| 中文摘要 | 第1-6页 |
| 英文摘要 | 第6-9页 |
| 缩略语表 | 第9-15页 |
| 第一章 柱形病与柱状黄杆菌 | 第15-25页 |
| 1. 柱形病和病原的发现 | 第15页 |
| 2. 病原的分离 | 第15-16页 |
| 3. 病原体的形态特征与培养特性 | 第16页 |
| 4. 柱状黄杆菌 | 第16-17页 |
| 5. 血清型 | 第17页 |
| 6. 宿主范围 | 第17页 |
| 7. 病原性 | 第17-19页 |
| 8. 感染及流行 | 第19-20页 |
| 9. 症状及病理 | 第20-21页 |
| 10. 柱形病的诊断 | 第21-22页 |
| 11. 柱形病的预防与治疗 | 第22-23页 |
| 12. 本研究的目的及内容 | 第23-25页 |
| 第二章 鱼害粘球菌是柱状黄杆菌的同物异名 | 第25-35页 |
| 1. 前言 | 第25-26页 |
| 2. 材料与方法 | 第26-27页 |
| ·基因组的提取 | 第26页 |
| ·16S rDNA 及16S-235 rDNA 片断的克隆及测序 | 第26-27页 |
| ·分子系统树 | 第27页 |
| 3. 结果 | 第27-28页 |
| 4. 讨论 | 第28-35页 |
| 第三章 柱状黄杆菌表达文库的构建及毒力相关基因的筛选 | 第35-46页 |
| 1. 前言 | 第35-36页 |
| 2. 材料、方法与结果 | 第36-42页 |
| ·柱状黄杆菌外膜蛋白的提取 | 第36页 |
| ·兔抗血清的制备及ELISA效价检测 | 第36页 |
| ·柱状黄杆菌表达文库的构建 | 第36-39页 |
| ·菌株、质粒及培养基 | 第36页 |
| ·基因组的提取及酶切 | 第36-37页 |
| ·质粒提取、酶切及去磷酸化 | 第37-39页 |
| ·连接、转化及重组率检测 | 第39页 |
| ·文库影印及筛选 | 第39-41页 |
| ·部分基因的全长克隆及序列分析 | 第41-42页 |
| 3. 讨论 | 第42-46页 |
| 第四章 滑动相关基因的克隆及功能分析 | 第46-68页 |
| 第一节 滑动相关基因gldH的克隆及功能 | 第46-64页 |
| 1. 前言 | 第46页 |
| 2. 材料与方法 | 第46-52页 |
| ·细菌、质粒及生长条件 | 第46-47页 |
| ·相关的分子生物学分析软件 | 第47-48页 |
| ·滑动基因侧翼序列的克隆 | 第48页 |
| ·蛋白表达及抗体制备 | 第48页 |
| ·细胞分相及Western-blot 分析 | 第48-50页 |
| ·△gldH突变子构建及电转化参数优化 | 第50-51页 |
| ·柱状黄杆菌野生型及突变子的菌落及菌体形态观察 | 第51页 |
| ·柱状黄杆菌野生型及突变子体外粘附能力分析 | 第51页 |
| ·柱状黄杆菌野生型及突变子几丁质消化能力比较 | 第51-52页 |
| ·柱状黄杆菌野生型及突变子滑动能力比较 | 第52页 |
| 3. 结果 | 第52-61页 |
| ·gldH及其侧翼序列分析 | 第52-55页 |
| ·GldH的亚细胞定位 | 第55-56页 |
| ·柱状黄杆菌电转化参数的优化及?gldH 突变子构建 | 第56-58页 |
| ·突变子菌落形态及细胞壁结构的变化 | 第58-59页 |
| ·突变子与野生型粘附能力的比较 | 第59-60页 |
| ·突变子与野生型对几丁质消化能力的比较 | 第60页 |
| ·突变子与野生型滑动能力的比较 | 第60-61页 |
| 4. 讨论 | 第61-64页 |
| 第二节 滑动相关基因gldJ的克隆 | 第64-68页 |
| 1. 滑动相关基因gldJ | 第64-65页 |
| 2. gldJ 的侧翼序列 | 第65页 |
| 3. gldJ 的细胞定位 | 第65-68页 |
| 第五章 藻酸盐乙酰转移酶及厌氧诱导的外膜蛋白基因的克隆 | 第68-78页 |
| 1. 前言 | 第68-69页 |
| 2. 材料与方法 | 第69-71页 |
| ·AniA 及 AlgI 基因克隆 | 第69页 |
| ·通过Real-Time PCR分析不同氧条件下aniA基因表达 | 第69-71页 |
| ·总RNA的提取及纯化 | 第69-70页 |
| ·cDNA的合成 | 第70页 |
| ·aniA在不同氧条件下的瞬时表达分析 | 第70-71页 |
| 3. 结果 | 第71-76页 |
| ·AlgI 结构分析 | 第71-73页 |
| ·AniA 结构分析 | 第73-75页 |
| ·不同氧条件下aniA表达差异比较 | 第75-76页 |
| 4. 讨论 | 第76-78页 |
| 第六章 蛋白酶类基因的克隆 | 第78-102页 |
| 第一节 膜相关的锌金属蛋白酶及脯氨酸寡肽酶基因的克隆 | 第78-89页 |
| 1. 前言 | 第78-79页 |
| 2. 材料与方法 | 第79页 |
| 3. 结果 | 第79-87页 |
| ·膜相关的锌金属蛋白酶 | 第79-83页 |
| ·脯氨酸寡肽酶 | 第83-87页 |
| 4. 讨论 | 第87-89页 |
| 第二节 胶原酶及相关蛋白酶基因的克隆 | 第89-96页 |
| 1. 前言 | 第89页 |
| 2. 材料与方法 | 第89-91页 |
| ·胶原酶及相关蛋白酶基因的克隆 | 第89-90页 |
| ·重组胶原酶及相关蛋白酶基因的表达及纯化 | 第90页 |
| ·胶原酶及相关蛋白酶活性的底物明胶分析 | 第90-91页 |
| 3. 结果 | 第91-94页 |
| 4. 讨论 | 第94-96页 |
| 第三节 嗜热菌蛋白酶基因的克隆 | 第96-102页 |
| 1. 前言 | 第96-97页 |
| 2. 材料与方法 | 第97页 |
| 3. 结果与讨论 | 第97-102页 |
| 第七章 硫酸软骨素AC裂解酶基因的克隆及其功能分析 | 第102-114页 |
| 1. 前言 | 第102页 |
| 2. 材料与方法 | 第102-105页 |
| ·硫酸软骨素AC裂解酶基因clsA的全长克隆 | 第102-104页 |
| ·clsA 的表达及纯化 | 第104页 |
| ·柱状黄杆菌外周质中硫酸软骨素酶的提取 | 第104-105页 |
| ·rChonAC与天然硫酸软骨素AC裂解酶的活性比较 | 第105页 |
| 3. 结果 | 第105-111页 |
| ·clsA 的克隆及序列分析 | 第105-109页 |
| ·clsA基因在E.coli 中的表达 | 第109-110页 |
| ·rChonAC 的活性分析 | 第110-111页 |
| 4. 讨论 | 第111-114页 |
| 第八章 鳜胸腺和头肾的发生 | 第114-141页 |
| 第一节 鳜胸腺的发生与细胞学观察 | 第114-136页 |
| 1. 前言 | 第114-115页 |
| 2. 材料与方法 | 第115-116页 |
| ·实验鱼 | 第115页 |
| ·光镜观察样品的制备 | 第115-116页 |
| ·透射电镜样品的制备 | 第116页 |
| ·扫描电镜样品的制备 | 第116页 |
| 3. 结果 | 第116-118页 |
| ·胸腺的发育 | 第116-117页 |
| ·成鱼胸腺的光镜和电镜观察 | 第117-118页 |
| ·胸腺上皮细胞 | 第117-118页 |
| ·粒细胞及巨噬细胞 | 第118页 |
| ·囊细胞及其它细胞成分 | 第118页 |
| ·血-胸腺屏障 | 第118页 |
| ·鳜胸腺的小孔观察 | 第118页 |
| 4. 讨论 | 第118-136页 |
| 第二节 鳜头肾的组织发生研究 | 第136-141页 |
| 1. 前言 | 第136页 |
| 2. 材料与方法 | 第136-137页 |
| 3. 结果 | 第137页 |
| 4. 讨论 | 第137-141页 |
| 参考文献 | 第141-166页 |
| 攻读博士学位期间发表论文目录 | 第166-167页 |
| 致谢 | 第167-168页 |
