水稻非整倍体T1和T11基因组表达特征解析
| 摘要 | 第3-5页 |
| Absrtact | 第5-6页 |
| 符号说明 | 第8-9页 |
| 第一章：文献综述 | 第9-17页 |
| 1 非整倍体研究状况 | 第9-12页 |
| 1.1 非整倍性变异对生物体影响 | 第9-10页 |
| 1.2 非整倍性基因组的表达特征 | 第10-11页 |
| 1.3 非整倍性基因组表观遗传调控特征 | 第11页 |
| 1.4 非整倍性基因组研究趋势 | 第11-12页 |
| 2 基因表达和转录组测序技术的发展 | 第12-16页 |
| 2.1 基因表达 | 第12页 |
| 2.2 基因表达各研究方法的优劣性 | 第12-13页 |
| 2.3 二代测序技术的原理与方法 | 第13-15页 |
| 2.4 三代测序技术(单分子测序)简介 | 第15-16页 |
| 3 本研究的目的与意义 | 第16-17页 |
| 第二章：水稻非整倍性基因组表达特征解析 | 第17-51页 |
| 1 前言 | 第17-19页 |
| 2 试验材料方法和原理 | 第19-30页 |
| 2.1 细胞、分子试验 | 第19-24页 |
| 2.1.1 FISH鉴定试验方法 | 第19-22页 |
| 2.1.1.1 探针的制备 | 第19-21页 |
| 2.1.1.2 原位杂交 | 第21-22页 |
| 2.1.2 QPCR定量分析 | 第22-24页 |
| 2.2 组织培养、RNA提取及其测序文库构建 | 第24-27页 |
| 2.2.1 组织培养 | 第24页 |
| 2.2.2 RNA的抽提与纯化 | 第24-25页 |
| 2.2.3 构建RNA文库及RNA测序 | 第25-27页 |
| 2.3 RNA-Seq数据处理与分析方法 | 第27-30页 |
| 2.3.1 数据处理流程 | 第27-28页 |
| 2.3.2 基因差异表达分析 | 第28-30页 |
| 3 结果与总结 | 第30-49页 |
| 3.1 三体材料的性状及其鉴定 | 第30-32页 |
| 3.1.1 三体材料的株型 | 第30页 |
| 3.1.2 三体材料的FISH鉴定 | 第30-31页 |
| 3.1.3 三体材料的QPCR鉴定 | 第31-32页 |
| 3.2 测序数据预处理 | 第32-35页 |
| 3.3 差异表达基因的筛选 | 第35-42页 |
| 3.3.1 转录组差异表达基因获取与分析 | 第35-41页 |
| 3.3.2 QPCR验证部分转录组上下调基因 | 第41-42页 |
| 3.4 GO显著性富集分析 | 第42-46页 |
| 3.5 Pathway显著性富集分析 | 第46-49页 |
| 4 讨论 | 第49-51页 |
| 4.1 非整倍性变异对生物体影响 | 第49页 |
| 4.2 非整倍性基因组的剂量与补偿效应 | 第49-50页 |
| 4.3 非整倍性全基因组表达特征 | 第50-51页 |
| 参考文献 | 第51-54页 |
| 致谢 | 第54-56页 |
