| 中文摘要 | 第1-13页 |
| 英文摘要 | 第13-17页 |
| 引言 | 第17-19页 |
| 第一部分 文献综述 | 第19-43页 |
| 第1章 农作物重要农艺性状基因（QTL）分子标记定位研究进展 | 第20-37页 |
| 1．1 农作物重要农艺性状的遗传特点 | 第20页 |
| 1．2 遗传标记的种类及特点 | 第20-22页 |
| 1．2．1 形态标记 | 第20页 |
| 1．2．2 细胞学标记 | 第20-21页 |
| 1．2．3 蛋白质标记 | 第21页 |
| 1．2．4 DNA标记 | 第21-22页 |
| 1．3 遗传连锁图谱的构建 | 第22-23页 |
| 1．3．1 经典遗传连锁图 | 第22-23页 |
| 1．3．2 分子遗传连锁图 | 第23页 |
| 1．4 质量性状基因的分子定位 | 第23-26页 |
| 1．4．1 分离群体分组分析 | 第24页 |
| 1．4．2 极端个体分组和隐性基因组分析 | 第24-25页 |
| 1．4．3 DNA池分析 | 第25页 |
| 1．4．4 近等基因系分析 | 第25-26页 |
| 1．5 数量性状位点（QTL）定位 | 第26-37页 |
| 1．5．1 QTL定位的原理及各种QTL检测方法的特点及影响因素 | 第26-27页 |
| 1．5．2 QTL定位策略 | 第27-28页 |
| 1．5．2．1 选择基因型分析 | 第27页 |
| 1．5．2．2 分离群体分组分析 | 第27-28页 |
| 1．5．2．3 比较定位 | 第28页 |
| 1．5．3 QTL的定位群体 | 第28-29页 |
| 1．5．4 QTL的数目、基因作用及效应 | 第29页 |
| 1．5．5 个体发育不同阶段的QTL定位 | 第29-30页 |
| 1．5．6 QTL定位中的基因型与环境互作 | 第30页 |
| 1．5．7 上位性与数量性状 | 第30-31页 |
| 1．5．8 QTL与主基因的对应性 | 第31页 |
| 1．5．9 QTL的精细定位和克隆 | 第31-33页 |
| 1．5．9．1 精细定位的策略 | 第31-33页 |
| 1．5．9．1．1 减少背景噪音 | 第32页 |
| 1．5．9．1．2 改进统计方法 | 第32页 |
| 1．5．9．1．3 提高定位群体中重组个体的频率 | 第32页 |
| 1．5．9．1．4 构建单个QTL的近等基因系 | 第32-33页 |
| 1．5．9．1．5 全基因组QTL的精细定位 | 第33页 |
| 1．5．9．2 QTL克隆 | 第33页 |
| 1．5．10 QTL定位在水稻育种中的应用 | 第33-35页 |
| 1．5．10．1 鉴定种质资源中的有利等位基因 | 第33-34页 |
| 1．5．10．2 分子标记辅助选择改良数量性状 | 第34-35页 |
| 1．5．11 今后QTL的研究方向 | 第35-37页 |
| 第2章 近等基因导入系的构建及其应用研究概况 | 第37-43页 |
| 2．1 供体基因组回交导入的遗传效应 | 第37-38页 |
| 2．2 分子标记辅助回交导入的特点 | 第38-39页 |
| 2．3 近等基因导入系的构建及其在QTL定位中的应用 | 第39-41页 |
| 2．3．1 NIILs的构建及其遗传结构 | 第39-40页 |
| 2．3．2 传统分离群体定位QTL存在的缺陷 | 第40页 |
| 2．3．3 NIILs在QTL定位中应用 | 第40-41页 |
| 2．4 近等基因导入系的育种应用 | 第41-43页 |
| 2．4．1 目标基因或QTL的回交转育 | 第41-42页 |
| 2．4．2 抗性基因聚合 | 第42-43页 |
| 第二部分 水稻重要农艺性状数量性状位点（QTL）的分子标记定位研究 | 第43-102页 |
| 第3章 水稻产量构成因子的遗传剖析 | 第44-62页 |
| 3．1 材料与方法 | 第44-46页 |
| 3．1．1 试验材料与性状考察 | 第44-45页 |
| 3．1．2 标记基因型分析 | 第45页 |
| 3．1．3 QTL定位及互作效应分析 | 第45-46页 |
| 3．2 结果与分析 | 第46-58页 |
| 3．2．1 性状的表型与变异 | 第46页 |
| 3．2．2 影响产量构成因子及其相关性状的QTL | 第46-55页 |
| 3．2．2．1 影响PN、SNP及其相关性状的QTL | 第46-47页 |
| 3．2．2．2 影响粒重及相关性状的QTL | 第47-55页 |
| 3．2．3 影响产量构成因子及其相关性状的互作效应 | 第55-58页 |
| 3．2．3．1 影响PN、SNP及其相关性状的互作效应 | 第55页 |
| 3．2．3．2 影响粒重及相关性状的互作效应 | 第55-58页 |
| 3．3 讨论 | 第58-62页 |
| 第4章 特青背景近等基因导入系的构建及其遗传结构分析 | 第62-77页 |
| 4．1 材料与方法 | 第62-65页 |
| 4．1．1 回交导入系的选育 | 第62-63页 |
| 4．1．2 DNA提取和标记基因型分析 | 第63-65页 |
| 4．1．2．1 DNA提取 | 第63-64页 |
| 4．1．2．2 标记基因型分析 | 第64-65页 |
| 4．1．2．2．1 RAPD分析 | 第64页 |
| 4．1．2．2．2 SSR分析 | 第64-65页 |
| 4．1．2．2．3 形态标记分析 | 第65页 |
| 4．1．3 导入系的遗传结构分析 | 第65页 |
| 4．2 结果与分析 | 第65-75页 |
| 4．2．1 导入系的图示基因型及染色体的重组交换 | 第65-66页 |
| 4．2．2 作图群体中146个标记位点的分离及各位点Lemont等位基因在NIILs中的导入频率 | 第66页 |
| 4．2．3 导入系的基因组比例和杂合性 | 第66-73页 |
| 4．2．4 导入片段的数目、大小和位置 | 第73页 |
| 4．2．5 覆盖供体基因组跨叠系的筛选 | 第73-75页 |
| 4．3． 讨论 | 第75-77页 |
| 第5章 利用近等基因导入系定位水稻重要农艺性状基因 | 第77-102页 |
| 5．1 材料与方法 | 第77-79页 |
| 5．1．1 试验材料 | 第77页 |
| 5．1．2 田间试验与性状考察 | 第77-78页 |
| 5．1．2．1 田间试验设计 | 第77页 |
| 5．1．2．2 性状考察 | 第77-78页 |
| 5．1．3 QTL定位 | 第78-79页 |
| 5．1．3．1 QTL定位方法 | 第78-79页 |
| 5．1．3．2 QTL遗传主效应的估算 | 第79页 |
| 5．1．3．3 QTL互作效应检测 | 第79页 |
| 5．2 结果与分析 | 第79-100页 |
| 5．2．1 显著不同于对照的NIILs群体的性状均值和变异 | 第79-80页 |
| 5．2．2 QTL定位及其表型效应 | 第80-99页 |
| 5．2．2．1 产量构成因子 | 第81页 |
| 5．2．2．2 穗粒性状 | 第81-83页 |
| 5．2．2．3 株型性状 | 第83-84页 |
| 5．2．2．4 其它性状 | 第84-99页 |
| 5．2．3 QTL的互作效应 | 第99-100页 |
| 5．3 讨论 | 第100-102页 |
| 参考文献 | 第102-116页 |
| 附录A 表目录 | 第116-117页 |
| 附录B 图目录 | 第117-119页 |
| 附录C 作者简历及发表文章目录 | 第119页 |
