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西瓜高密度遗传图谱构建及三个果实性状相关候选基因的精细定位

摘要第6-7页
abstract第7-8页
第一章 引言第16-24页
    1.1 遗传图谱的构建第16-21页
        1.1.1 遗传图谱构建原理第16页
        1.1.2 作图亲本的选择第16-17页
        1.1.3 作图群体的构建第17页
        1.1.4 分子标记的选择第17页
        1.1.5 作图软件的选择第17页
        1.1.6 西瓜遗传图谱构建的研究进展第17-21页
    1.2 西瓜QTL/基因定位研究进展第21-22页
        1.2.1 含糖量相关基因定位研究第21页
        1.2.2 果皮颜色相关基因定位研究第21-22页
        1.2.3 果肉颜色相关基因定位研究第22页
        1.2.4 果形相关基因定位研究第22页
        1.2.5 西瓜其他农艺性状基因定位第22页
    1.3 研究目的与意义第22-23页
    1.4 研究的技术路线第23-24页
第二章 西瓜高密度遗传图谱的构建第24-32页
    2.1 材料和方法第24-26页
        2.1.1 作图亲本及群体第24-25页
        2.1.2 表型鉴定第25页
        2.1.3 测序文库的构建和质量检测第25页
        2.1.4 标记分型及遗传图谱构建第25页
        2.1.5 遗传图谱质量评估第25页
        2.1.6 基于高密度遗传图谱的QTL/基因定位第25-26页
    2.2 结果与分析第26-30页
        2.2.1 重组自交系的表型鉴定第26页
        2.2.2 重测序数据评估第26页
        2.2.3 西瓜高密度遗传图谱构建第26-28页
        2.2.4 遗传图谱的共线性分析第28-29页
        2.2.5 基于西瓜遗传图谱的果实相关性状的初定位第29-30页
    2.3 讨论第30-32页
第三章 西瓜果皮颜色的遗传分析及候选基因精细定位第32-44页
    3.1 材料与方法第32-36页
        3.1.1 试验材料及群体构建第32-33页
        3.1.2 表型鉴定第33页
        3.1.3 西瓜基因组DNA提取第33页
        3.1.4 分子标记的开发第33页
        3.1.5 总RNA的提取第33-34页
        3.1.6 RNA反转录第34页
        3.1.7 PCR与实时荧光定量PCR第34-36页
        3.1.8 载体构建第36页
        3.1.9 西瓜外果皮色素的提取第36页
        3.1.10 叶绿体的超微结构观察第36页
    3.2 结果与分析第36-42页
        3.2.1 西瓜果皮颜色的遗传规律第36-37页
        3.2.2 外果皮色素含量及叶绿体超微结构观察第37-39页
        3.2.3 西瓜果皮颜色候选基因的精细定位第39-40页
        3.2.4 候选基因的序列和表达分析第40-41页
        3.2.5 自然群体中的标记验证第41-42页
    3.3 讨论第42-44页
第四章 西瓜种皮颜色的遗传分析及候选基因的精细定位第44-53页
    4.1 材料与方法第44-46页
        4.1.1 试验材料及群体构建第44页
        4.1.2 表型鉴定第44-45页
        4.1.3 西瓜基因组DNA提取第45页
        4.1.4 分子标记的开发第45页
        4.1.5 总RNA提取第45页
        4.1.6 RNA反转录第45页
        4.1.7 PCR与实时荧光定量PCR第45页
        4.1.8 载体构建第45页
        4.1.9 多酚氧化酶活性测定第45-46页
        4.1.10 种皮色素提取第46页
    4.2 结果与分析第46-51页
        4.2.1 西瓜种皮颜色的遗传规律第46-47页
        4.2.2 西瓜种皮颜色候选基因的精细定位第47-49页
        4.2.3 候选基因的序列和功能分析第49-50页
        4.2.4 候选基因在亲本中的表达差异第50页
        4.2.5 亲本种皮中多酚氧化酶活性及黑色素含量差异第50-51页
    4.3 讨论第51-53页
第五章 西瓜果实苦味的遗传分析及候选基因的精细定位第53-59页
    5.1 材料与方法第53-54页
        5.1.1 试验材料及群体构建第53页
        5.1.2 表型鉴定第53页
        5.1.3 西瓜基因组DNA提取第53页
        5.1.4 分子标记的开发第53页
        5.1.5 总RNA提取第53-54页
        5.1.6 RNA反转录第54页
        5.1.7 PCR与实时荧光定量PCR第54页
        5.1.8 载体构建第54页
    5.2 结果与分析第54-58页
        5.2.1 西瓜果实苦味的遗传规律第54页
        5.2.2 西瓜果实苦味候选基因的精细定位第54-55页
        5.2.3 候选基因的序列分析第55-56页
        5.2.4 候选基因在果实不同发育时期和不同组织中的差异表达第56-57页
        5.2.5 葫芦素E的相对含量第57-58页
    5.3 讨论第58-59页
第六章 全文结论第59-61页
    6.1 全文结论第59页
    6.2 创新点第59-60页
    6.3 下一步工作展望第60-61页
参考文献第61-69页
附录第69-74页
致谢第74-75页
作者简历第75页

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