| 摘要 | 第4-6页 |
| ABSTRACT | 第6-7页 |
| 1 前言 | 第11-25页 |
| 1.1 水稻每穗总粒数及其相关性状 | 第11-12页 |
| 1.1.1 每穗总粒数相关性状的发育 | 第11-12页 |
| 1.1.2 水稻每穗总粒数相关性状之间的相关性 | 第12页 |
| 1.2 水稻每穗总粒数相关性状的遗传 | 第12-13页 |
| 1.3 水稻每穗总粒数QTL的定位和功能分析 | 第13-16页 |
| 1.3.1 水稻每穗总粒数QTL定位 | 第13-15页 |
| 1.3.2 水稻每穗总粒数QTL的功能分析 | 第15-16页 |
| 1.4 分子标记 | 第16-20页 |
| 1.4.1 DNA分子标记 | 第17-19页 |
| 1.4.2 基因组DNA测序技术 | 第19-20页 |
| 1.5 SSR标记和在遗传相似系数中的应用 | 第20-21页 |
| 1.5.1 SSR标记的特点 | 第20-21页 |
| 1.5.2 SSR标记在分析遗传系数的应用 | 第21页 |
| 1.6 基于高通量测序技术应用和InDel标记的开发 | 第21-24页 |
| 1.6.1 高通量测序技术的应用 | 第21-23页 |
| 1.6.2 InDel标记的开发和应用 | 第23-24页 |
| 1.7 本实验研究的目的和意义 | 第24-25页 |
| 2 实验材料和方法 | 第25-36页 |
| 2.1 实验材料 | 第25页 |
| 2.2 实验耗材 | 第25-26页 |
| 2.2.1 实验试剂 | 第25-26页 |
| 2.2.2 实验仪器设备 | 第26页 |
| 2.3 水稻杂交方法 | 第26-27页 |
| 2.4 取样和性状调查 | 第27页 |
| 2.5 技术路线 | 第27-29页 |
| 2.5.1 亲本杂交及重测序和设计引物路线 | 第27-28页 |
| 2.5.2 田间种植 | 第28-29页 |
| 2.6 水稻基因组DNA的提取、PCR和标记筛选、检测 | 第29-33页 |
| 2.6.1 基因组DNA的提取 | 第29-30页 |
| 2.6.2 PCR扩增 | 第30-31页 |
| 2.6.3 琼脂糖凝胶电泳 | 第31-32页 |
| 2.6.4 聚丙烯酰胺凝胶电泳 | 第32-33页 |
| 2.7 两亲本重测序和InDel标记的设计 | 第33-35页 |
| 2.7.1 两亲本重测序的技术方法和路线 | 第33-34页 |
| 2.7.2 InDel标记的设计 | 第34-35页 |
| 2.8 两个水稻品系遗传相似系数的计算 | 第35页 |
| 2.9 InDel标记的检测 | 第35-36页 |
| 3 结果与分析 | 第36-54页 |
| 3.1 亲本及F_2群体相关性状的测量和分析 | 第36-41页 |
| 3.1.1 两个亲本性状的差异性分析 | 第36-38页 |
| 3.1.2 群体表型 | 第38-39页 |
| 3.1.3 穗部性状相关性分析 | 第39-40页 |
| 3.1.4 水稻每穗总粒数与其构成因子的通径分析 | 第40-41页 |
| 3.2 R4233与测679的遗传相似系数 | 第41-43页 |
| 3.3 重测序结果分析 | 第43-52页 |
| 3.3.1 基因组DNA提取质量检测 | 第43-44页 |
| 3.3.2 数据质量评估与比对 | 第44-49页 |
| 3.3.3 SNP、InDel的统计分析结果 | 第49-50页 |
| 3.3.4 SNP的注释 | 第50-52页 |
| 3.4 依据重测序结果设计分子标签在亲本间的多态性 | 第52-54页 |
| 4 讨论 | 第54-56页 |
| 4.1 两个水稻品系的遗传相似系数 | 第54页 |
| 4.2 水稻每穗总粒数相关性状表型分析 | 第54页 |
| 4.3 重测序结果分析及应用 | 第54-55页 |
| 4.4 InDel标记多态性分析及利用 | 第55-56页 |
| 4.4.1 InDel标记多态性分析 | 第55页 |
| 4.4.2 InDel标记的应用 | 第55-56页 |
| 5 结论与创新点 | 第56-58页 |
| 5.1 结论 | 第56页 |
| 5.2 创新点 | 第56页 |
| 5.3 问题与展望 | 第56-58页 |
| 参考文献 | 第58-66页 |
| 致谢 | 第66-67页 |
| 攻读学位期间参加科研项目和发表论文情况 | 第67页 |
