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真核生物AU-rich元件结合蛋白HuR和GAPDH3的结构功能研究

摘要第1-7页
ABSTRACT第7-9页
目录第9-12页
第一篇 mRNA稳定性调节蛋白HuR的结构和功能研究第12-74页
 第1章 绪论第12-28页
   ·哺乳动物mRNA稳定性调节的研究进展第12-14页
   ·mRNA监控途径第14-17页
     ·NMD降解途径第14-16页
     ·NSD降解途径第16-17页
     ·NGD降解途径第17页
   ·参与mRNA降解的顺式作用元件和反式作用因子第17-21页
     ·AU-rich元件以及结合蛋白第18-20页
     ·GU-rich元件以及结合蛋白第20页
     ·CU-rich元件及分化调控元件第20-21页
     ·CA-rich元件及其结合蛋白第21页
   ·ARE结合蛋白HuR的结构及功能研究第21-28页
     ·HuR的结构特征第21-23页
     ·HuR与mRNA的稳定性第23-24页
     ·HuR的翻译后修饰对其结合RNA的影响第24-26页
     ·HuR与肿瘤第26-28页
 第2章 HuR识别ARE的分子机制研究第28-58页
   ·HuR蛋白的结构生物学研究现状第28-29页
   ·实验材料和方法第29-35页
     ·HuR蛋白的基因克隆及表达质粒的构建第29-32页
     ·HuR RRM1/2蛋白的表达及纯化第32-33页
     ·晶体生长及衍射数据收集第33页
     ·模型搭建及晶体结构修正第33-34页
     ·HuR RRM1/2蛋白的生化性质及其结合RNA能力的鉴定第34-35页
   ·实验结果第35-52页
     ·HuR RRM1/2蛋白的纯化第36页
     ·HuR RRM1/2晶体的获得第36-38页
     ·HuR RRM1/2的结构解析第38-40页
     ·HuR RRM1/2的总体结构第40-42页
     ·HuR RRM1/2结合poly(U)能力的检测及关键残基的鉴定第42-44页
     ·HuR RRM1/2-RNA复合物的结构解析第44-47页
     ·HuR RRM1/2-RNA的总体结构第47-48页
     ·底物RNA的识别及其选择特异性第48-50页
     ·HuR RRM1/2与底物RNA之间结合能力测定第50-52页
   ·结果讨论第52-58页
     ·与Hu蛋白家族其他成员的RRM1/2的结构比对第52-53页
     ·构象变化显著提高了HuR RRM1/2对底物RNA的亲和力第53-58页
 本篇小结第58-59页
 参考文献第59-74页
第二篇 酿酒酵母GAPDH3的结构与功能研究第74-115页
 第1章 绪论第74-89页
   ·糖酵解过程概述第74-76页
     ·糖酵解过程第74-76页
     ·甘油醛-3-磷酸脱氢酶的作用机制第76页
   ·甘油醛-3-磷酸脱氢酶的其他功能第76-81页
     ·GAPDH结合核酸第77-79页
     ·GAPDH与端粒第79页
     ·GAPDH是一个转录因子第79页
     ·GAPDH与其他蛋白的相互作用第79页
     ·GAPDH把葡萄糖的利用和生长信号联系起来第79-80页
     ·GAPDH与凋亡第80-81页
     ·GAPDH作为一个促生存因子第81页
   ·GAPDH功能的调节第81-86页
     ·磷酸化对于GAPDH的影响第81-82页
     ·GAPDH定位的调节第82-86页
   ·GAPDH具有多重功能的重要性第86-87页
   ·GAPDH的医学意义以及未来前景第87-89页
 第2章 酿酒酵母GAPDH3的结构生物学研究第89-106页
   ·酿酒酵母甘油醛-3-磷酸脱氢酶的结构生物学研究现状第89-91页
   ·实验材料和方法第91-97页
     ·GAPDH3蛋白的基因克隆及表达质粒的构建第91-93页
     ·GAPDH3蛋白的表达及纯化第93-94页
     ·GAPDH3的晶体生长及衍射数据收集第94-95页
     ·模型搭建及晶体结构修正第95页
     ·GAPDH3蛋白的生化性质及其结合RNA能力的鉴定第95-97页
   ·实验结果与讨论第97-106页
     ·GAPDH3蛋白的纯化第97页
     ·GAPDH3的晶体学研究第97-100页
     ·GAPDH3的总体结构第100-101页
     ·GAPDH3蛋白聚集状态分析第101-102页
     ·NAD~+结合引起构象变化第102-103页
     ·GAPDH3酶活测定第103-104页
     ·GAPDH3结合RNA能力的测定第104-105页
     ·GAPDH3结合RNA的结构模型第105-106页
 本篇小结第106-107页
 参考文献第107-115页
致谢第115-117页
在读期间发表的学术论文与取得的研究成果第117页

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