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应用DNA微阵列技术对洛克沙砷处理肉鸡后肝脏和胸肌组织基因表达谱的研究

摘要第1-10页
ABSTRACT第10-12页
缩略词语表第12-13页
第一章 文献综述Ⅰ第13-32页
   ·DNA芯片的研究进展第13-32页
     ·引言第13页
     ·什么是DNA芯片?第13-14页
     ·DNA芯片的产生背景第14-16页
     ·基因芯片的分类第16-17页
     ·芯片的制备第17-21页
     ·芯片的交联第21-22页
     ·杂交及杂交信号的检测第22-24页
     ·芯片的分析第24-28页
     ·DNA芯片的应用第28-30页
     ·DNA芯片应用研究的意义第30-31页
     ·DNA芯片技术存在的问题及展望第31-32页
文献综述Ⅱ第32-39页
   ·洛克沙砷的研究进展第32-39页
     ·引言第32页
     ·洛克沙砷的理化性质第32-33页
     ·洛克沙砷的应用研究第33页
     ·砷制剂作用机理的研究第33-34页
     ·砷残留的研究第34-35页
     ·对砷污染的研究第35页
     ·砷毒性的研究第35-36页
     ·研究洛克沙砷的重要性第36-37页
     ·结语第37-39页
第二章 材料与方法第39-57页
   ·饲养试验材料第39页
   ·肉鸡饲养试验设计第39-40页
   ·DNA芯片实验流程和实验设计第40-41页
     ·DNA芯片主要的技术流程第40-41页
     ·DNA芯片实验设计第41页
   ·DNA芯片实验主要试剂与仪器第41-42页
   ·DNA芯片实验方法第42-57页
     ·PCR扩增和纯化第42-44页
     ·多聚赖氨酸片基的包被和封闭第44-46页
     ·TRIZOL试剂盒提取总RNA第46页
     ·探针标记(直接标记法)第46-48页
     ·探针标记(间接标记法)第48-51页
     ·标记cDNA探针的定量第51页
     ·芯片的杂交第51-54页
     ·芯片的扫描第54页
     ·QuantArray图像分析及原始数据的导出和数据标准化处理第54-57页
第三章 结果与分析第57-108页
   ·文库数据的分析整理和基因的PCR扩增第57-64页
     ·cDNA文库的测序和测序数据的分析第57页
     ·文库的整理第57-58页
     ·文库质量的鉴定第58-59页
     ·克隆的挑选第59页
     ·基因的PCR扩增第59页
     ·克隆PCR扩增产物的纯化第59-60页
     ·对照基因的扩增和分析第60-62页
     ·讨论第62-64页
   ·肉鸡试验结果与分析第64-71页
     ·体重增重结果分析第64-65页
     ·体重净增重结果分析第65-66页
     ·饲料转化效率分析第66页
     ·各组鸡的胸肌对比第66-67页
     ·组织切片分析第67页
     ·饲料及肝脏和胸肌组织总砷含量的测定第67-69页
     ·讨论第69-71页
   ·芯片制备条件的优化第71-81页
     ·点样液的选择第71-72页
     ·芯片片基的选择第72-74页
     ·芯片点样条件的优化第74-75页
     ·点样后芯片的处理第75页
     ·探针的标记第75-77页
     ·芯片杂交及杂交后的处理第77页
     ·芯片的扫描第77页
     ·芯片最终的操作条件第77-80页
     ·讨论第80-81页
   ·芯片分析第81-108页
     ·DNA芯片的信号强度分析第81-82页
     ·芯片数据的标准化第82页
     ·基因的聚类和表达分析第82-91页
     ·基因的初步筛选第91-95页
     ·45mg/kg组差异基因的分析第95-105页
     ·讨论第105-108页
第四章 结论第108-109页
主要参考文献第109-115页
附录A 芯片易出现的问题及解决方案第115-118页
附录B 各种对照在GENBANK中的比对结果第118-124页
附录C 砷含量检测数据第124-126页
附录D 差异基因初步统计结果第126-132页
作者简历第132-133页
致谢第133页

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