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猪链球菌噬菌体穿孔素(holin)基因的定位、功能确认及生物学特性研究

摘要第1-8页
ABSTRACT第8-21页
符号说明第21-23页
第一章 文献综述第23-44页
 1 猪链球菌2型研究进展第24-26页
 2 猪链球菌噬菌体的研究进展第26-33页
   ·噬菌体SMP的基本特征第27-29页
   ·噬菌体SMP的裂解酶第29-33页
 3 穿孔素蛋白的研究进展第33-44页
   ·生物学意义第34-35页
   ·生物学特性第35-36页
   ·抗穿孔素第36-37页
   ·研究范例第37-41页
     ·双起始基序第37-38页
     ·成孔机制第38-41页
     ·基于S蛋白的裂菌时间的调控策略第41页
   ·问题和展望第41-44页
第二章 生物信息学分析第44-56页
 摘要第44-45页
 1 材料与方法第45-47页
   ·基因分析第45-46页
     ·基因定位第45页
     ·基本特性分析第45页
     ·同源性分析第45页
     ·启动子预测第45-46页
   ·蛋白质分析第46-47页
     ·理化性质分析第46页
     ·同源性分析第46页
     ·二级结构预测第46页
     ·亚细胞定位分析第46-47页
 2 结果第47-53页
   ·穿孔素基因预测第47-48页
   ·核酸序列分析第48-49页
     ·基本特性第48页
     ·同源性第48-49页
     ·启动子第49页
   ·蛋白分析第49-53页
     ·理化特性第49-51页
     ·同源性第51-52页
     ·拓扑结构第52-53页
     ·亚细胞定位第53页
 3 讨论第53-56页
第三章 HolSMP基因在噬菌体感染的猪链球菌中的转录表达第56-75页
 摘要第56-57页
 1 材料与方法第57-65页
   ·菌株与培养基第57页
   ·引物与载体第57页
   ·噬菌体效价测定第57-58页
   ·噬菌体培养第58-59页
     ·液体培养法第58页
     ·双层琼脂平板培养法第58-59页
   ·噬菌体收集与保存第59-60页
     ·平板直接洗脱法第59页
     ·上层琼脂收集洗脱法第59页
     ·噬菌体保存第59-60页
   ·细菌计数第60页
   ·溶菌酶作用浓度优化第60页
   ·猪链球菌SS2-H超声破碎第60-61页
   ·噬菌体感染样本的制备第61页
   ·HolSMP基因的转录分析第61-63页
     ·核酸样本制备第61-62页
     ·PCR定性分析第62页
     ·qRT-PCR定量分析第62-63页
   ·HolSMP基因的表达分析第63-65页
     ·膜蛋白样本制备第63页
     ·Tricine-SDS-PAGE电泳第63-64页
     ·蛋白免疫印迹分析第64-65页
 2 结果第65-72页
   ·噬菌体效价与最佳铺板浓度第65页
   ·噬菌体悬液制备策略优化第65页
   ·溶菌酶处理第65-66页
   ·超声破碎效果鉴定第66-68页
   ·猪链球菌的噬菌体感染第68页
   ·HolSMP基因的转录水平分析第68-71页
     ·反转录PCR定性分析第68-69页
     ·qRT-PCR定量分析第69-71页
   ·HolSMP基因的表达水平分析第71-72页
 3 讨论第72-75页
第四章 HolSMP基因的功能鉴定第75-97页
 摘要第75-76页
 1 材料与方法第76-84页
   ·菌株、噬菌体与培养基第76页
   ·引物与质粒第76-77页
   ·基因克隆第77-78页
   ·表达质粒的构建第78-79页
     ·pEXH1、pEXL表达质粒的构建第78页
     ·pACEXL表达质粒的构建第78页
     ·pEX、pACEX对照质粒的构建第78-79页
   ·HolSMP基因的表达第79-80页
     ·质粒转化第79页
     ·IPTG诱导第79-80页
     ·蛋白检测第80页
   ·HolSMP基因表达对宿主的影响第80-81页
     ·细菌生长速度第80页
     ·细菌存活率第80-81页
     ·菌体形态学观察第81页
     ·能量毒素试验第81页
   ·HolSMP蛋白的亚细胞定位第81-82页
   ·LySMP基因的表达第82-83页
     ·质粒转化与蛋白诱导第82页
     ·SDS-PAGE电泳第82-83页
     ·酶谱试验第83页
   ·HolSMP和LySMP共表达对宿主的作用第83页
   ·噬菌体基因补偿实验第83-84页
     ·IPTG诱导浓度的确定第83页
     ·噬菌体感染第83-84页
 2 结果第84-93页
   ·基因克隆第84页
   ·质粒构建与酶切鉴定第84-85页
   ·基因诱导表达第85-87页
     ·HolSMP基因表达第85-86页
     ·LySMP基因表达第86-87页
   ·HolSMP基因表达对宿主的影响第87-89页
   ·能量毒素实验分析第89-90页
   ·HolSMP蛋白的亚细胞定位第90-91页
   ·HolSMP和LySMP共表达对宿主的作用第91页
   ·HolSMP基因对于穿孔素S基因缺陷型λ噬菌体的基因补偿第91-93页
 3 讨论第93-97页
第五章 HolSMP基因序列与裂菌表型第97-116页
 摘要第97-99页
 1 材料与方法第99-106页
   ·菌株与质粒第99页
   ·引物第99-100页
   ·质粒构建第100-104页
     ·构建携带5'-端截短的HolSMP基因的质粒第100-102页
     ·构建携带突变基因HolSMPa43c的质粒第102页
     ·构建携带跨膜区编码序列缺失的HolSMP基因的质粒第102页
     ·构建携带末端添加组氨酸标签编码序列的HolSMP基因的质粒第102-103页
     ·构建含插入组氨酸标签编码序列的HolSMP基因的质粒第103-104页
     ·构建p32Hb重组质粒第104页
   ·蛋白的胞内生物学作用分析第104页
   ·HolSMP抗体制备第104-106页
     ·抗原制备第104-105页
     ·动物免疫第105页
     ·血清分离第105页
     ·抗体效价测定第105-106页
 2 结果第106-114页
   ·5'-端截短的HolSMP基因与裂菌表型第106-108页
   ·基因HolSMPa43c与裂菌表型第108页
   ·跨膜区编码序列缺失的HolSMP基因与裂菌表型第108-109页
   ·末端添加组氨酸标签编码序列的HolSMP基因与裂菌表型第109-110页
   ·插入组氨酸标签编码序列的HolSMP基因与裂菌表型第110-112页
   ·HolSMPb蛋白的表达与纯化第112-114页
   ·HolSMP多克隆抗体的效价测定与保存第114页
 3 讨论第114-116页
第六章 HolSMP蛋白表达策略与胞外生物学活性第116-134页
 摘要第116-117页
 1 材料与方法第117-124页
   ·菌株与培养基第117页
   ·引物与质粒第117-118页
   ·质粒构建第118-120页
   ·表达系统优化第120-121页
     ·原核表达系统第120页
     ·真核表达系统第120-121页
   ·诱导表达程序优化第121-122页
     ·表达程序(一)第121页
     ·表达程序(二)第121-122页
   ·HolSMP重组蛋白的表达纯化第122页
   ·LySMP重组蛋白的表达纯化第122-123页
   ·浊度递减试验第123页
   ·HolSMP重组蛋白作用条件的优化第123页
   ·裂解细菌试验第123-124页
 2 结果第124-131页
   ·诱导表达系统筛选结果第124页
   ·诱导表达程序优化结果第124-125页
   ·HolSMP139t蛋白的表达和纯化第125页
   ·LySMP蛋白的表达、纯化和活性检测第125-128页
   ·HolSMP139t蛋白最适作用条件第128-129页
   ·HolSMP139t蛋白的裂菌特性第129-131页
 3 讨论第131-134页
参考文献第134-147页
全文结论第147-148页
附录1 实验材料与仪器第148-151页
附录2 培养基和溶液配方第151-156页
攻读博士期间发表的文章第156-158页
致谢第158-160页

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