| 1 文献综述 | 第1-37页 |
| ·赤潮与有害赤潮 | 第13-17页 |
| ·赤潮的危害 | 第13-14页 |
| ·赤潮藻 | 第14-15页 |
| ·东海原甲藻赤潮 | 第15-17页 |
| ·甲藻简介 | 第17-19页 |
| ·甲藻的分类 | 第17-18页 |
| ·甲藻属于介核生物 | 第18-19页 |
| ·甲藻兼而有之的动植物代谢途径 | 第19页 |
| ·甲藻的分子遗传学研究进展 | 第19-33页 |
| ·甲藻的表达序列标签分析 | 第19-24页 |
| ·表达序列标签分析概述 | 第19-21页 |
| ·其它藻类表达序列标签研究进展 | 第21-23页 |
| ·甲藻表达序列标签研究进展 | 第23-24页 |
| ·甲藻分子系统学研究进展 | 第24-33页 |
| ·核糖体RNA 基因及 ITS | 第25-31页 |
| ·限制性片断长度多态性分析 | 第31-32页 |
| ·线粒体基因组、质体基因组基因及其它基因作为分子标记 | 第32-33页 |
| ·研究课题的提出及立项依据 | 第33-37页 |
| ·东海原甲藻cDNA 文库的构建及EST 分析研究课题的提出 | 第34-35页 |
| ·东海原甲藻系统学研究课题的提出 | 第35-37页 |
| 2 东海原甲藻cDNA 文库的构建 | 第37-52页 |
| ·材料 | 第37-39页 |
| ·藻种培养 | 第37-38页 |
| ·藻类培养母液的配制 | 第38-39页 |
| ·试剂 | 第39页 |
| ·LB 培养基 | 第39页 |
| ·方法 | 第39-47页 |
| ·总 RNA 的提取及检测 | 第39-41页 |
| ·提取 RNA 实验用品及相关处理 | 第39-40页 |
| ·总 RNA 的提取 | 第40-41页 |
| ·总 RNA 的纯化 | 第41页 |
| ·总 RNA 的检测 | 第41页 |
| ·cDNA 的合成 | 第41-43页 |
| ·RNA 样品的预处理 | 第41-42页 |
| ·cDNA 第一条链的合成 | 第42页 |
| ·cDNA 第二条链的合成以及末端平滑化 | 第42-43页 |
| ·双链cDNA 的精制 | 第43页 |
| ·cDNA 的 PCR 扩增 | 第43-45页 |
| ·与接头的连接 | 第43-44页 |
| ·cDNA 的 PCR 扩增 | 第44页 |
| ·cDNA 的回收 | 第44-45页 |
| ·cDNA 文库的构建 | 第45-46页 |
| ·与质粒载体的连接 | 第45页 |
| ·电转化 | 第45-46页 |
| ·文库的保存 | 第46页 |
| ·重组子的筛选 | 第46-47页 |
| ·结果与讨论 | 第47-51页 |
| ·总 RNA 的提取 | 第47-48页 |
| ·cDNA 的合成与扩增 | 第48-50页 |
| ·连接及重组子的筛选 | 第50-51页 |
| ·小结 | 第51-52页 |
| 3 东海原甲藻的 EST 分析 | 第52-76页 |
| ·材料 | 第53页 |
| ·方法 | 第53-54页 |
| ·EST 的测序 | 第53页 |
| ·EST 数据处理 | 第53-54页 |
| ·EST 分组 | 第53-54页 |
| ·结果与讨论 | 第54-75页 |
| ·EST 序列的分析 | 第54-59页 |
| ·EST 的分组 | 第54-56页 |
| ·EST 数据的分析 | 第56-59页 |
| ·几种重要的功能基因 | 第59-69页 |
| ·主体蛋白 | 第59-63页 |
| ·细胞核抗体蛋白 | 第63-68页 |
| ·1，5，-二磷酸核酮糖激酶 | 第68-69页 |
| ·Caspases 与浮游植物细胞程序化死亡 | 第69-75页 |
| ·浮游植物存在细胞程序化死亡的证据 | 第69-71页 |
| ·浮游植物基因组中的caspase 同源基因 | 第71-73页 |
| ·东海原甲藻存在细胞程序化死亡过程 | 第73-75页 |
| ·小结 | 第75-76页 |
| 4 东海原甲藻线粒体细胞色素b 基因的克隆与分析 | 第76-92页 |
| ·材料 | 第76-77页 |
| ·方法 | 第77-83页 |
| ·DNA 的提取 | 第77页 |
| ·限制性切割和cassette 的连接 | 第77-78页 |
| ·DNA 的限制酶酶切反应 | 第78页 |
| ·连接反应 | 第78页 |
| ·东海原甲藻细胞色素b 基因的克隆 | 第78-83页 |
| ·东海原甲藻细胞色素b 基因的PCR 扩增 | 第78-81页 |
| ·切胶法回收PCR 扩增产物并纯化 | 第81页 |
| ·PCR 扩增片断的克隆 | 第81-83页 |
| ·克隆产物的测序与分析 | 第83页 |
| ·结果与分析 | 第83-89页 |
| ·DNA 的提取与酶切 | 第83-85页 |
| ·东海原甲藻cob 基因的PCR 扩增和克隆 | 第85页 |
| ·东海原甲藻cob 基因序列的组成及密码子的使用 | 第85-86页 |
| ·东海原甲藻与其它甲藻的cob 基因碱基和氨基酸序列的比较 | 第86-89页 |
| ·东海原甲藻与其它原甲藻cob 基因序列相比较碱基变异情况 | 第89页 |
| ·讨论 | 第89-91页 |
| ·小结 | 第91-92页 |
| 5 东海原甲藻细胞色素氧化酶亚基 I 基因的克隆与分析 | 第92-99页 |
| ·材料 | 第92页 |
| ·方法 | 第92-94页 |
| ·DNA 的提取 | 第92页 |
| ·东海原甲藻细胞色素氧化酶亚基I 基因的克隆 | 第92-94页 |
| ·东海原甲藻cox1 基因的PCR 扩增 | 第93页 |
| ·切胶法回收PCR 扩增产物并纯化 | 第93页 |
| ·PCR 扩增片断的克隆 | 第93-94页 |
| ·克隆产物的测序与分析 | 第94页 |
| ·结果与分析 | 第94-95页 |
| ·东海原甲藻coxI 基因序列 | 第94页 |
| ·东海原甲藻与其它甲藻coxI 基因的碱基和氨基酸序列的比较 | 第94-95页 |
| ·东海原甲藻与其它原甲藻coxI 基因相比较碱基变异情况 | 第95页 |
| ·讨论 | 第95-98页 |
| ·小结 | 第98-99页 |
| 6. 总结与创新点 | 第99-101页 |
| ·总结 | 第99-100页 |
| ·创新点 | 第100-101页 |
| 参考文献 | 第101-113页 |
| 在读期间发表和提交的论文 | 第113-114页 |
| 致谢 | 第114页 |
