| 致谢 | 第1-5页 |
| 摘要 | 第5-7页 |
| Abstract | 第7-12页 |
| 第一章 文献综述 | 第12-24页 |
| 1 光质对藻类形态建成的作用 | 第12-15页 |
| 2 光诱导海带生长发育的研究 | 第15-16页 |
| 3 利用 RNA-Seq 的转录组学研究 | 第16-17页 |
| 4 高等植物和藻类的光受体 | 第17-23页 |
| 5 研究目的和意义 | 第23-24页 |
| 第二章 蓝光诱导对海带转录谱表达的影响分析 | 第24-60页 |
| 第一节 海带转录组文库构建和 RNA-Seq 测序 | 第24-30页 |
| 1 材料和方法 | 第24-26页 |
| ·实验材料 | 第24页 |
| ·实验仪器和试剂 | 第24页 |
| ·RNA 提取和质量检测 | 第24-25页 |
| ·RNA-Seq 测序文库构建 | 第25页 |
| ·RNA-Seq 测序数据统计与筛选 | 第25-26页 |
| 2 结果与分析 | 第26-29页 |
| ·海带 RNA 提取及质量分析 | 第26-28页 |
| ·RNA-Seq 文库数据初步统计和筛选 | 第28-29页 |
| 3 讨论与小节 | 第29-30页 |
| 第二节 海带转录组生物信息学分析 | 第30-45页 |
| 1 材料和方法 | 第30-32页 |
| ·实验数据 | 第30页 |
| ·测序数据拼接 | 第30-31页 |
| ·Unigene 功能注释 | 第31页 |
| ·Unigene GO（基因本体）分类 | 第31页 |
| ·Unigene COG 功能分析 | 第31页 |
| ·Unigene 代谢通路分析 | 第31-32页 |
| ·海带转录组中蓝光响应 unigene 的筛选分析 | 第32页 |
| 2 结果与分析 | 第32-44页 |
| ·测序数据拼接 | 第32-34页 |
| ·Unigene 功能注释 | 第34-35页 |
| ·Unigene GO（基因本体）分类 | 第35-37页 |
| ·Unigene COG 功能分析 | 第37页 |
| ·Unigene 代谢通路分析 | 第37-42页 |
| ·海带转录组中蓝光响应 unigene 的筛选分析 | 第42-44页 |
| 3 讨论与小节 | 第44-45页 |
| 第三节 蓝光和黑暗条件下海带幼孢子体转录组基因差异表达分析 | 第45-60页 |
| 1 材料和方法 | 第45-48页 |
| ·实验仪器和试剂 | 第45页 |
| ·差异表达 unigenes 的筛选 | 第45页 |
| ·差异表达 unigenes 的 GO 分析 | 第45页 |
| ·差异表达 unigene 的 KEGG 分析 | 第45-46页 |
| ·蓝光响应相关差异表达 unigene 的筛选 | 第46页 |
| ·qPCR 验证 | 第46-48页 |
| 2 结果与分析 | 第48-56页 |
| ·差异表达 unigene 的筛选 | 第48页 |
| ·差异表达 unigene 的 GO 分析 | 第48-49页 |
| ·差异表达 unigene 的 KEGG 分析 | 第49-50页 |
| ·海带特异性蓝光响应 unigene 的筛选 | 第50-55页 |
| ·qPCR 验证 | 第55-56页 |
| 3 讨论与小节 | 第56-60页 |
| 第三章 海带 AUREO 蓝光受体基因的克隆和体外表达分析 | 第60-92页 |
| 第一节 海带 AUREO 基因的克隆 | 第60-77页 |
| 1 材料和方法 | 第60-68页 |
| ·实验材料 | 第60页 |
| ·实验仪器和试剂 | 第60页 |
| ·RNA 提取和 cDNA 合成 | 第60-61页 |
| ·海带蓝光受体基因目的片段的克隆 | 第61-63页 |
| ·RACE 法扩增 AUREO 基因全序列 | 第63-67页 |
| ·海带蓝光受体基因生物信息学分析 | 第67-68页 |
| 2 结果与分析 | 第68-75页 |
| ·海带总 RNA 提取 | 第68-69页 |
| ·海带 AUREO 基因的克隆 | 第69-71页 |
| ·海带 AUREO 蓝光受体基因序列分析 | 第71-75页 |
| 3 讨论与小节 | 第75-77页 |
| 第二节 海带 AUREO 基因转录水平的分析 | 第77-82页 |
| 1 材料和方法 | 第77-78页 |
| ·实验材料与仪器试剂 | 第77页 |
| ·RNA 提取和 cDNA 合成 | 第77页 |
| ·qPCR 检测 SjAUREO mRNA 表达水平 | 第77-78页 |
| 2 结果与分析 | 第78-81页 |
| ·海带 SjAUREO cDNA 梯度稀释实验 | 第78-79页 |
| ·海带 SjAUREO mRNA 表达 qPCR 分析 | 第79-81页 |
| 3 讨论与小节 | 第81-82页 |
| 第三节 海带蓝光受体体外表达研究 | 第82-92页 |
| 1 材料和方法 | 第82-87页 |
| ·实验材料 | 第82页 |
| ·仪器与试剂 | 第82-83页 |
| ·海带蓝光受体基因 ORF 的克隆 | 第83页 |
| ·海带蓝光受体表达质粒的构建和鉴定 | 第83-84页 |
| ·海带 AUREO 基因的体外表达及检测 | 第84-87页 |
| 2 结果与分析 | 第87-90页 |
| ·SjAUREO 的 ORF 扩增 | 第87页 |
| ·构建 SjAUREO 表达质粒 | 第87-88页 |
| ·海带 SjAUREO 体外表达 | 第88-90页 |
| ·重组 SjAUREO 光谱特征检测 | 第90页 |
| 3 讨论与小节 | 第90-92页 |
| 第四章 结论与创新点 | 第92-93页 |
| 参考文献 | 第93-113页 |
| 缩略词表 | 第113-115页 |
| 作者简历 | 第115页 |
| 攻读博士学位期间发表文章 | 第115页 |
