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微小RNA(miRNA)调控乙型(HBV)和丙型(HCV)肝炎病毒基因表达和复制的分子机制研究

中文摘要第1-9页
Abstract第9-16页
引言第16-18页
第一部分 综述第18-66页
 第一章 乙型肝炎病毒第19-30页
   ·HBV的历史背景及其感染的流行病学简介第20页
   ·HBV的病毒特征第20-23页
   ·HBV的转录和复制第23-25页
     ·HBV的转录第23-24页
     ·HBV的复制第24-25页
   ·HBV的免疫发病机理第25-26页
   ·人类宿主中的HBV周期第26-28页
   ·HBV的预防和治疗第28-30页
     ·HBV的预防第28-29页
     ·HBV的治疗第29-30页
 第二章 丙型肝炎病毒第30-46页
   ·HCV的结构和基因组第30-32页
     ·HCV的结构第30-31页
     ·HCV的基因组结构第31-32页
   ·HCV的复制和生命周期第32-33页
   ·HCV细胞内逃避免疫机制第33-46页
     ·宿主对感染的反应第34-36页
     ·HCV引起的宿主反应第36-37页
     ·HCV调控和逃避宿主反应第37-39页
     ·HCV调控干扰素通路第39-40页
     ·HCV调控ISG的表达或功能第40-42页
     ·病毒遗传变异和感染后的宿主反应第42-43页
     ·miRNA及HCV感染第43-44页
     ·HCV-宿主相互作用模型第44-46页
 第三章 治疗肝癌的新方法:小分子RNA(miRNA)疗法第46-66页
   ·miRNA和它们在病毒感染中的作用第47-48页
   ·DNA病毒编码的miRNA第48-51页
     ·疱疹病毒编码的miRNA第48-49页
     ·埃博拉病毒编码的miRNA(EBV)第49-51页
   ·miRNAs编码的其它DNA病毒第51-52页
     ·猴肾病毒40(SV40)和其他多瘤病毒第51-52页
     ·腺病毒编码的miRNA第52页
   ·RNA病毒编码的miRNAs第52-53页
   ·宿主miRNA及其同病毒感染的相互作用第53-55页
     ·在病毒感染中起止面调节作用的miRNA第53-54页
     ·在病毒感染中起负面调节作用的miRNA第54-55页
   ·miRNA的肝脏生物学第55-66页
     ·肝癌中的miRNA表达谱第56-57页
     ·miRNA和病毒性肝炎第57-59页
     ·肝特异性miRNA:miR-122在肝病中的特征第59-61页
     ·肝癌中高表达miRNA:miR-21的特征第61-63页
     ·miRNA可做为通用的抗癌治疗因子第63-66页
第二部分 肝特异性miRNA和HBV的相互作用研究第66-118页
 第四章 前言第66-68页
 第五章 在人肝细胞中HBV下调miR-122的表达第68-79页
   ·引言第68页
   ·实验材料及仪器第68-70页
     ·细胞第68页
     ·实时定量(Real-Time)PCR检测引物第68页
     ·工具酶第68页
     ·其他生物试剂第68-69页
     ·化学试剂和仪器第69-70页
   ·实验方法第70-77页
     ·哺乳动物细胞培养第70-71页
     ·细胞系总RNA提取及Real-Time PCR反应第71-77页
   ·实验结果及讨论第77-79页
     ·HepG2.2.15细胞中miR-122表达水平明显低于HepG2细胞第77-78页
     ·HepG2.2.15细胞和HepG2细胞miRNA芯片分析结果第78-79页
 第六章 miR-122抑制HBV基因的表达和复制第79-96页
   ·引言第79页
   ·实验材料及仪器第79-81页
     ·细菌菌种和质粒第79页
     ·合成寡核苷酸第79页
     ·哺乳动物细胞株/系第79-80页
     ·细菌/细胞培养基第80页
     ·化学试剂和实验仪器第80-81页
     ·试剂盒和转染试剂第81页
   ·实验方法第81-92页
     ·哺乳动物细胞转染用高纯度质量的提取(Tiangen试剂盒为例)第81-83页
     ·哺乳动物细胞的培养、复苏和冻存(见第五章)第83页
     ·哺乳动物细胞的转染第83-84页
     ·乙肝表面抗原(s),e抗原的检测第84-85页
     ·Northern Blot检测HBV RNA水平第85-90页
     ·HBV复制中间体(HBV capsid-associated viral DNA)荧光定量PCR检测第90-92页
   ·实验结果及讨论第92-96页
     ·通过转染合成寡核苷酸可调节细胞内miR-122的表达水平第92-93页
     ·miR-122抑制HBV蛋白的表达第93-94页
     ·miR-122可抑制HBV RNA的表达及DNA的复制第94-96页
 第七章 HBV聚合酶为miR-122的靶mRNA编码基因第96-105页
   ·引言第96页
   ·实验材料及仪器第96-98页
     ·细菌菌种和质粒第96-97页
     ·哺乳动物细胞株/系第97页
     ·构建所用引物:如表6.1所示第97页
     ·工具酶、试剂盒及抗体第97页
     ·其他生物试剂第97-98页
     ·化学试剂和仪器第98页
   ·实验方法第98-100页
     ·哺乳动物细胞转染用高纯质粒提取(见第六章)第98页
     ·哺乳动物的培养、复苏和冻存(见第六章)第98页
     ·哺乳动物细胞的转染(见第六章)第98页
     ·荧光素酶报告基因检测第98-99页
     ·蛋白质免疫印迹(Western Blot)第99-100页
   ·实验结果及讨论第100-105页
     ·HBV聚合酶基因为miR-122的靶mRNA编码基因第100-103页
     ·miR-122也通过类似的机制调控adw亚型的HBV基因表达和复制第103-105页
 第八章 miR-122通过与HBV的靶RNA序列碱基配对的相互作用调控HBV感染第105-111页
   ·引言第105页
   ·实验材料及仪器第105-106页
     ·细菌菌种和质粒第105页
     ·哺乳动物细胞株/系第105页
     ·构建所需引物及合成寡合甘酸:如表8.1所示第105-106页
     ·试剂及仪器第106页
   ·实验方法第106-107页
     ·哺乳动物细胞转染用高纯质粒提取(见第六章)第106页
     ·哺乳动物的培养、复苏和冻存(见第六章)第106页
     ·哺乳动物细胞的转染(见第六章)第106页
     ·乙肝表面抗原(s),e抗原的检测(见第六章)第106页
     ·HBV复制中间体(HBV capsid-associated viral DNA)荧光定量PCR检测(见第六章)第106页
     ·一步法突变构建HBV1.3倍体上miR-122靶标序列的相应特异性位点突变体第106-107页
     ·Northern Blot检测HBV与miR-122的杂交第107页
   ·实验结果和讨论第107-111页
 第九章 体内HBV感染和miR-122表达水平的相关性研究第111-115页
   ·引言第111页
   ·实验材料及仪器第111页
     ·临床标本第111页
     ·试剂和仪器第111页
   ·实验方法第111-113页
     ·miRNA检测(见第五章)第111页
     ·血样中外周血单核细胞(PBMC)的分离第111-112页
     ·血样中HBV病毒载量的荧光定量PCR检测第112-113页
   ·实验结果和讨论第113-115页
 第十章 总论第115-118页
第三部分 在癌症中普遍上调的miRNA和HCV的相互作用研究第118-147页
 第十一章 前言第118-120页
 第十二章 HCV的感染上调miR-21的表达第120-125页
   ·引言第120页
   ·实验材料及仪器第120-121页
     ·细菌菌种,质粒和病毒第120页
     ·哺乳动物细胞株/系第120页
     ·试剂及仪器第120-121页
   ·实验方法第121-123页
     ·哺乳动物细胞转染用高纯质粒提取(见第六章)第121页
     ·哺乳动物细胞的培养、复苏和冻存(见第六章)第121页
     ·哺乳动物细胞的转染(见第六章)第121页
     ·miRNA检测(见第五章)第121页
     ·外周血淋巴细胞(PBMC)的分离和培养第121页
     ·HCV的感染和保存第121页
     ·pFL-J6/JFH-1的线性化,体外转录及转染第121-123页
   ·实验结果及讨论第123-125页
 第十三章 miR-21可抑制HCV触发的Ⅰ型干扰素产物的表达第125-135页
   ·引言第125页
   ·实验材料及仪器第125-126页
     ·合成寡核苷酸和实验所需引物第125-126页
     ·病毒,试剂盒和抗体第126页
     ·其它材料和仪器第126页
   ·实验方法第126-129页
     ·细胞上清中IFN-α蛋白含量的ELISA检测第126-128页
     ·半定量PCR检测第128-129页
     ·其它实验方法第129页
   ·实验结果及讨论第129-135页
     ·在肝细胞内miR-21抑制HCV触发的Ⅰ型干扰素产物的合成第129-131页
     ·miR-21通过拮抗HCV引起的IFN-α抗病毒反应促进HCV的复制第131-133页
     ·miR-21的过表达可抑制IFN-α引起的抗病毒反应第133-135页
 第十四章 MyD88和IRAK1为miR-21的靶标基因第135-144页
   ·引言第135页
   ·实验材料及仪器第135-137页
     ·合成寡核苷酸及实验所需引物第135-136页
     ·哺乳动物细胞第136页
     ·质粒第136页
     ·其它实验试剂及仪器第136-137页
   ·实验方法第137页
     ·3’UTR荧光素酶报告系统的构建第137页
     ·流式细胞检测第137页
     ·其它实验方法第137页
   ·实验结果及讨论第137-144页
     ·miR-21调节TLR-7信号级联通路中各组成成分的基因表达第137-139页
     ·MyD88和IRAK1为miR-21的靶标第139-141页
     ·miR-21对IFN信号通路的调控受MyD88和IRAK1介导第141-144页
 第十五章 总论第144-147页
参考文献第147-164页
攻博期间发表和待发表的论文第164-165页
致谢第165页

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