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猪PGM1基因的序列、表达谱及多态性分析

摘要第1-11页
ABSTRACT第11-13页
缩略语表第13-14页
缩略语表(续表)第14-15页
1 文献综述第15-29页
   ·引言第15页
   ·猪分子育种研究现状第15-19页
     ·分子遗传标记第16-17页
     ·MAS和MAI的应用第17-18页
     ·转基因育种第18-19页
   ·高通量筛选差异基因技术的应用第19-21页
     ·比较基因组学—基因芯片技术第19-20页
     ·比较蛋白质组学—双向电泳技术第20-21页
   ·PGM1及其家族基因研究进展第21-25页
     ·PGM的发现与分类第21页
     ·PGM的生化特性第21-22页
     ·PGM的序列与组织表达差异第22-23页
     ·PGM的多态性及其应用第23-25页
   ·PGM在物质代谢中的作用第25-26页
   ·PGM的调控第26-29页
     ·酶含量的调节第26-27页
     ·酶活性的调节第27-29页
2 研究的目的和意义第29-30页
3 材料与方法第30-52页
   ·试验材料第30-35页
     ·试验动物第30页
     ·试验样品第30-31页
       ·DNA样品第30页
       ·组织样品第30-31页
       ·菌种、表达载体及细胞系第31页
     ·主要仪器、设备及耗材第31-32页
     ·主要药品、试剂及溶液配置第32-35页
       ·主要药品及试剂第32-33页
       ·缓冲液和常用试剂的配置第33-35页
     ·试验方法第35-52页
     ·猪基因组DNA的提取及质量检测第35-36页
       ·血液分离白细胞第35-36页
       ·白细胞分离基因组DNA第36页
       ·DNA浓度的测定和质量检测第36页
     ·组织RNA的提取和及反转录第36-38页
       ·猪总RNA的提取—TRIZOL一步法第36-37页
       ·总RNA浓度的测定和质量检测第37-38页
       ·cDNA第一链的合成(反转录)第38页
     ·目的基因的分离与鉴定第38-42页
       ·引物设计第38页
       ·PCR反应第38-40页
       ·扩增产物的回收和纯化第40页
       ·载体连接第40-41页
       ·感受态细胞DH5α的制备第41页
       ·连接产物的转化第41页
       ·阳性克隆的鉴定和测序第41-42页
     ·SNP检测与基因分型第42-44页
       ·PCR-RFLP第42页
       ·PCR-SSCP第42-44页
     ·组织表达谱-半定量PCR第44-45页
       ·半定量PCR的原理第44页
       ·半定量PCR体系第44页
       ·半定量PCR的分析方法第44-45页
     ·实时荧光定量PCR第45-47页
       ·实时荧光定量PCR的原理第45页
       ·实时荧光定量PCR体系第45-46页
       ·实时荧光定量PCR分析方法第46-47页
     ·遗传学效应分析第47-48页
       ·群体遗传学第47-48页
       ·性状相关性分析第48页
     ·生物信息学分析第48-49页
       ·基因定位第48页
       ·cDNA序列的获取第48-49页
       ·CpG岛预测第49页
       ·多序列比对第49页
       ·寻找酶切位点第49页
       ·系统进化树分析第49页
       ·蛋白质与miRNA预测第49页
     ·载体构建与真核表达第49-52页
       ·巢式引物设计第49-50页
       ·猪PGM1基因3'-UTR的扩增第50页
       ·PCR产物及pEGFP-C1载体的双酶切第50页
       ·连接反应第50页
       ·重组真核表达载体的鉴定第50-51页
       ·重组质粒的表达第51-52页
4 结果与分析第52-63页
   ·总RNA的提取与检测第52页
   ·猪PGM1基因序列分析第52-54页
     ·猪PGM1(exon1A)基因cDNA序列第52页
     ·猪PGM1(exon1B)基因的预测第52-53页
     ·猪PGM1基因的5’端与3’端第53-54页
   ·猪PGM1基因表达谱第54-56页
     ·半定量第54页
     ·实时荧光定量第54-56页
   ·猪PGM1基因遗传效应学分析第56-59页
     ·猪PGM1基因cDNA序列酶切位点分析结果第56页
     ·猪PGM1基因分子标记检测第56-57页
     ·猪PGM1基因的SNP在不同品种间的分布第57-58页
     ·猪PGM1基因的SNP与经济性状的相关性分析第58-59页
   ·生物信息学分析第59-61页
     ·猪PGM家族基因的定位第59-60页
     ·猪PGM1基因系统进化树第60-61页
     ·PGM1基因3'-UTR的miRNA的推测第61页
     ·PGM1蛋白在线预测第61页
   ·插入猪PGM1基因3'-UTR的载体构建及表达第61-63页
5 讨论第63-71页
   ·关于猪PGM1基因的序列分析第63-66页
     ·猪PGM1基因的核苷酸序列第63-64页
     ·猪PGM1(exon1A)基因的氨基酸序列第64-66页
   ·关于猪PGM1基因的表达谱分析第66-67页
   ·关于猪PGM1基因的遗传学效应分析第67-68页
   ·关于猪PGM1基因的3'-UTR第68-69页
     ·猪PGM1基因3'-UTR的载体构建第68页
     ·猪PGM1基因转录后调控的探讨第68-69页
   ·下一步工作第69-70页
   ·小结第70-71页
参考文献第71-76页
附录第76-82页
 附录1 猪PGM1基因cDNA及氨基酸序列第76-77页
 附录2 猪PGM1基因Exon1A和Exon1B序列第77-78页
 附录3 猪PGM组织表达谱扩增序列第78页
 附录4 SAS V 8.0-glm过程和reg过程输入程式第78-79页
 附录5 统计学计算第79-80页
 附录6 非配对试验设计两小样本均数差异显著性检验—t检验第80-81页
 附录7 卡方(χ~2)独立性检验在群体遗产学上的应用第81-82页
致谢第82页

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