| 摘要 | 第5-6页 |
| ABSTRACT | 第6-7页 |
| 第一章 绪论 | 第10-20页 |
| 1.1 研究背景及意义 | 第10-13页 |
| 1.2 研究现状 | 第13-16页 |
| 1.3 本文研究内容以及特色工作 | 第16-18页 |
| 1.3.1 研究内容 | 第16-18页 |
| 1.3.2 特色工作 | 第18页 |
| 1.4 内容安排 | 第18-19页 |
| 1.5 本章小结 | 第19-20页 |
| 第二章 融合基因组数据的癌症代谢共性研究 | 第20-38页 |
| 2.1 代谢共性研究方法及差异模型原理 | 第21-25页 |
| 2.1.1 代谢共性研究方法 | 第21页 |
| 2.1.2 数据准备及预处理 | 第21-23页 |
| 2.1.3 差异模型原理 | 第23-25页 |
| 2.2 实验结果 | 第25-35页 |
| 2.2.1 反应层面的癌症代谢共性分析 | 第25-28页 |
| 2.2.2 代谢通路层面的癌症共性分析 | 第28-33页 |
| 2.2.3 代谢基因的癌症共性分析 | 第33-35页 |
| 2.3 本章小结 | 第35-38页 |
| 第三章 代谢特征提取及癌症识别 | 第38-50页 |
| 3.1 数据处理及特征提取方法 | 第39-42页 |
| 3.1.1 数据处理 | 第39-40页 |
| 3.1.2 代谢共性特征提取方法 | 第40-42页 |
| 3.2 实验结果 | 第42-45页 |
| 3.2.1 随机森林的分类结果 | 第42-44页 |
| 3.2.2 SVM分类结果 | 第44-45页 |
| 3.3 癌症类型识别及分类树构造 | 第45-47页 |
| 3.3.1 癌症类型识别 | 第45-46页 |
| 3.3.2 分类树及构造方法 | 第46-47页 |
| 3.4 本章小结 | 第47-50页 |
| 第四章 基于癌症特异代谢网络的致死、抑癌基因预测 | 第50-62页 |
| 4.1 癌症特异代谢工作网络重构方法 | 第52-54页 |
| 4.1.1 数据预处理 | 第52-53页 |
| 4.1.2 iMAT计算core reactions | 第53页 |
| 4.1.3 癌症特异网络生成 | 第53-54页 |
| 4.2 敲除 | 第54-56页 |
| 4.3 实验结果 | 第56-58页 |
| 4.4 癌症特异差异网络及抑癌基因预测 | 第58-60页 |
| 4.4.1 差异网络重构方法 | 第58-59页 |
| 4.4.2 实验结果 | 第59-60页 |
| 4.5 本章小结 | 第60-62页 |
| 第五章 总结与展望 | 第62-66页 |
| 5.1 工作总结 | 第62-64页 |
| 5.2 后续主要工作 | 第64-66页 |
| 参考文献 | 第66-72页 |
| 致谢 | 第72-74页 |
| 在读期间发表的学术论文与取得的研究成果 | 第74页 |