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橡胶树胶乳再生相关基因的cDNA-AFLP筛选与分析

摘要第1-6页
Abstract第6-12页
1 前言第12-27页
   ·我国天然橡胶事业的发展现状第12-13页
     ·橡胶树概述和分类第12页
     ·天然橡胶是关系国计民生的工业原料第12-13页
     ·我国迫切需要大幅度提高橡胶单产第13页
     ·大幅提高橡胶单产在客观上是可行的第13页
   ·橡胶树产胶的生理基础第13-17页
     ·胶乳的基本属性第13-14页
     ·胶乳的主要成分第14页
     ·橡胶树的产胶细胞——乳管第14-16页
     ·橡胶烃生物合成途径第16-17页
     ·影响橡胶树胶乳产量的主要因子第17页
   ·橡胶树已克隆基因的研究进展第17-20页
     ·橡胶烃生物合成关键基因的克隆第17-19页
     ·其它相关基因的克隆第19-20页
   ·胶乳再生调控机制的分子生物学研究进展第20-23页
     ·碳水化合物供给与分解代谢调控第21-22页
     ·橡胶烃生物合成的调控第22页
     ·能量供给和腺苷合成的调控第22-23页
     ·黄色体在胞质pH值稳态中的调控作用第23页
   ·未开割橡胶树是研究胶乳再生机制的理想材料第23-24页
   ·cDNA-AFLP技术是高通量筛选差异表达基因的有效途径第24-25页
   ·本研究的目的和意义第25-26页
   ·技术路线图第26-27页
2 实验材料与试剂第27-28页
   ·植物材料第27页
   ·质粒与菌株第27页
   ·分子生物学试剂盒第27页
   ·生化试剂第27-28页
3 实验方法与步骤第28-44页
   ·胶乳总RNA的提取和检测第28-30页
     ·胶乳的采集第28页
     ·胶乳总RNA的提取第28-29页
     ·胶乳总RNA的质量检测第29-30页
       ·胶乳总RNA浓度和纯度测定第29页
       ·胶乳总RNA完整性检测第29-30页
   ·半定量RT-PCR调整胶乳总RNA用量第30-31页
     ·逆转录合成cDNA第一链第30页
     ·半定量RT-PCR调整模板第30-31页
   ·mRNA的纯化第31-32页
   ·双链cDNA的合成第32-34页
     ·cDNA第一链的合成第32-33页
     ·cDNA第二链的合成和质量检测第33页
     ·cDNA双链的纯化第33-34页
   ·cDNA样品的酶切和接头的连接第34页
     ·cDNA样品的双酶切第34页
     ·酶切片段的加接头反应第34页
   ·cDNA片段的预扩增第34-35页
   ·选择性PCR扩增第35-36页
   ·转录本衍生片段(Transcript-derived fragments,TDFs)的分离第36-38页
     ·胶板的制备第36-37页
     ·电泳第37页
     ·银染程序第37-38页
   ·差异表达的TDF片段(Differentially expressed TDFs,DE-TDFs)的获取、纯化、克隆和测序第38-40页
     ·DE-TDFs的获取第38页
     ·DE-TDFs的纯化第38-39页
       ·DE-TDFs的再扩增第38页
       ·目的条带的回收第38-39页
     ·DE-TDFs的克隆第39-40页
     ·菌落PCR鉴定阳性克隆和测序第40页
   ·银染cDNA-AFLP技术的有效性检测第40-41页
     ·逆转录合成cDNA第一链第41页
     ·调整模板量第41页
     ·表达模式分析第41页
   ·荧光实时定量PCR(qRT-PCR)分析候选DE-TDFs的表达模式第41-44页
     ·逆转录合成cDNA第一链第43页
     ·检测qRT-PCR引物特异性第43-44页
     ·制作qRT-PCR引物标准曲线第44页
     ·候选基因表达模式分析第44页
4 结果与分析第44-73页
   ·未开割橡胶树胶乳总RNA样品的纯度和完整性检测第44-45页
     ·胶乳总RNA的OD值测定第44-45页
     ·胶乳总RNA的甲醛变性凝胶电泳检测第45页
   ·cDNA-AFLP银染分析第45-48页
     ·模板的制备第45-47页
       ·双链cDNA合成的质量检测第45-46页
       ·预扩增PCR质量检测第46-47页
     ·转录衍生片段(Transcript Derived Fragments,TDFs)的分离第47-48页
   ·差异表达TDFs(Different Expressed of Transcript Derived Fragments,DE-TDFs)的筛选第48页
   ·DE-TDFs的同源注释和聚类整理第48-49页
     ·序列预处理与同源注释第48-49页
     ·冗余DE-TDFs的聚类整理第49页
   ·非冗余DE-TDFs的功能分类统计分析第49-52页
     ·DE-TDFs功能分类初步统计第49-51页
     ·功能分类明确DE-TDFs的统计第51页
     ·DE-TDF主要功能类别分析第51-52页
   ·非冗余DE-TDF同源注释和分类汇总表第52-64页
   ·银染cDNA-AFLP技术的有效性分析第64-66页
   ·胶乳再生相关部分候选DE-TDFs表达模式的qRT-PCR分析第66-73页
     ·选取胶乳再生相关的部分候选DE-TDFs第66-67页
     ·qRT-PCR分析结果第67-73页
5 讨论与结论第73-78页
   ·讨论第73-77页
     ·cDNA-AFLP技术是橡胶树差异表达基因筛选的一种有效手段第73-74页
     ·受割胶调控的基因涉及多个功能类别第74-75页
     ·参与胶乳再生的几个关键代谢途径第75-76页
     ·研究中出现的研究技术问题第76页
     ·展望第76-77页
   ·结论第77-78页
参考文献第78-86页
作者在读硕士期间科研成果简介第86-87页
附录一:有关试剂的配制第87-90页
附录二:缩略词第90-91页
致谢第91页

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