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蛋白激酶抑制剂的筛选与活性化合物的分子药理学研究

目录第1-10页
英文缩略语第10-13页
摘要第13-15页
ABSTRACT第15-17页
前言第17-19页
第一部分 PLK1、AURORAA和AURORAC的表达及纯化第19-71页
 1.实验材料第19-25页
   ·菌种第19页
   ·细胞株第19页
   ·质粒第19-20页
   ·培养基第20页
     ·E coli培养基第20页
     ·Hela培养基第20页
   ·工具酶第20页
   ·抗生素第20-21页
   ·常用试剂盒第21页
   ·常用试剂第21-24页
     ·琼脂糖凝胶电泳试剂第21页
     ·SDS-PAGE试剂第21-22页
     ·细胞消化传代使用液第22页
     ·Western Blot试剂第22-23页
     ·蛋白纯化相关溶液第23页
     ·激酶活性检测相关溶液第23页
     ·其他试剂第23-24页
   ·主要实验仪器第24-25页
 2.实验方法第25-46页
   ·人Hela细胞复苏第25页
   ·人Hela细胞传代培养第25页
   ·人Hela细胞冻存第25-26页
   ·人Hela细胞总RNA的提取(Trizol)第26-27页
     ·用Trizol试剂(Invitrogen)进行细胞总RNA的提取第26页
     ·总RNA的琼脂糖凝胶电泳第26页
     ·RNA浓度测定第26-27页
   ·RT-PCR(Invitrogen)第27页
   ·引物设计第27-28页
   ·最适PCR温度的摸索第28-29页
   ·PCR产物琼脂糖凝胶电泳,切胶回收第29-30页
     ·琼脂糖凝胶电泳第29页
     ·PCR产物的纯化回收(PCR产物纯化试剂盒)第29页
     ·DNA浓度及纯度检测第29-30页
   ·PCR产物末端加A反应第30页
   ·重组克隆质粒的构建及验证第30-33页
     ·PCR产物与克隆载体pMD-18T(Takara)载体连接第30页
     ·E.coli DH5α/BL21感受态细胞的制备第30-31页
     ·重组克隆质粒转化E.coliDH5α感受态细胞第31页
     ·重组克隆质粒的验证第31-33页
   ·重组表达质粒的构建及验证第33-35页
     ·表达载体和重组克隆质粒分别双酶切第33-34页
     ·回收凝胶中的DNA片段(DNA纯化回收试剂盒)第34页
     ·基因片断和表达载体的连接第34页
     ·基因片断和表达载体连接产物转化E.coli DH5α感受态细胞第34-35页
     ·基因与表达载体连接产物检测第35页
   ·蛋白的诱导表达第35-37页
     ·重组表达质粒转化E.coli BL21(DE3溶原菌)第35-36页
     ·宿主菌的保存第36页
     ·接种冻存培养菌第36页
     ·诱导培养物的光密度分析第36页
     ·含有重组表达质粒的E.coli BL21的生长第36页
     ·含有重组表达质粒的E.coli BL21的诱导第36-37页
     ·含有重组表达质粒的E.coli BL2的诱导优化第37页
   ·SDS-PAGE第37-40页
     ·对照组样品处理第37-38页
     ·IPTG诱导组样品处理第38页
     ·制胶、上样和电泳第38-40页
   ·Western-blot分析第40页
   ·纯化蛋白第40-43页
     ·柱的预处理(column preparation)第41-42页
     ·样品的预处理(sample preparation)第42页
     ·使用(A|¨)KTA prime系统纯化蛋白第42-43页
     ·收集含有目的蛋白的洗脱液,蒸馏水进行透析,然后冷冻干燥保存第43页
   ·纯化蛋白定量第43页
   ·纯化蛋白酶活测定第43-44页
   ·抑制剂筛选体系的建立第44-46页
     ·系统优化第44-46页
 3.结果和分析第46-67页
   ·重组表达质粒构建流程图第46页
   ·人Hela细胞总RNA的提取及浓度测定第46-47页
   ·Aurora A、Aurora C和PLK1基因片段的克隆第47页
   ·重组克隆质粒的构建及验证第47-58页
     ·PCR验证第47-48页
     ·双酶切验证第48页
     ·测序验证第48-58页
   ·表达质粒的构建和验证第58-64页
     ·PCR验证第58-59页
     ·双酶切验证第59页
     ·测序验证第59-64页
   ·SDS-PAGE分析蛋白诱导表达结果第64-65页
     ·全蛋白SDS-PAGE第64页
     ·诱导蛋白的可溶性分析第64-65页
   ·Western-blot结果第65页
   ·表达蛋白的纯度分析第65-66页
   ·纯化蛋白的浓度测定第66-67页
 4.讨论第67-70页
 5.结论第70-71页
第二部分 PLK1激酶抑制剂的筛选和活性验证第71-103页
 1.实验材料第71-75页
   ·菌株第71页
   ·细胞株第71页
   ·培养基第71-72页
   ·试剂盒第72页
   ·抗体第72页
   ·试剂第72-74页
     ·激酶活性分析试剂第72-73页
     ·细胞消化传代使用液第73页
     ·细胞周期及凋亡检测试剂第73页
     ·细胞增殖抑制实验试剂第73-74页
     ·检测Cyclin B1蛋白含量试剂第74页
   ·其他主要材料第74页
   ·主要仪器设备第74页
   ·分子对接第74-75页
 2.实验方法第75-83页
   ·PLK1抑制剂的筛选第75-76页
     ·酵母CDC5和人类PLK1保守区域序列比对第75页
     ·筛选模型第75页
     ·化合物的稀释第75页
     ·筛选方法第75-76页
     ·筛选结果判断第76页
   ·MIC的确定第76-77页
   ·初筛阳性化合物对PLK1抑制作用的生化分析方法第77-78页
     ·利用生化分析方法测定阳性化合物对PLK1作用第77页
     ·阳性化合物对PLK1激酶活性抑制方式的探讨第77-78页
   ·MTT法检测阳性化合物及其衍生物对肿瘤细胞增殖的抑制作用第78页
     ·阳性化合物及其衍生物对A549细胞增殖的抑制作用第78页
     ·阳性化合物对BEL-7402和HepG2细胞的增殖抑制作用第78页
   ·流式细胞仪检测阳性化合物对肿瘤细胞周期的影响第78-79页
   ·染色法检测细胞凋亡第79-80页
     ·Annexin V-FITC/PI双染检测细胞凋亡第79页
     ·Hochest 33342染色检测细胞凋亡第79-80页
   ·流式细胞仪检测Cyclin B1蛋白含量第80页
   ·阳性化合物与PLK1活性位点对接第80-83页
     ·蛋白结构调出第80页
     ·蛋白3D模型优化第80-81页
     ·确定活性位点第81-82页
     ·阳性化合物与PLK1活性位点对接第82-83页
 3.实验结果第83-98页
   ·酵母CDC5与人类PLK1激酶保守区域序列比对第83页
   ·酵母模型筛选结果第83-84页
   ·阳性化合物DH166 MIC的测定第84页
   ·阳性化合物DH166抑制纯化的重组PLK1激酶第84-86页
     ·阳性化合物DH166抑制体外纯化的PLK1的激酶活性第84-85页
     ·阳性化合物DH166竞争性抑制纯化的PLK1激酶的活性第85-86页
   ·阳性化合物DH166抑制肿瘤细胞的增殖第86-87页
   ·阳性化合物DH166影响肿瘤细胞的细胞周期第87-89页
   ·阳性化合物DH166能诱导酵母细胞的周期阻滞第89-90页
   ·阳性化合物DH166能诱导A549细胞凋亡第90-92页
     ·Annexin V-FITC/PI双染法检测第90-91页
     ·Hochest 33342染色法检测第91-92页
   ·DH166导致A549细胞内Cyclin B1的积累第92-94页
   ·阳性化合物DH166与PLK1的分子对接第94-96页
     ·PLK1 3D结构的获取和活性位点分析第94-95页
     ·阳性化合物DH166与PLK1活性位点对接结果第95-96页
   ·阳性化合物DH166同系物对A549及酵母细胞的增殖具抑制作用第96-98页
 4.讨论第98-102页
   ·模式生物-酵母第98-99页
   ·蛋白激酶在抗癌药物研究中的应用第99-100页
   ·β-咔啉碱类化合物的抗肿瘤研究第100-101页
   ·多元药理学第101-102页
 5.结论第102-103页
参考文献第103-109页
综述一 保罗样激酶1(PLK1)研究进展第109-129页
 1.染色体上的定位第110页
 2.蛋白结构特点第110-111页
   ·催化结构域第110页
   ·PBD结构域第110-111页
 3.蛋白表达量的变化及调节第111-113页
   ·转录水平上的调控第111-112页
   ·翻译后修饰第112页
   ·泛素-蛋白酶体通路降解第112页
   ·蛋白之间的相互作用第112-113页
 4.功能总述第113-117页
   ·G2/M期转化第113-114页
   ·DNA损伤检验点及检验点造成的阻滞后细胞周期的再启动第114-115页
   ·参与中心体成熟以及纺锤丝形成过程第115-116页
   ·高尔基体的解体第116页
   ·姐妹染色单体的分离第116页
   ·胞质分裂和有丝分裂的退出第116-117页
 5.与癌症的关系第117-118页
 6.以PLK1为靶点的治疗方法第118-122页
   ·基因操作第118-119页
     ·反义寡核苷酸(ASO)第118页
     ·小RNA干扰(siRNA)第118-119页
     ·抗体注射技术第119页
     ·显性抑制技术第119页
   ·小分子抑制剂第119-122页
     ·ATP竞争型抑制剂第120-121页
     ·非ATP竞争型抑制剂第121-122页
 7.结语第122-123页
 参考文献第123-129页
综述二 极光激酶A、C研究进展第129-158页
 1.家族成员第129-130页
 2.基因概述第130页
 3.蛋白结构第130-131页
 4.定位第131页
 5.激酶活性的调节第131-134页
   ·Aurora A转录水平的调节第132页
   ·激活第132页
     ·Ajuba介导的Aurora A活化第132页
     ·TPX2介导的Aurora A活化第132页
     ·I-2介导的Aurora A活化第132页
   ·抑制第132-133页
   ·降解第133-134页
     ·APC/C-CDH1介导的降解第133页
     ·AIP介导的降解第133-134页
 6.功能第134-137页
   ·Aurora A的功能(图4)第134-136页
     ·G2/M期转换第134页
     ·中心体成熟和分离第134-135页
     ·双极纺锤体的组装第135页
     ·胞质分裂第135-136页
     ·抑癌基因p53第136页
     ·端粒酶活性第136页
   ·Aurora C的功能第136-137页
 7.与癌症的关系第137-138页
 8.以AURORAA为靶点的抗肿瘤药物第138-144页
   ·Azaindoles第139页
   ·MLN8054第139页
   ·咪唑并吡啶类第139-140页
   ·五元杂环并吡唑类第140-141页
   ·单嘧啶环类第141页
   ·嘧啶氨基喹啉类第141-142页
   ·喹唑啉类第142页
   ·苯氨基喹唑啉类第142页
   ·嘧啶和吡啶氨基喹唑啉类第142-144页
   ·五元杂环氨基喹唑啉类第144页
 9.结语第144-145页
 参考文献第145-158页
致谢第158页

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