| 摘要 | 第1-11页 |
| Abstract | 第11-15页 |
| 缩略词表 | 第15-16页 |
| 前言 | 第16-43页 |
| 1 EST标记的开发与应用 | 第16-30页 |
| ·EST与EST计划 | 第16-17页 |
| ·EST标记的开发策略 | 第17-24页 |
| ·EST数据的取得与前期处理 | 第17页 |
| ·EST聚类 | 第17-18页 |
| ·各类EST标记的开发 | 第18-24页 |
| ·EST标记的应用 | 第24-29页 |
| ·EST标记在比较基因组学研究中的应用 | 第24-29页 |
| ·EST在基因功能研究中的应用 | 第29页 |
| ·EST标记的问题与展望 | 第29-30页 |
| 2 植物遗传连锁图谱的构建 | 第30-38页 |
| ·DNA分子标记技术 | 第30-33页 |
| ·主要DNA分子标记的类型 | 第30-31页 |
| ·棉花DNA分子标记研究 | 第31-33页 |
| ·遗传作图群体 | 第33-34页 |
| ·非固定性分离群体与固定性(永久性)分离群体 | 第33页 |
| ·初级作图群体与次级作图群体 | 第33-34页 |
| ·遗传连锁图谱构建的理论基础 | 第34-35页 |
| ·棉花遗传连锁图谱构建研究进展 | 第35-38页 |
| 3 植物数量性状位点(QTL)定位研究 | 第38-43页 |
| ·数量性状位点(QTL)定位原理及方法 | 第38-41页 |
| ·单标记法(One Marker Analysis) | 第39页 |
| ·区间作图法(Interval Mapping) | 第39-40页 |
| ·复合区间作图法(Composite Interval Mapping) | 第40-41页 |
| ·棉花QTL定位研究进展 | 第41-43页 |
| 第一章 海岛棉EST-SSR引物的开发与应用研究 | 第43-67页 |
| 1 材料和方法 | 第44-48页 |
| ·EST的来源和序列的组装 | 第44页 |
| ·EST-SSR位点的搜寻 | 第44页 |
| ·EST-SSR引物设计 | 第44-45页 |
| ·EST-SSR功能注释 | 第45页 |
| ·EST-SSR多态性评价 | 第45-48页 |
| ·试验材料 | 第45-47页 |
| ·DNA抽提 | 第47页 |
| ·PCR扩增,电泳和DNA条带记录 | 第47页 |
| ·数据处理 | 第47-48页 |
| 2 结果 | 第48-60页 |
| ·EST-SSR引物的特征 | 第48-51页 |
| ·EST-SSR的发生频率 | 第48页 |
| ·EST-SSR重复基序长度(核苷酸数)的分布 | 第48-49页 |
| ·EST-SSR不同重复基序类型的分布 | 第49-50页 |
| ·EST-SSR各种长度的基序不同重复次数的分布 | 第50页 |
| ·EST-SSR位点序列长度的分布 | 第50-51页 |
| ·EST-SSR引物的功能注释 | 第51页 |
| ·EST-SSR引物的扩增效率 | 第51-52页 |
| ·EST-SSR引物的可转移性 | 第52-55页 |
| ·EST-SSR的特征参数 | 第55页 |
| ·EST-SSR引物的PIC值 | 第55页 |
| ·遗传相似系数分析和系统聚类分析 | 第55-57页 |
| ·主坐标(PCO)分析 | 第57-58页 |
| ·遗传作图 | 第58-60页 |
| 3 讨论 | 第60-65页 |
| ·EST-SSR的特征 | 第60-62页 |
| ·EST-SSR引物的扩增效率及多态性率 | 第62-63页 |
| ·非特异性扩增的EST-SSR引物对 | 第63页 |
| ·EST-SSR引物的多态性信息含量(PIC值) | 第63-64页 |
| ·聚类分析与主坐标分析 | 第64页 |
| ·EST-SSR作图 | 第64-65页 |
| 4 小结 | 第65-67页 |
| 第二章 海陆棉种间BC_1群体的高密度遗传连锁图谱构建与QTL定位 | 第67-99页 |
| 1 材料与方法 | 第68-71页 |
| ·供试材料 | 第68页 |
| ·田间试验与性状考查 | 第68-69页 |
| ·田间种植 | 第68页 |
| ·性状考查 | 第68-69页 |
| ·标记基因型的分析 | 第69-70页 |
| ·棉花总DNA提取与纯化 | 第69页 |
| ·标记基因型分析 | 第69-70页 |
| ·数据分析 | 第70-71页 |
| ·遗传连锁图谱构建 | 第70页 |
| ·EST-SSR标记特征分析 | 第70-71页 |
| ·正态分布检验,相关分析及QTL检测 | 第71页 |
| 2 结果与分析 | 第71-93页 |
| ·双亲及F_1的性状表现与比较 | 第71-72页 |
| ·BC_1F_2家系重复间的纤维品质性状的方差分析与比较 | 第72-73页 |
| ·BC_1单株和BC_1F_2家系的纤维品质各性状的表现 | 第73-75页 |
| ·纤维品质性状的世代间的相关性分析 | 第75-76页 |
| ·纤维品质性状间的相关性分析 | 第76页 |
| ·亲本间的SSR分子标记多态性 | 第76-78页 |
| ·遗传连锁图谱的特征分析 | 第78-81页 |
| ·EST-SSR标记特征分析 | 第81-83页 |
| ·数量性状位点(QTL)的检测 | 第83-93页 |
| 3 讨论 | 第93-98页 |
| ·关于作图群体 | 第93页 |
| ·关于作图标记类型的选择 | 第93-94页 |
| ·关于本研究中的偏分离标记 | 第94-95页 |
| ·关于EST-SSR标记的多态性 | 第95-96页 |
| ·关于本研究的QTL作图结果 | 第96-98页 |
| 4 小结 | 第98-99页 |
| 参考文献 | 第99-116页 |
| 致谢 | 第116-117页 |
| 附录1.棉花DNA提取及SSR标记技术 | 第117-123页 |
| 附录2.本研究设计开发的119对EST-SSR引物的基本信息 | 第123-133页 |
| 附录3.研究生阶段发表论文情况 | 第133页 |
