| 摘要 | 第1-8页 |
| ABSTRACT | 第8-10页 |
| 第1章 文献综述 | 第10-20页 |
| ·基因组与DNA测序技术发展概述 | 第10-14页 |
| ·微生物基因组学发展与现状 | 第14-15页 |
| ·微生物基因组的起步与发展 | 第14页 |
| ·微生物基因组研究现状 | 第14-15页 |
| ·类芽孢杆菌及其基因组研究概况 | 第15-20页 |
| ·类芽孢杆菌生物学特性 | 第15-16页 |
| ·类芽孢杆菌产生的活性物质及应用 | 第16-17页 |
| ·类芽孢杆菌的基因组状况 | 第17-20页 |
| 第2章 引言 | 第20-22页 |
| 第3章 类芽孢杆菌ALOE-11全基因组序列的测定 | 第22-38页 |
| ·材料 | 第22页 |
| ·菌株 | 第22页 |
| ·主要试剂及配制 | 第22页 |
| ·主要仪器与设备 | 第22页 |
| ·主要软件与数据库 | 第22页 |
| ·方法 | 第22-23页 |
| ·基因组的提取 | 第22页 |
| ·基因组测序 | 第22页 |
| ·基因组拼接组装 | 第22页 |
| ·基因组补空 | 第22-23页 |
| ·基因注释 | 第23页 |
| ·代谢途径分析 | 第23页 |
| ·双组分调节系统 | 第23页 |
| ·非核糖体合成酶的鉴定 | 第23页 |
| ·转录因子 | 第23页 |
| ·基因岛与基因水平转移 | 第23页 |
| ·结果 | 第23-33页 |
| ·基因组基本特性 | 第23-25页 |
| ·基本代谢 | 第25-28页 |
| ·NRPS与抗生素产生 | 第28-30页 |
| ·转运蛋白 | 第30页 |
| ·组分调节元件 | 第30页 |
| ·转录与翻译 | 第30-31页 |
| ·基因岛与基因水平转移 | 第31页 |
| ·运动与趋化 | 第31-33页 |
| ·分析与讨论 | 第33-38页 |
| ·基因组测序与组装 | 第33-34页 |
| ·代谢与转运 | 第34-35页 |
| ·潜在的应用价值 | 第35-38页 |
| 第4章 类芽孢杆菌ALOE-11的比较基因组学分析 | 第38-44页 |
| ·材料 | 第38页 |
| ·方法 | 第38页 |
| ·基因组功能比较 | 第38页 |
| ·直系同源蛋白的鉴定 | 第38页 |
| ·其它 | 第38页 |
| ·结果 | 第38-42页 |
| ·基因组功能比较 | 第38-42页 |
| ·基因组结构 | 第42页 |
| ·分析与讨论 | 第42-44页 |
| 第5章 结论 | 第44-46页 |
| 参与文献 | 第46-58页 |
| 附录 | 第58-66页 |
| 致谢 | 第66-68页 |
| 攻读学位期间发表论文情况 | 第68页 |