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人tensin2 SH2结构域和布氏锥虫ADF/cofilin蛋白的结构与功能

摘要第1-7页
ABSTRACT第7-13页
第一部分 人 tensin2 SH2结构域溶液结构及其与非磷酸化酪氨酸依赖的DLC-1结合特性第13-61页
 第一章 研究背景介绍第13-29页
   ·SH2蛋白结构域第13-20页
     ·SH2结构域的分布第13-14页
     ·SH2结构域的功能第14-15页
     ·SH2结构域与配体识别的结构基础第15-20页
   ·tensin蛋白家族第20-24页
     ·tensin蛋白的分子结构特征第20-22页
     ·tensin蛋白的合成和降解第22页
     ·tensin蛋白家族的生物学功能第22-24页
   ·tensin2 SH2与DLC-1的相互作用第24-29页
     ·肿瘤抑制蛋白DLC-1第25-26页
     ·tensin2蛋白第26页
     ·tensin2 SH2结构域与DLC-1的相互作用第26-29页
 第二章 实验材料与方法第29-37页
   ·序列分析第29页
   ·tensin2 SH2结构域的克隆,表达和纯化第29-31页
     ·tensin2 SH2结构域体外表达载体的构建第29-30页
     ·tensin2 SH2结构域重组蛋白的表达纯化第30页
     ·定点突变实验第30-31页
   ·tensin2 SH2结构域的核磁共振数据采集及结构计算第31-32页
   ·表面等离子共振实验(surface plasmon resonance,SPR) (廖善晖完成)第32-33页
     ·活化传感芯片并与磷酸化/非磷酸化肽段偶联第32-33页
     ·检测野生型及突变体tensin2 SH2结构域与配体之间的结合第33页
   ·圆二色谱分析(circular dichroism spectroscopy,CD)(廖善晖完成)第33-34页
   ·化学位移扰动实验第34-37页
 第三章 实验结果与讨论第37-53页
   ·tensin2 SH2结构域与其它SH2结构域及tensin蛋白家族之间SH2结构域的序列比对第37页
   ·tensin2 SH2结构域与DLC-1肽段的相互作用(廖善晖完成)第37-39页
   ·tensin2 SH2结构域及其与DLC-1肽段结合时的二级结构分析(廖善晖完成)第39-40页
   ·tensin2 SH2结构域的溶液三维结构第40-45页
     ·tensin2 SH2结构域的核磁波谱谱峰认证第40页
     ·tensin2 SH2结构域的溶液三维结构第40-44页
     ·tensin2 SH2结构域与SAP SH2结构域的结构比较第44-45页
   ·tensin2 SH2结构域中参与DLC-1肽段识别的氨基酸残基鉴定第45-50页
     ·tensin2 SH2结构域中参与非磷酸化酪氨酸配体识别的氨基酸残基第45-47页
     ·tensin2 SH2结构域中参与磷酸化酪氨酸配体识别的氨基酸残基第47-48页
     ·tensin2 SH2结构域中氨基酸残基Tyr41对DLC-1肽段识别的影响第48-49页
     ·tensin2 SH2结构域中参与DLC-1肽段识别氨基酸残基分布第49-50页
   ·分析与讨论第50-53页
 参考文献第53-61页
第二部分 布氏锥虫肌动蛋白解聚因子TbCof的结构与功能研究第61-121页
 第四章 研究背景介绍第61-81页
   ·肌动蛋白解聚因子同源(ADF-H)结构域蛋白第61-69页
     ·肌动蛋白第61-62页
     ·ADF-H结构域蛋白的特征第62-65页
     ·ADF-H结构域蛋白的actin调节活性第65-69页
   ·ADF/cofilin是细胞内的重要功能蛋白质第69-74页
     ·ADF/cofilin对肌动蛋白的动力学调节功能第70-72页
     ·ADF/cofilin能够转运actin至细胞核第72-73页
     ·ADF/cofilin能够诱导细胞色素C的释放第73页
     ·ADF/cofilin能够激活磷脂酶D1(PLD1)第73-74页
   ·ADF/cofilin活性的调节第74-78页
     ·磷酸化调节第74-75页
     ·pH和4,5二磷酸磷脂酰肌醇(PIP2)的调节第75-76页
     ·氧化的调节第76-77页
     ·其它蛋白的调节第77-78页
   ·布氏锥虫(Trypanosoma brucei)的肌动蛋白解聚因子(TbCof)第78-81页
 第五章 实验材料与方法第81-93页
   ·重组TbCof的克隆,表达和纯化第81-82页
     ·TbCof表达载体的构建第81页
     ·重组TbCof的体外表达与纯化第81-82页
   ·核磁共振数据的收集处理及结构计算第82页
   ·化学位移扰动实验第82页
   ·等温微量热(ITC)实验第82-83页
   ·TbCof-G-actin HADDOCK模型的计算第83-84页
   ·兔肌肌动蛋白的分离纯化第84-87页
     ·兔肌丙酮粉的制备第84-85页
     ·actin的纯化第85-87页
   ·TbCof与F-actin的共沉实验第87-88页
     ·TbCof对F-actin的结合和解聚作用第88页
     ·pH条件对TbCof的F-actin的结合和解聚作用的影响第88页
   ·TbCof与F-actin的电镜实验第88-89页
   ·细胞实验第89-93页
     ·前循环型布氏锥虫(procyclic-form T.brucei)的培养第89页
     ·TbCof过表达细胞系的构建第89页
     ·TbCof的RNA干扰细胞系构建第89-90页
     ·半定量RT-PCR第90页
     ·蛋白质印迹实验(Western blot)第90-91页
     ·免疫荧光显微技术第91-93页
 第六章 实验结果与讨论第93-113页
   ·不同物种ADF/cofilin蛋白的序列比对第93-94页
   ·TbCof的溶液结构分析第94-100页
     ·TbCof的谱峰认证及二级结构预测第94-95页
     ·TbCof的溶液空间结构第95-99页
     ·TbCof与其它ADF/cofilin的结构比较第99-100页
   ·TbCof与肌动蛋白单体(G-actin)之间的相互作用第100-102页
     ·TbCof与G-actin之间存在相互作用第100-101页
     ·TbCof与G-actin之间相互作用的动力学分析第101-102页
   ·TbCof与G-actin复合物的分子模型第102-105页
   ·TbCof对肌动蛋白纤维(F-actin)的解聚作用第105-108页
     ·TbCof具有解聚F-actin的功能第105-106页
     ·TbCof的F-actin解聚功能不受pH影响第106-107页
     ·TbCof使F-actin解聚的电镜实验第107-108页
   ·TbCof的RNA干扰和细胞定位第108-110页
     ·TbCof的RNA干扰不影响细胞生长第108-109页
     ·TbCof主要定位在细胞质中第109-110页
   ·分析与讨论第110-113页
 参考文献第113-121页
附录第121-149页
致谢第149-151页
在读期间发表的学术论文与取得的其它研究成果第151页

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