中文摘要 | 第1-9页 |
Abstract | 第9-16页 |
引言 | 第16-18页 |
第一部分 综述 | 第18-66页 |
第一章 乙型肝炎病毒 | 第19-30页 |
·HBV的历史背景及其感染的流行病学简介 | 第20页 |
·HBV的病毒特征 | 第20-23页 |
·HBV的转录和复制 | 第23-25页 |
·HBV的转录 | 第23-24页 |
·HBV的复制 | 第24-25页 |
·HBV的免疫发病机理 | 第25-26页 |
·人类宿主中的HBV周期 | 第26-28页 |
·HBV的预防和治疗 | 第28-30页 |
·HBV的预防 | 第28-29页 |
·HBV的治疗 | 第29-30页 |
第二章 丙型肝炎病毒 | 第30-46页 |
·HCV的结构和基因组 | 第30-32页 |
·HCV的结构 | 第30-31页 |
·HCV的基因组结构 | 第31-32页 |
·HCV的复制和生命周期 | 第32-33页 |
·HCV细胞内逃避免疫机制 | 第33-46页 |
·宿主对感染的反应 | 第34-36页 |
·HCV引起的宿主反应 | 第36-37页 |
·HCV调控和逃避宿主反应 | 第37-39页 |
·HCV调控干扰素通路 | 第39-40页 |
·HCV调控ISG的表达或功能 | 第40-42页 |
·病毒遗传变异和感染后的宿主反应 | 第42-43页 |
·miRNA及HCV感染 | 第43-44页 |
·HCV-宿主相互作用模型 | 第44-46页 |
第三章 治疗肝癌的新方法:小分子RNA(miRNA)疗法 | 第46-66页 |
·miRNA和它们在病毒感染中的作用 | 第47-48页 |
·DNA病毒编码的miRNA | 第48-51页 |
·疱疹病毒编码的miRNA | 第48-49页 |
·埃博拉病毒编码的miRNA(EBV) | 第49-51页 |
·miRNAs编码的其它DNA病毒 | 第51-52页 |
·猴肾病毒40(SV40)和其他多瘤病毒 | 第51-52页 |
·腺病毒编码的miRNA | 第52页 |
·RNA病毒编码的miRNAs | 第52-53页 |
·宿主miRNA及其同病毒感染的相互作用 | 第53-55页 |
·在病毒感染中起止面调节作用的miRNA | 第53-54页 |
·在病毒感染中起负面调节作用的miRNA | 第54-55页 |
·miRNA的肝脏生物学 | 第55-66页 |
·肝癌中的miRNA表达谱 | 第56-57页 |
·miRNA和病毒性肝炎 | 第57-59页 |
·肝特异性miRNA:miR-122在肝病中的特征 | 第59-61页 |
·肝癌中高表达miRNA:miR-21的特征 | 第61-63页 |
·miRNA可做为通用的抗癌治疗因子 | 第63-66页 |
第二部分 肝特异性miRNA和HBV的相互作用研究 | 第66-118页 |
第四章 前言 | 第66-68页 |
第五章 在人肝细胞中HBV下调miR-122的表达 | 第68-79页 |
·引言 | 第68页 |
·实验材料及仪器 | 第68-70页 |
·细胞 | 第68页 |
·实时定量(Real-Time)PCR检测引物 | 第68页 |
·工具酶 | 第68页 |
·其他生物试剂 | 第68-69页 |
·化学试剂和仪器 | 第69-70页 |
·实验方法 | 第70-77页 |
·哺乳动物细胞培养 | 第70-71页 |
·细胞系总RNA提取及Real-Time PCR反应 | 第71-77页 |
·实验结果及讨论 | 第77-79页 |
·HepG2.2.15细胞中miR-122表达水平明显低于HepG2细胞 | 第77-78页 |
·HepG2.2.15细胞和HepG2细胞miRNA芯片分析结果 | 第78-79页 |
第六章 miR-122抑制HBV基因的表达和复制 | 第79-96页 |
·引言 | 第79页 |
·实验材料及仪器 | 第79-81页 |
·细菌菌种和质粒 | 第79页 |
·合成寡核苷酸 | 第79页 |
·哺乳动物细胞株/系 | 第79-80页 |
·细菌/细胞培养基 | 第80页 |
·化学试剂和实验仪器 | 第80-81页 |
·试剂盒和转染试剂 | 第81页 |
·实验方法 | 第81-92页 |
·哺乳动物细胞转染用高纯度质量的提取(Tiangen试剂盒为例) | 第81-83页 |
·哺乳动物细胞的培养、复苏和冻存(见第五章) | 第83页 |
·哺乳动物细胞的转染 | 第83-84页 |
·乙肝表面抗原(s),e抗原的检测 | 第84-85页 |
·Northern Blot检测HBV RNA水平 | 第85-90页 |
·HBV复制中间体(HBV capsid-associated viral DNA)荧光定量PCR检测 | 第90-92页 |
·实验结果及讨论 | 第92-96页 |
·通过转染合成寡核苷酸可调节细胞内miR-122的表达水平 | 第92-93页 |
·miR-122抑制HBV蛋白的表达 | 第93-94页 |
·miR-122可抑制HBV RNA的表达及DNA的复制 | 第94-96页 |
第七章 HBV聚合酶为miR-122的靶mRNA编码基因 | 第96-105页 |
·引言 | 第96页 |
·实验材料及仪器 | 第96-98页 |
·细菌菌种和质粒 | 第96-97页 |
·哺乳动物细胞株/系 | 第97页 |
·构建所用引物:如表6.1所示 | 第97页 |
·工具酶、试剂盒及抗体 | 第97页 |
·其他生物试剂 | 第97-98页 |
·化学试剂和仪器 | 第98页 |
·实验方法 | 第98-100页 |
·哺乳动物细胞转染用高纯质粒提取(见第六章) | 第98页 |
·哺乳动物的培养、复苏和冻存(见第六章) | 第98页 |
·哺乳动物细胞的转染(见第六章) | 第98页 |
·荧光素酶报告基因检测 | 第98-99页 |
·蛋白质免疫印迹(Western Blot) | 第99-100页 |
·实验结果及讨论 | 第100-105页 |
·HBV聚合酶基因为miR-122的靶mRNA编码基因 | 第100-103页 |
·miR-122也通过类似的机制调控adw亚型的HBV基因表达和复制 | 第103-105页 |
第八章 miR-122通过与HBV的靶RNA序列碱基配对的相互作用调控HBV感染 | 第105-111页 |
·引言 | 第105页 |
·实验材料及仪器 | 第105-106页 |
·细菌菌种和质粒 | 第105页 |
·哺乳动物细胞株/系 | 第105页 |
·构建所需引物及合成寡合甘酸:如表8.1所示 | 第105-106页 |
·试剂及仪器 | 第106页 |
·实验方法 | 第106-107页 |
·哺乳动物细胞转染用高纯质粒提取(见第六章) | 第106页 |
·哺乳动物的培养、复苏和冻存(见第六章) | 第106页 |
·哺乳动物细胞的转染(见第六章) | 第106页 |
·乙肝表面抗原(s),e抗原的检测(见第六章) | 第106页 |
·HBV复制中间体(HBV capsid-associated viral DNA)荧光定量PCR检测(见第六章) | 第106页 |
·一步法突变构建HBV1.3倍体上miR-122靶标序列的相应特异性位点突变体 | 第106-107页 |
·Northern Blot检测HBV与miR-122的杂交 | 第107页 |
·实验结果和讨论 | 第107-111页 |
第九章 体内HBV感染和miR-122表达水平的相关性研究 | 第111-115页 |
·引言 | 第111页 |
·实验材料及仪器 | 第111页 |
·临床标本 | 第111页 |
·试剂和仪器 | 第111页 |
·实验方法 | 第111-113页 |
·miRNA检测(见第五章) | 第111页 |
·血样中外周血单核细胞(PBMC)的分离 | 第111-112页 |
·血样中HBV病毒载量的荧光定量PCR检测 | 第112-113页 |
·实验结果和讨论 | 第113-115页 |
第十章 总论 | 第115-118页 |
第三部分 在癌症中普遍上调的miRNA和HCV的相互作用研究 | 第118-147页 |
第十一章 前言 | 第118-120页 |
第十二章 HCV的感染上调miR-21的表达 | 第120-125页 |
·引言 | 第120页 |
·实验材料及仪器 | 第120-121页 |
·细菌菌种,质粒和病毒 | 第120页 |
·哺乳动物细胞株/系 | 第120页 |
·试剂及仪器 | 第120-121页 |
·实验方法 | 第121-123页 |
·哺乳动物细胞转染用高纯质粒提取(见第六章) | 第121页 |
·哺乳动物细胞的培养、复苏和冻存(见第六章) | 第121页 |
·哺乳动物细胞的转染(见第六章) | 第121页 |
·miRNA检测(见第五章) | 第121页 |
·外周血淋巴细胞(PBMC)的分离和培养 | 第121页 |
·HCV的感染和保存 | 第121页 |
·pFL-J6/JFH-1的线性化,体外转录及转染 | 第121-123页 |
·实验结果及讨论 | 第123-125页 |
第十三章 miR-21可抑制HCV触发的Ⅰ型干扰素产物的表达 | 第125-135页 |
·引言 | 第125页 |
·实验材料及仪器 | 第125-126页 |
·合成寡核苷酸和实验所需引物 | 第125-126页 |
·病毒,试剂盒和抗体 | 第126页 |
·其它材料和仪器 | 第126页 |
·实验方法 | 第126-129页 |
·细胞上清中IFN-α蛋白含量的ELISA检测 | 第126-128页 |
·半定量PCR检测 | 第128-129页 |
·其它实验方法 | 第129页 |
·实验结果及讨论 | 第129-135页 |
·在肝细胞内miR-21抑制HCV触发的Ⅰ型干扰素产物的合成 | 第129-131页 |
·miR-21通过拮抗HCV引起的IFN-α抗病毒反应促进HCV的复制 | 第131-133页 |
·miR-21的过表达可抑制IFN-α引起的抗病毒反应 | 第133-135页 |
第十四章 MyD88和IRAK1为miR-21的靶标基因 | 第135-144页 |
·引言 | 第135页 |
·实验材料及仪器 | 第135-137页 |
·合成寡核苷酸及实验所需引物 | 第135-136页 |
·哺乳动物细胞 | 第136页 |
·质粒 | 第136页 |
·其它实验试剂及仪器 | 第136-137页 |
·实验方法 | 第137页 |
·3’UTR荧光素酶报告系统的构建 | 第137页 |
·流式细胞检测 | 第137页 |
·其它实验方法 | 第137页 |
·实验结果及讨论 | 第137-144页 |
·miR-21调节TLR-7信号级联通路中各组成成分的基因表达 | 第137-139页 |
·MyD88和IRAK1为miR-21的靶标 | 第139-141页 |
·miR-21对IFN信号通路的调控受MyD88和IRAK1介导 | 第141-144页 |
第十五章 总论 | 第144-147页 |
参考文献 | 第147-164页 |
攻博期间发表和待发表的论文 | 第164-165页 |
致谢 | 第165页 |