| 中文摘要 | 第1-6页 |
| Abstract | 第6-8页 |
| 1 引言:复杂网络理论在系统生物学研究中的应用现状 | 第8-43页 |
| ·系统生物学 | 第9-12页 |
| ·酵母生物网络 | 第12-18页 |
| ·网络节点的静态参数 | 第18-23页 |
| ·生物网络的拓扑结构特征 | 第23-41页 |
| ·网络计算的常用软件 | 第41-43页 |
| 2 模块结构对酵母代谢网络中酶基因功能和进化的影响 | 第43-69页 |
| ·酵母代谢网络的构建 | 第44-51页 |
| ·酵母基因组中重复基因的确认 | 第51-56页 |
| ·有向酶图的网络拓扑结构特性 | 第56-60页 |
| ·网络的模块结构对中心致死法则的影响 | 第60-65页 |
| ·网络的模块结构对酶基因进化的影响 | 第65-67页 |
| ·讨论 | 第67-69页 |
| 3 蛋白复合物对酵母互作网络中蛋白功能和进化的影响 | 第69-90页 |
| ·蛋白互作网络的拓扑结构及其生物学意义 | 第70-73页 |
| ·蛋白复合物 | 第73-75页 |
| ·蛋白复合物对中心致死法则的影响 | 第75-83页 |
| ·蛋白复合物对必须蛋白同型匹配的影响 | 第83-87页 |
| ·讨论 | 第87-90页 |
| 参考文献 | 第90-97页 |
| 攻读博士学位期间参与完成的论文 | 第97-98页 |
| 致谢 | 第98-99页 |