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生物芯片图象分析方法的研究与应用

致谢第1-4页
摘要第4-5页
ABSTRACT第5-6页
目录第6-8页
第一章 绪论第8-20页
   ·引言第8页
   ·生物芯片概述第8-11页
     ·基因芯片第9-10页
     ·蛋白质芯片第10-11页
     ·蛋白质芯片与基因芯片的对比第11页
   ·生物芯片的扫描与成像第11-16页
     ·生物芯片的杂交信号检测第11-13页
     ·激光共聚焦生物芯片扫描仪的成像原理第13页
     ·激光共聚焦生物芯片扫描仪的性能与技术指标第13-16页
   ·生物芯片图象的处理与数据分析第16-18页
     ·样品点的定位第16-17页
     ·图象分割第17-18页
     ·数据提取和生物学分析第18页
   ·研究目标和任务第18-20页
     ·生物芯片图象分析的关键问题第18-19页
     ·目标和任务第19-20页
第二章 生物芯片图象样品点阵列的定位第20-38页
   ·引言第20-21页
   ·定位参数的确定第21-22页
   ·基于投影的生物芯片图象样品点阵列自动定位算法第22-27页
     ·用投影法对样品点进行寻址第23-25页
     ·实验结果第25-27页
     ·讨论第27页
   ·生物芯片图象的自动倾斜校正算法第27-37页
     ·进行图象倾斜校正的必要性第27-28页
     ·运用能量谱密度实现图象的自动倾斜校正第28-32页
       ·图象相关性和能量谱的概念第29页
       ·生物芯片图象的自动倾斜校正算法第29-30页
       ·实验结果第30-32页
     ·自动倾斜校正改进算法第32-37页
       ·原有校正方法的不足第32-33页
       ·对倾斜校正算法的改进第33-36页
       ·实验结果第36-37页
   ·小结第37-38页
第三章 生物芯片的图象分割第38-45页
   ·引言第38-39页
   ·生物芯片的图象分割方法概述第39-41页
     ·固定圆形分割法第39页
     ·自适应圆形分割法第39-40页
     ·自适应形状分割法第40页
     ·直方图分割法第40-41页
   ·结合邻域搜索的自适应圆形分割算法第41-44页
     ·分割过程第41-43页
       ·样品点位置的精确定位第42页
       ·样品点大小的调整第42-43页
     ·实验结果第43-44页
   ·小结第44-45页
第四章 生物芯片图象的数据提取与分析第45-54页
   ·引言第45页
   ·生物芯片图象的数据提取第45-47页
     ·背景光密度值的确定第45-46页
     ·样品点信号光密度值的确定第46-47页
     ·实验结果第47页
   ·生物芯片图象的数据分析第47-51页
     ·丙型肝炎病毒检测芯片(HCV)的数据分析第48-49页
     ·人类白细胞抗原芯片(HLA-DRB1)的数据分析第49-51页
     ·实验结果第51页
   ·小结第51-54页
第五章 生物芯片图象自动分析软件的设计与实现第54-63页
   ·引言第54页
   ·基于PC机的自动分析工作站设计与实现第54-60页
     ·软件整体框架设计第55-56页
     ·软件模块设计与实现第56-60页
       ·图象显示模块第56-57页
       ·图象分析模块第57-59页
       ·数据处理模块第59页
       ·结果输出模块第59-60页
   ·基于嵌入式系统的自动分析软件设计与实现第60-62页
     ·软件整体框架设计第60-61页
     ·图象分析模块设计与实现第61-62页
   ·小结第62-63页
第六章 总结与展望第63-66页
   ·总结第63-65页
     ·生物芯片图象分析方法的特点第63-64页
     ·生物芯片图象分析方法的性能评价第64-65页
       ·性能评价因素第64页
       ·评估结果第64-65页
   ·展望第65-66页
参考文献第66-70页
作者在攻读硕士学位期间完成的科研成果第70页

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