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苹果caspase-like基因家族的全基因组分析及平邑甜茶MhVPEγ基因的功能鉴定

中文摘要第1-12页
Abstract第12-14页
1 前言第14-32页
   ·细胞程序性死亡第14页
   ·细胞程序性死亡的类型第14-15页
   ·Caspase 调控动物 PCD 过程第15-17页
   ·植物中可检测到 caspase-like 活性第17-19页
   ·植物已鉴定的 caspase-like 蛋白酶第19-29页
     ·Subtilases第19-22页
     ·Metacaspases第22-23页
     ·Legumains (VPEs)第23-29页
   ·镉胁迫对植物生长发育的影响第29-30页
   ·本研究目的和意义第30-32页
2 材料与方法第32-56页
   ·实验材料第32-34页
     ·植物材料第32页
     ·植物材料培养与处理第32页
     ·菌株和质粒载体第32页
     ·酶及生化试剂第32-33页
     ·实验引物第33页
     ·软件和网络资源第33-34页
   ·实验方法第34-56页
     ·RNA 提取第34-35页
     ·RNA 的纯化第35-36页
     ·反转录 cDNA 第一条链的合成第36-37页
     ·PCR 扩增第37页
     ·DNA 片段与克隆载体的连接第37页
     ·大肠杆菌 DH5α 感受态的制备第37页
     ·大肠杆菌感受态细胞的转化第37-38页
     ·质粒 DNA 的提取第38-39页
     ·DNA 片段的回收第39页
     ·序列测定第39-40页
     ·DNA 提取第40-41页
     ·目的基因 cDNA 全长的获得第41-42页
     ·半定量 RT-PCR第42页
     ·实时荧光定量 PCR第42-43页
     ·染色体步移第43-45页
     ·甲基化检测第45页
     ·原核表达第45-47页
     ·根癌农杆菌介导的植物转化第47-50页
     ·拟南芥的无土栽培、转化及分析第50-52页
     ·生理生化指标测定第52-53页
     ·Clustal X 的使用第53页
     ·MEGA 5.0 构建系统发生树第53-54页
     ·苹果 caspase-like 蛋白家族成员的鉴定第54页
     ·MhVPEγ 基因的序列分析第54页
     ·MhVPEγ蛋白结构预测及可视化第54-55页
     ·蛋白相互作用分析第55-56页
3 结果与分析第56-123页
   ·苹果 caspase-like 基因家族的全基因组分析第56-86页
     ·苹果 subtilases 基因家族的全基因组分析第56-70页
     ·苹果 metacaspases 基因家族的全基因组分析第70-78页
     ·苹果 legumains 基因家族的全基因组分析第78-86页
   ·平邑甜茶 MhVPEγ 基因的分离及功能鉴定第86-110页
     ·平邑甜茶 MhVPEγ 基因的分离第86页
     ·平邑甜茶 MhVPEγ 基因的序列分析第86-88页
     ·MhVPEγ 多重序列比对和系统发生分析第88-91页
     ·MhVPEγ 和 hcaspase-1 的结构比较第91-92页
     ·MhVPEγ 的结构分析第92-94页
     ·MhVPEγ 基因 5’侧翼序列的分离与分析第94-97页
     ·MhVPEγ 基因的表达分析第97-102页
     ·MhVPEγ 基因的原核表达分析第102-103页
     ·MhVPEγ 参与水杨酸缓解镉胁迫对平邑甜茶幼苗伤害的过程第103-110页
   ·MhVPEγ 基因在拟南芥中的转化第110-117页
     ·转基因表达载体的构建第110-113页
     ·转基因拟南芥的筛选及鉴定第113-117页
   ·MhVPEγ 在转基因拟南芥中的功能鉴定第117-123页
     ·转基因拟南芥的表型分析第117-119页
     ·转基因拟南芥对镉胁迫的响应第119-123页
4 讨论第123-129页
   ·苹果中存在 caspase-like 蛋白酶第123-125页
   ·平邑甜茶 MhVPEγ 基因的功能分析第125-129页
     ·MhVPEγ 的结构分析第125-126页
     ·逆境胁迫和信号物质对 MhVPEγ 基因的表达调控第126-127页
     ·抑制 VPEγ 基因的表达可以增强转基因拟南芥对镉胁迫的抗性第127-129页
5 结论第129-130页
参考文献第130-143页
附录第143-146页
致谢第146-147页
攻读学位期间发表和完成论文第147页

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