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角毛壳菌表达序列标签测定及几丁质酶基因的克隆与表达

摘要第1-6页
Abstract第6-16页
第1章 绪论第16-38页
   ·课题的学术背景及其理论与实际意义第16-17页
   ·国内外文献综述第17-36页
     ·微生物农药的研究概况第17-19页
     ·毛壳菌的研究概况第19-25页
     ·cDNA文库的构建第25-27页
     ·表达序列标签研究进展第27-31页
     ·生物信息学与ESTs序列分析第31-33页
     ·微生物几丁质酶的研究概况第33-35页
     ·酿酒酵母表达研究概况第35-36页
   ·目前角毛壳菌研究中存在的问题第36-37页
   ·课题来源及主要研究内容第37-38页
     ·课题来源第37页
     ·主要研究内容第37-38页
第2章 实验材料和方法第38-61页
   ·实验材料第38-45页
     ·菌株和质粒第38-39页
     ·培养基第39-40页
     ·酶和试剂第40-44页
     ·仪器设备第44-45页
   ·实验方法第45-61页
     ·角毛壳菌的培养第45页
     ·角毛壳菌产几丁质酶的研究第45页
     ·角毛壳菌两个菌丝体cDNA文库的构建第45-49页
     ·角毛壳菌表达序列标签测定第49-52页
     ·ESTs序列的生物信息学分析第52-53页
     ·角毛壳菌两条几丁质酶基因的表达类型鉴定第53-54页
     ·内切几丁质酶基因Chi46 的克隆第54-57页
     ·几丁质酶基因Chi46 在酿酒酵母中的表达第57-60页
     ·转化子几丁质酶诱导表达及发酵条件的优化第60-61页
第3章 C1文库和C2 文库的构建及质量鉴定第61-74页
   ·角毛壳菌产几丁质酶的研究第61-62页
   ·角毛壳菌两个菌丝体 cDNA 文库的构建第62-67页
     ·总RNA的分离提取第62页
     ·mRNA的提取纯化第62-64页
     ·cDNA双链的合成第64-65页
     ·cDNA片断的胶回收及和载体的连接第65-66页
     ·cDNA文库的PCR鉴定第66-67页
   ·cDNA 文库的质量鉴定第67-68页
   ·角毛壳菌cDNA文库构建和质量鉴定的讨论第68-73页
     ·总RNA的提取纯化第68-69页
     ·构建cDNA文库取材时间的选择第69-70页
     ·cDNA文库构建中逆转录酶的选择第70-71页
     ·构建 cDNA 文库中 cDNA 片断和载体的选择原则第71页
     ·检测cDNA文库插入片断长度方法的选择第71-72页
     ·cDNA文库质量的评估第72-73页
   ·本章小结第73-74页
第4章 角毛壳菌基因表达谱的建立第74-95页
   ·C1 文库的大规模ESTs测序分析第74-83页
     ·C1 文库的大规模ESTs测序结果第74-75页
     ·C1 文库ESTs序列的长度分析第75页
     ·C1 文库ESTs序列的聚类分析第75-78页
     ·C1 文库中基因表达谱的分析第78页
     ·C1 文库中ESTs序列的GO分类第78-81页
     ·C1 文库获得的可能与生物防治相关的基因第81-83页
   ·C2 文库的大规模ESTs测序分析第83-89页
     ·C2 文库的ESTs测序结果第83-84页
     ·C2 文库ESTs序列的聚类分析第84-86页
     ·C2 文库中基因表达谱分析第86页
     ·C2 文库的ESTs序列GO分类第86-88页
     ·诱导条件下获得的可能与生物防治相关的基因第88-89页
   ·ESTs序列在网上的公布与提交第89-90页
   ·角毛壳菌ESTs序列分析和生物防治机制的讨论第90-94页
     ·ESTs序列测定和生物信息学分析第90-91页
     ·关于角毛壳菌生物防治机制的探讨第91-94页
   ·本章小结第94-95页
第5章 C1 文库和 C2 文库的比较分析第95-115页
   ·两个cDNA文库单一基因的比较第95-96页
   ·两个cDNA文库基因表达丰度差异第96-98页
   ·两个cDNA文库GO功能分类比较第98-101页
   ·两个cDNA文库代谢途径的差异比较第101-105页
   ·两个cDNA文库生物防治相关基因比较第105-106页
   ·角毛壳菌两条几丁质酶基因的比较分析第106-108页
     ·两条几丁质酶基因的生物信息学比较第106-107页
     ·两条几丁质酶表达类型的RT-PCR鉴定第107-108页
   ·角毛壳菌两个cDNA文库比较的分析第108-114页
     ·高表达基因的比较分析第108-109页
     ·代谢途径的比较分析第109-110页
     ·生物防治相关基因的差异分析第110-111页
     ·两条几丁质酶基因表达的分析第111-112页
     ·关于几丁质酶代谢调控的讨论第112-113页
     ·差减cDNA文库和一般cDNA文库的比较第113-114页
   ·本章小结第114-115页
第6章 角毛壳菌几丁质酶基因的克隆及表达第115-130页
   ·内切几丁质酶基因序列的克隆第115-117页
   ·内切几丁质酶基因Chi46 保守区分析第117-118页
   ·几丁质酶基因Chi46 的酿酒酵母转化表达第118-121页
     ·几丁质酶基因Chi46 的扩增及与pYES2 载体的连接第118-119页
     ·几丁质酶基因Chi46 的酿酒酵母转化和鉴定第119-121页
   ·转化子产几丁质酶发酵条件的优化第121-124页
     ·培养时间对转化子产几丁质酶的影响第121-122页
     ·半乳糖浓度对转化子产几丁质酶的影响第122页
     ·几丁质浓度对转化子产几丁质酶的影响第122-123页
     ·诱导培养基的起始pH值对转化子产几丁质酶的影响第123-124页
   ·Chi46 基因克隆和在酿酒酵母中表达的讨论第124-129页
     ·几丁质酶基因Chi46 的扩增第124-125页
     ·几丁质酶基因Chi46 在酿酒酵母中的表达第125-128页
     ·转化子发酵条件优化的研究第128-129页
   ·本章小结第129-130页
结论第130-132页
参考文献第132-146页
附录第146-179页
攻读学位期间发表的学术论文第179-181页
致谢第181-182页
个人简历第182页

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