| 摘要 | 第4-5页 |
| ABSTRACT | 第5页 |
| 第一章 绪论 | 第8-12页 |
| 1.1 引言 | 第8-9页 |
| 1.2 研究背景及其意义 | 第9-11页 |
| 1.2.1 转录因子 | 第9-10页 |
| 1.2.2 组蛋白修饰 | 第10页 |
| 1.2.4 DNA甲基化 | 第10页 |
| 1.2.5 表观遗传学在生物信息学中的作用 | 第10-11页 |
| 1.3 论文结构 | 第11-12页 |
| 第二章 数据来源和处理方法 | 第12-16页 |
| 2.1 数据来源 | 第12-14页 |
| 2.1.1 ENCODE数据库的介绍 | 第12页 |
| 2.1.2 数据的选取 | 第12-14页 |
| 2.2 数据处理 | 第14-15页 |
| 2.2.1 转录因子共占有区域的获得 | 第14页 |
| 2.2.2 单个特征的信号强度分布 | 第14页 |
| 2.2.3 共占有转录因子RPKM值计算 | 第14-15页 |
| 2.3 预测方法 | 第15-16页 |
| 第三章 染色质特征分布 | 第16-26页 |
| 3.1 染色质位置状态在共转录因子上的分布特征 | 第16-17页 |
| 3.2 DNA甲基化在共转录因子上的分布特征 | 第17-20页 |
| 3.3 组蛋白修饰在共转录因子上的分布特征 | 第20-24页 |
| 3.4 DNase Ⅰ在共占有转录因子上的分布特征 | 第24-26页 |
| 第四章 结合表观遗传修饰信息和序列信息的转录因子分类预测 | 第26-41页 |
| 4.1 特征提取 | 第26-27页 |
| 4.2 单特征的评价能力 | 第27-36页 |
| 4.3 多特征的评价能力 | 第36-41页 |
| 第五章 总结和展望 | 第41-43页 |
| 5.1 工作总结 | 第41-42页 |
| 5.2 工作展望 | 第42-43页 |
| 参考文献 | 第43-48页 |
| 致谢 | 第48-49页 |
| 硕士期间发表论文 | 第49页 |