| 摘要 | 第1-8页 |
| ABSTRACT | 第8-12页 |
| 第一章 绪论 | 第12-32页 |
| ·研究背景 | 第12-18页 |
| ·研究方法 | 第18-30页 |
| ·论文研究目的和研究内容 | 第30-32页 |
| 第二章 配体与平行型DNA G-四链体沟槽相互作用的理论研究 | 第32-44页 |
| ·引言 | 第32-34页 |
| ·计算方法 | 第34-35页 |
| ·分子模建 | 第34页 |
| ·配体模型的力场参数 #(23) | 第34页 |
| ·分子动力学模拟 | 第34-35页 |
| ·量子化学计算 | 第35页 |
| ·结果与讨论 | 第35-43页 |
| ·Dist-A二聚体与[d(TGGGGT)]_4序列G-四链体的动力学模拟 | 第35-37页 |
| ·Dist-A二聚体与[d(GGGGGG)]_4序列G-四链体复合物的动力学模拟 | 第37-40页 |
| ·三层连续G-四集体鸟嘌呤碱基的电子性质 | 第40-42页 |
| ·基于平行型DNA G-四链体沟槽的药物设计 | 第42-43页 |
| 本章小结 | 第43-44页 |
| 第三章 Dist-A及其衍生物与反平行型DNA G-四链体相互作用的分子动力学研究 | 第44-65页 |
| ·引言 | 第44-46页 |
| ·计算方法 | 第46-48页 |
| ·分子模建 | 第46页 |
| ·分子对接 | 第46页 |
| ·分子动力学模拟 | 第46-47页 |
| ·MM_GBSA能量计算 | 第47-48页 |
| ·结果与讨论 | 第48-64页 |
| ·分子对接 | 第48-49页 |
| ·动力学模拟体系 | 第49-50页 |
| ·Dist-A及其衍生物B在反平行型端粒DNA G-四链体宽沟槽方向上的动力学行为 | 第50-53页 |
| ·Dist-A及其衍生物B在反平行型端粒DNA G-四链体中沟槽方向上的动力学行为 | 第53-56页 |
| ·Dist-A及其衍生物B在反平行型端粒DNA G-四链体窄沟槽方向上的动力学行为 | 第56-60页 |
| ·配体在不同位点的结合对沟槽宽度的影响 | 第60-61页 |
| ·MM_GBSA能量分析 | 第61-63页 |
| ·基于反平行DNA G-四链体沟槽的药物设计 | 第63-64页 |
| 本章小结 | 第64-65页 |
| 第四章 类固醇衍生物选择性识别端粒DNA G-四链体/B-DNA的分子动力学研究 | 第65-77页 |
| ·引言 | 第65-66页 |
| ·计算方法 | 第66-68页 |
| ·分子模建 | 第66页 |
| ·分子对接 | 第66页 |
| ·分子动力学模拟 | 第66-67页 |
| ·MM_PBSA能量计算 | 第67-68页 |
| ·结果与讨论 | 第68-76页 |
| ·分子对接的初始位点 | 第68-69页 |
| ·Steroid FG与杂化型端粒DNA G-四链体复合物动力学模拟 | 第69-71页 |
| ·Steroid FG与B-DNA复合物动力学模拟 | 第71-73页 |
| ·MM_PBSA能量计算 | 第73-74页 |
| ·基于DNA G-四链体沟槽的药物设计 | 第74-76页 |
| 本章小结 | 第76-77页 |
| 第五章 4-苄基哌啶类拮抗剂选择性识别hCCR3的分子模拟研究 | 第77-92页 |
| ·引言 | 第77-82页 |
| ·计算方法 | 第82-83页 |
| ·多重序列比对 | 第82页 |
| ·配体支持同源模建 | 第82-83页 |
| ·拮抗剂对接 | 第83页 |
| ·结果与讨论 | 第83-91页 |
| ·拮抗剂键合模型的建立 | 第83-85页 |
| ·hCCR3活性位点的验证 | 第85-87页 |
| ·拮抗剂对hCCR3的选择性 | 第87-91页 |
| 本章小结 | 第91-92页 |
| 全文总结 | 第92-93页 |
| 创新点与展望 | 第93-94页 |
| 参考文献 | 第94-116页 |
| 致谢 | 第116-117页 |
| 附录 (攻读学位期间发表论文目录) | 第117页 |
