牛子宫内膜上皮细胞的培养及鉴定 | 第24-25页 |
| 2.2.2 试验方法设计 | 第25-26页 |
| 2.2.3 Trizol法制备样品总RNA | 第26页 |
| 2.2.4 cDNA文库构建和高通量测序 | 第26-31页 |
| 3 结果与分析 | 第31-54页 |
| 3.1 奶牛子宫内膜上皮细胞的培养及鉴定 | 第31-33页 |
| 3.2 奶牛子宫内膜上皮细胞总RNA质检 | 第33-34页 |
| 3.3 测序数据生物信息学分析 | 第34-54页 |
| 3.3.1 测序数据质量评估 | 第34-39页 |
| 3.3.2 参考序列比对分析及小RNA分类注释 | 第39-42页 |
| 3.3.3 已知miRNA鉴定 | 第42-44页 |
| 3.3.4 新miRNA预测 | 第44-45页 |
| 3.3.5 miRNA家族分析 | 第45-46页 |
| 3.3.6 miRNA表达及差异分析 | 第46-48页 |
| 3.3.7 miRNA靶基因预测及富集分析 | 第48-54页 |
| 4 讨论 | 第54-58页 |
| 4.1 高通量测序技术 | 第54页 |
| 4.2 奶牛子宫内膜上皮细胞中小RNA测序分析 | 第54-58页 |
| 4.2.1 测序质量评估 | 第54-55页 |
| 4.2.2 miRNA表达及差异分析 | 第55-57页 |
| 4.2.3 miRNA靶基因预测及富集分析 | 第57-58页 |
| 5 结论 | 第58-59页 |
| 参考文献 | 第59-73页 |
| 致谢 | 第73-74页 |
| 附录 | 第74-85页 |
| 附录1 新发现的miRNA | 第74-78页 |
| 附录2 已知miRNA表达情况（部分） | 第78-85页 |